Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1I3

Protein Details
Accession C4R1I3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-104IPPFMDRTKIKFKRKGIEGKIVGHydrophilic
243-262ISFSKRPKTERPQAARQWAHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030968  P:endoplasmic reticulum unfolded protein response  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0709  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MREIDDILQEIHDLSLNKVDLPPDTQTKFQFPSVTEEEEINDLKKQYLTPSDQIPPDLLKEFLIIPDESDQKLKFYQALVKIPPFMDRTKIKFKRKGIEGKIVGYEEALDLSGDNLTSSNSFSLHRKPAENGSSIRGQTTNLPFLPGGLVSKAVKDTESINNLLHRDDQGLFDIPLGFERGLQLEKAGDTELVDELSKLPESNEETLENQIPSGDVELLDPETLEEDAIQEGDEIDALLPSDISFSKRPKTERPQAARQWAHLVDLDHKLENFHELVPNMARTWPFELDTFQQEAIYHLEKGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYVIAMANINMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFKHDFEDIDVGLITGDVQINQEANCLIMTTEILRSMLYRGADVIRDVEFVIFDEVHYVNDIDRGVVWEEVIIMLPEHVKIVMLSATVPNTMEFASWVGRTKQKDVYVISTPKRPIPLEIFVWAKSDLFKVVDSNRNFLEKNFQAHSDVLVKPKKEVTGSQAGNRGGRGNARGASRGGRGSSSTVSSRGRGGSANVGTRFTKRDGPNKKTWTNLVQYLRSHDLLPSVIFVFSKARCEEYADSLQGVNFCTGSERSRIHMFIDKAVSRLKKEDRELPQIMKMREMLSRGIAVHHGGLLPIMKEVIEILFAKTLIKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSELRKHDGTGFRNLLPGEFTQMSGRAGRRGLDTTGTVIVMSYNEPLESKPFQQITLGVPTKLVSQFRLTYNMILNLLRIEALRVEEMIKRSFSENTTQSGLKENEKEIIELQKKIAEISQAGCQECDPAKLKEFSTAICDYTKLTGELIRLSLEIPLHRKRFRRGMLFIYTDADGFPAPAFLYDIKMSDSLFVALVFDIERCEENNTGLPYIPESPSFIKNTIPKWKFKGNFRFTTIPFNKVQYVTRFVLQVLLKSIIRMEPESIEKAEEQILQLLHFYKKFEEYNWSASLTIPQNDLYKKIQDYRKIIANAPVIQCPSLREHYIQIKDLDSLRSRLITLKSLVSDDNMTLLPDYEQRLKVLNELEFVDDHLNVVLKGRIACEINSGWELALTELLLDNFLADFDPEEIVALLSAFVYEGRTRDDEEPALTPRLEKGKAKIRDIVSHLLEIFQDKQVSLSAEEESFLEAKRFNLVNVVYEWAKGTSFSDIMKLSSEAEGTIVRVITRLDEVCREVKSAALIIGDSALHDKMSEAQEKIKRDIVFCASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.18
3 0.18
4 0.19
5 0.2
6 0.21
7 0.2
8 0.23
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.35
13 0.37
14 0.42
15 0.44
16 0.43
17 0.42
18 0.36
19 0.41
20 0.41
21 0.42
22 0.37
23 0.34
24 0.32
25 0.31
26 0.31
27 0.24
28 0.23
29 0.19
30 0.2
31 0.21
32 0.21
33 0.23
34 0.3
35 0.35
36 0.35
37 0.41
38 0.45
39 0.45
40 0.45
41 0.41
42 0.35
43 0.32
44 0.3
45 0.25
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.18
51 0.15
52 0.15
53 0.19
54 0.22
55 0.22
56 0.25
57 0.24
58 0.24
59 0.26
60 0.26
61 0.23
62 0.24
63 0.3
64 0.33
65 0.39
66 0.42
67 0.43
68 0.44
69 0.42
70 0.44
71 0.4
72 0.35
73 0.36
74 0.38
75 0.42
76 0.5
77 0.6
78 0.65
79 0.71
80 0.77
81 0.79
82 0.81
83 0.84
84 0.8
85 0.82
86 0.75
87 0.69
88 0.65
89 0.56
90 0.47
91 0.36
92 0.29
93 0.18
94 0.15
95 0.11
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.16
110 0.24
111 0.31
112 0.35
113 0.37
114 0.4
115 0.48
116 0.51
117 0.51
118 0.46
119 0.42
120 0.44
121 0.41
122 0.4
123 0.31
124 0.27
125 0.3
126 0.33
127 0.35
128 0.29
129 0.31
130 0.28
131 0.28
132 0.28
133 0.21
134 0.17
135 0.12
136 0.15
137 0.12
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.18
144 0.22
145 0.26
146 0.26
147 0.26
148 0.29
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.21
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.17
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.12
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.13
188 0.17
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.22
193 0.25
194 0.28
195 0.23
196 0.19
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.13
201 0.1
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.06
229 0.07
230 0.1
231 0.15
232 0.19
233 0.26
234 0.31
235 0.37
236 0.45
237 0.55
238 0.61
239 0.67
240 0.72
241 0.75
242 0.78
243 0.83
244 0.75
245 0.67
246 0.64
247 0.53
248 0.47
249 0.39
250 0.32
251 0.26
252 0.29
253 0.28
254 0.23
255 0.22
256 0.21
257 0.19
258 0.2
259 0.17
260 0.14
261 0.15
262 0.14
263 0.16
264 0.17
265 0.18
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.2
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.2
275 0.21
276 0.25
277 0.24
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.09
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.09
322 0.11
323 0.14
324 0.16
325 0.2
326 0.2
327 0.25
328 0.35
329 0.39
330 0.47
331 0.47
332 0.52
333 0.55
334 0.55
335 0.61
336 0.54
337 0.48
338 0.44
339 0.45
340 0.38
341 0.34
342 0.35
343 0.24
344 0.21
345 0.18
346 0.13
347 0.08
348 0.08
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.08
432 0.11
433 0.13
434 0.18
435 0.2
436 0.23
437 0.28
438 0.29
439 0.32
440 0.32
441 0.34
442 0.36
443 0.4
444 0.39
445 0.39
446 0.37
447 0.35
448 0.37
449 0.33
450 0.29
451 0.28
452 0.29
453 0.25
454 0.27
455 0.27
456 0.24
457 0.25
458 0.22
459 0.17
460 0.14
461 0.13
462 0.11
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.15
467 0.23
468 0.23
469 0.25
470 0.25
471 0.27
472 0.27
473 0.24
474 0.28
475 0.23
476 0.26
477 0.25
478 0.25
479 0.24
480 0.24
481 0.25
482 0.22
483 0.21
484 0.23
485 0.25
486 0.25
487 0.24
488 0.26
489 0.26
490 0.22
491 0.23
492 0.22
493 0.28
494 0.29
495 0.31
496 0.34
497 0.34
498 0.33
499 0.32
500 0.27
501 0.18
502 0.18
503 0.17
504 0.14
505 0.16
506 0.16
507 0.17
508 0.17
509 0.19
510 0.19
511 0.19
512 0.17
513 0.14
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.15
520 0.16
521 0.16
522 0.17
523 0.15
524 0.15
525 0.13
526 0.13
527 0.15
528 0.16
529 0.19
530 0.18
531 0.2
532 0.2
533 0.21
534 0.22
535 0.19
536 0.25
537 0.25
538 0.34
539 0.42
540 0.49
541 0.57
542 0.61
543 0.62
544 0.56
545 0.55
546 0.51
547 0.45
548 0.45
549 0.39
550 0.35
551 0.33
552 0.35
553 0.34
554 0.3
555 0.27
556 0.2
557 0.17
558 0.14
559 0.13
560 0.1
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.09
566 0.09
567 0.13
568 0.12
569 0.13
570 0.13
571 0.17
572 0.18
573 0.2
574 0.22
575 0.19
576 0.19
577 0.18
578 0.18
579 0.14
580 0.14
581 0.09
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.08
586 0.09
587 0.12
588 0.12
589 0.14
590 0.16
591 0.17
592 0.17
593 0.22
594 0.21
595 0.2
596 0.23
597 0.21
598 0.2
599 0.24
600 0.23
601 0.19
602 0.24
603 0.26
604 0.27
605 0.29
606 0.36
607 0.38
608 0.45
609 0.46
610 0.42
611 0.44
612 0.44
613 0.41
614 0.34
615 0.29
616 0.23
617 0.22
618 0.22
619 0.17
620 0.12
621 0.13
622 0.12
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.08
647 0.06
648 0.07
649 0.06
650 0.06
651 0.08
652 0.07
653 0.09
654 0.07
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.06
660 0.07
661 0.06
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.1
669 0.11
670 0.14
671 0.2
672 0.22
673 0.26
674 0.25
675 0.25
676 0.27
677 0.31
678 0.3
679 0.31
680 0.31
681 0.28
682 0.3
683 0.29
684 0.25
685 0.2
686 0.17
687 0.14
688 0.12
689 0.13
690 0.11
691 0.12
692 0.13
693 0.14
694 0.15
695 0.13
696 0.13
697 0.14
698 0.15
699 0.16
700 0.16
701 0.14
702 0.14
703 0.13
704 0.13
705 0.12
706 0.1
707 0.08
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.1
717 0.11
718 0.12
719 0.17
720 0.17
721 0.17
722 0.18
723 0.19
724 0.18
725 0.24
726 0.24
727 0.18
728 0.18
729 0.18
730 0.2
731 0.21
732 0.2
733 0.13
734 0.15
735 0.18
736 0.19
737 0.24
738 0.22
739 0.21
740 0.22
741 0.22
742 0.2
743 0.17
744 0.16
745 0.11
746 0.1
747 0.09
748 0.07
749 0.06
750 0.05
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.08
755 0.1
756 0.13
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.15
761 0.17
762 0.17
763 0.21
764 0.2
765 0.22
766 0.24
767 0.23
768 0.22
769 0.27
770 0.27
771 0.25
772 0.25
773 0.23
774 0.25
775 0.25
776 0.25
777 0.2
778 0.27
779 0.26
780 0.25
781 0.25
782 0.22
783 0.22
784 0.21
785 0.21
786 0.14
787 0.12
788 0.13
789 0.17
790 0.18
791 0.18
792 0.18
793 0.17
794 0.18
795 0.18
796 0.2
797 0.18
798 0.17
799 0.21
800 0.23
801 0.23
802 0.25
803 0.25
804 0.22
805 0.24
806 0.23
807 0.21
808 0.19
809 0.19
810 0.15
811 0.16
812 0.16
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.12
817 0.13
818 0.12
819 0.11
820 0.1
821 0.1
822 0.11
823 0.1
824 0.12
825 0.17
826 0.23
827 0.29
828 0.35
829 0.39
830 0.44
831 0.52
832 0.57
833 0.59
834 0.56
835 0.56
836 0.57
837 0.55
838 0.49
839 0.42
840 0.35
841 0.27
842 0.22
843 0.16
844 0.1
845 0.08
846 0.07
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.06
851 0.06
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.11
858 0.1
859 0.11
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.07
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.05
868 0.05
869 0.06
870 0.07
871 0.07
872 0.1
873 0.1
874 0.12
875 0.16
876 0.17
877 0.16
878 0.16
879 0.16
880 0.15
881 0.17
882 0.17
883 0.13
884 0.15
885 0.17
886 0.21
887 0.23
888 0.22
889 0.24
890 0.27
891 0.33
892 0.41
893 0.41
894 0.43
895 0.46
896 0.55
897 0.56
898 0.62
899 0.67
900 0.64
901 0.66
902 0.67
903 0.68
904 0.6
905 0.66
906 0.58
907 0.51
908 0.45
909 0.41
910 0.38
911 0.34
912 0.37
913 0.3
914 0.34
915 0.31
916 0.31
917 0.29
918 0.25
919 0.29
920 0.25
921 0.23
922 0.19
923 0.2
924 0.19
925 0.18
926 0.19
927 0.15
928 0.17
929 0.16
930 0.15
931 0.14
932 0.18
933 0.2
934 0.2
935 0.19
936 0.17
937 0.18
938 0.18
939 0.16
940 0.14
941 0.14
942 0.14
943 0.13
944 0.14
945 0.15
946 0.16
947 0.16
948 0.17
949 0.16
950 0.2
951 0.21
952 0.22
953 0.27
954 0.28
955 0.32
956 0.33
957 0.32
958 0.27
959 0.27
960 0.31
961 0.26
962 0.24
963 0.2
964 0.2
965 0.24
966 0.25
967 0.28
968 0.25
969 0.27
970 0.28
971 0.36
972 0.4
973 0.44
974 0.48
975 0.49
976 0.54
977 0.52
978 0.51
979 0.49
980 0.48
981 0.45
982 0.42
983 0.4
984 0.33
985 0.31
986 0.29
987 0.25
988 0.25
989 0.23
990 0.24
991 0.23
992 0.27
993 0.35
994 0.39
995 0.4
996 0.36
997 0.33
998 0.34
999 0.34
1000 0.33
1001 0.28
1002 0.26
1003 0.24
1004 0.23
1005 0.23
1006 0.25
1007 0.26
1008 0.25
1009 0.24
1010 0.25
1011 0.25
1012 0.25
1013 0.25
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.13
1019 0.12
1020 0.11
1021 0.11
1022 0.1
1023 0.12
1024 0.16
1025 0.19
1026 0.2
1027 0.21
1028 0.25
1029 0.25
1030 0.27
1031 0.29
1032 0.27
1033 0.23
1034 0.23
1035 0.23
1036 0.2
1037 0.21
1038 0.18
1039 0.14
1040 0.13
1041 0.11
1042 0.11
1043 0.09
1044 0.11
1045 0.11
1046 0.11
1047 0.12
1048 0.12
1049 0.15
1050 0.16
1051 0.17
1052 0.19
1053 0.19
1054 0.2
1055 0.2
1056 0.19
1057 0.15
1058 0.14
1059 0.14
1060 0.1
1061 0.1
1062 0.07
1063 0.06
1064 0.07
1065 0.07
1066 0.06
1067 0.06
1068 0.06
1069 0.05
1070 0.06
1071 0.05
1072 0.05
1073 0.06
1074 0.06
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.07
1079 0.07
1080 0.07
1081 0.06
1082 0.05
1083 0.04
1084 0.04
1085 0.04
1086 0.04
1087 0.07
1088 0.08
1089 0.09
1090 0.13
1091 0.15
1092 0.2
1093 0.22
1094 0.26
1095 0.25
1096 0.26
1097 0.29
1098 0.28
1099 0.29
1100 0.25
1101 0.24
1102 0.25
1103 0.3
1104 0.32
1105 0.33
1106 0.37
1107 0.44
1108 0.51
1109 0.55
1110 0.58
1111 0.55
1112 0.58
1113 0.59
1114 0.59
1115 0.51
1116 0.46
1117 0.42
1118 0.35
1119 0.31
1120 0.27
1121 0.24
1122 0.2
1123 0.19
1124 0.16
1125 0.17
1126 0.18
1127 0.2
1128 0.18
1129 0.17
1130 0.16
1131 0.15
1132 0.16
1133 0.15
1134 0.15
1135 0.14
1136 0.13
1137 0.13
1138 0.12
1139 0.13
1140 0.19
1141 0.19
1142 0.17
1143 0.22
1144 0.22
1145 0.23
1146 0.24
1147 0.28
1148 0.22
1149 0.22
1150 0.23
1151 0.17
1152 0.17
1153 0.15
1154 0.14
1155 0.14
1156 0.15
1157 0.15
1158 0.18
1159 0.18
1160 0.19
1161 0.2
1162 0.19
1163 0.17
1164 0.17
1165 0.17
1166 0.13
1167 0.13
1168 0.13
1169 0.12
1170 0.13
1171 0.12
1172 0.1
1173 0.11
1174 0.11
1175 0.12
1176 0.15
1177 0.16
1178 0.17
1179 0.2
1180 0.24
1181 0.27
1182 0.28
1183 0.29
1184 0.25
1185 0.24
1186 0.23
1187 0.21
1188 0.19
1189 0.15
1190 0.14
1191 0.12
1192 0.13
1193 0.11
1194 0.1
1195 0.11
1196 0.1
1197 0.09
1198 0.09
1199 0.09
1200 0.14
1201 0.2
1202 0.25
1203 0.24
1204 0.33
1205 0.39
1206 0.44
1207 0.47
1208 0.48
1209 0.44
1210 0.41
1211 0.46
1212 0.43
1213 0.41