FuNGI

A0A3N4LM00

Protein Details

Accession

A0A3N4LM00

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-52	SYNPPASRSVHQRRRRESAAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 12.333, cyto 9.5, mito_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MESRSSMDKMESSSVLSPIISPSASYVDLASSYNPPASRSVHQRRRRESAASSILSLTSSMGTVVDWKSPKEYGTSAISTLLENPNSRSLPPRPTTRDIPPVTLTPIPKVKAVEFAPYLTISAEYEKYLRAKDLGLEEHIRLSKVDSPGITPTQSFADLVDSKLLGYGKPTQRGDDVQSTTGSFPANGKPTRSIAMTPLNTVPPVYFDDNFHLENPRTFDVVSERSEVIRSSGDDSGSSSTSSGVNSSGPVGGTRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISSISQASSSFFTALGDLRELHSETAASVQRIQSLRKELMELDKEQAIKGLEIVRLRKRRANLAKLEGSVKQIERLLEQVKTVGFDLEKGNIEAALDGVDTAENLLLGKPIGEATSESIYYIDLGRVKALDAVKTEIAHLRHRIGKVYEARFVDTLLTDLQNHVEKAPLRDTLRRWCTSFQREQGRPRSQIFNANSLPLHPPRSSSLLPEYTTLSESLRQTLSKHLDGLQRARSIHSAIQAYRDAVLRETKSLIRRNMPSSDDDSSVMSNITLASRGGRTAQEKSAKLAKALRELGPIEAEDLYFRCYCGTSELVRRLGSQQKLLLDLTSGMGEMAVGGMLSPRLSQNGFGSGSPGKSGGLEDSITTVFSDLISPALDIAQGTLLKIVRARNDQTTKYGDVDFLRYFTLNKLFFAECEAVSGRVGGSGLQTQIGNQIKEFLTHYHRDTTNTMASTLEKDKWGAKDCDEKAQEGLNRIVDAATVDPEIWLRHAKIFEDTRNTSTYETTVEVPTTNGTADVAKATQVRNAMVEDQPFILPESSLKVLQEIERYEGLIVMMPGMTSDIAANMLDFLKMFNSRTCQLILGAGATKSAGLKNITTKHLALASQGLSIIISLMPYLRECSRRHAGSSAVTIMAEFDKVKRAYQDHQEEIHNKLISIMSDRLSAHIRNFPSINWEASPDHPNTYMETLVKETLTLNKVLSKHLPPPTLMCIMGPVFANYKEKLMEVYSTVELKSEGAKEKMLKDAELFQEKLGKLDGCGGTGEVILEMVKGKIIAGTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.22
3	0.2
4	0.18
5	0.15
6	0.17
7	0.13
8	0.11
9	0.12
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.13
14	0.12
15	0.13
16	0.14
17	0.14
18	0.14
19	0.15
20	0.19
21	0.19
22	0.19
23	0.23
24	0.27
25	0.31
26	0.4
27	0.49
28	0.56
29	0.65
30	0.74
31	0.78
32	0.82
33	0.8
34	0.76
35	0.69
36	0.69
37	0.68
38	0.59
39	0.52
40	0.44
41	0.39
42	0.33
43	0.28
44	0.19
45	0.11
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.11
51	0.12
52	0.17
53	0.19
54	0.2
55	0.24
56	0.25
57	0.26
58	0.26
59	0.26
60	0.24
61	0.28
62	0.29
63	0.26
64	0.26
65	0.26
66	0.22
67	0.25
68	0.26
69	0.23
70	0.23
71	0.25
72	0.3
73	0.3
74	0.31
75	0.34
76	0.34
77	0.41
78	0.45
79	0.52
80	0.54
81	0.59
82	0.64
83	0.65
84	0.69
85	0.62
86	0.61
87	0.55
88	0.49
89	0.47
90	0.46
91	0.4
92	0.36
93	0.39
94	0.36
95	0.35
96	0.36
97	0.32
98	0.35
99	0.35
100	0.35
101	0.3
102	0.3
103	0.28
104	0.26
105	0.25
106	0.18
107	0.18
108	0.12
109	0.14
110	0.13
111	0.13
112	0.14
113	0.16
114	0.19
115	0.2
116	0.21
117	0.19
118	0.19
119	0.22
120	0.26
121	0.26
122	0.28
123	0.29
124	0.28
125	0.31
126	0.32
127	0.28
128	0.23
129	0.23
130	0.24
131	0.24
132	0.26
133	0.22
134	0.23
135	0.27
136	0.3
137	0.28
138	0.22
139	0.21
140	0.2
141	0.2
142	0.18
143	0.13
144	0.17
145	0.17
146	0.18
147	0.18
148	0.16
149	0.15
150	0.17
151	0.17
152	0.11
153	0.13
154	0.22
155	0.26
156	0.34
157	0.36
158	0.35
159	0.38
160	0.42
161	0.44
162	0.43
163	0.4
164	0.33
165	0.33
166	0.32
167	0.29
168	0.27
169	0.22
170	0.14
171	0.14
172	0.18
173	0.25
174	0.25
175	0.28
176	0.3
177	0.32
178	0.34
179	0.33
180	0.29
181	0.26
182	0.33
183	0.32
184	0.31
185	0.31
186	0.3
187	0.28
188	0.27
189	0.21
190	0.15
191	0.18
192	0.19
193	0.18
194	0.18
195	0.23
196	0.26
197	0.27
198	0.26
199	0.26
200	0.24
201	0.26
202	0.29
203	0.26
204	0.23
205	0.22
206	0.22
207	0.23
208	0.26
209	0.25
210	0.24
211	0.23
212	0.22
213	0.23
214	0.22
215	0.18
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.17
220	0.16
221	0.16
222	0.17
223	0.18
224	0.17
225	0.15
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.18
248	0.21
249	0.21
250	0.2
251	0.19
252	0.2
253	0.19
254	0.19
255	0.15
256	0.11
257	0.11
258	0.13
259	0.15
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.12
265	0.12
266	0.1
267	0.08
268	0.09
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.1
289	0.09
290	0.09
291	0.13
292	0.14
293	0.13
294	0.15
295	0.15
296	0.2
297	0.22
298	0.24
299	0.23
300	0.27
301	0.28
302	0.27
303	0.28
304	0.24
305	0.29
306	0.31
307	0.28
308	0.24
309	0.25
310	0.25
311	0.23
312	0.24
313	0.17
314	0.14
315	0.14
316	0.15
317	0.15
318	0.18
319	0.23
320	0.3
321	0.36
322	0.39
323	0.42
324	0.41
325	0.5
326	0.56
327	0.59
328	0.58
329	0.58
330	0.59
331	0.56
332	0.56
333	0.46
334	0.39
335	0.34
336	0.27
337	0.22
338	0.2
339	0.19
340	0.17
341	0.2
342	0.19
343	0.16
344	0.16
345	0.16
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.11
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.1
358	0.1
359	0.08
360	0.07
361	0.05
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.07
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.12
395	0.13
396	0.13
397	0.12
398	0.14
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.17
404	0.19
405	0.2
406	0.21
407	0.25
408	0.25
409	0.28
410	0.25
411	0.29
412	0.33
413	0.34
414	0.36
415	0.32
416	0.33
417	0.3
418	0.29
419	0.23
420	0.15
421	0.13
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.12
431	0.13
432	0.15
433	0.17
434	0.2
435	0.21
436	0.25
437	0.29
438	0.35
439	0.4
440	0.4
441	0.4
442	0.39
443	0.45
444	0.48
445	0.51
446	0.48
447	0.51
448	0.54
449	0.6
450	0.65
451	0.64
452	0.6
453	0.57
454	0.55
455	0.47
456	0.5
457	0.44
458	0.41
459	0.35
460	0.33
461	0.3
462	0.26
463	0.28
464	0.21
465	0.23
466	0.16
467	0.17
468	0.18
469	0.23
470	0.22
471	0.21
472	0.24
473	0.23
474	0.24
475	0.23
476	0.22
477	0.18
478	0.18
479	0.16
480	0.12
481	0.13
482	0.12
483	0.13
484	0.13
485	0.13
486	0.13
487	0.19
488	0.22
489	0.2
490	0.2
491	0.22
492	0.25
493	0.27
494	0.3
495	0.28
496	0.26
497	0.26
498	0.26
499	0.23
500	0.21
501	0.2
502	0.2
503	0.18
504	0.15
505	0.18
506	0.17
507	0.17
508	0.16
509	0.16
510	0.12
511	0.11
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.14
516	0.16
517	0.21
518	0.27
519	0.28
520	0.3
521	0.33
522	0.35
523	0.37
524	0.35
525	0.32
526	0.3
527	0.29
528	0.25
529	0.22
530	0.19
531	0.16
532	0.15
533	0.12
534	0.08
535	0.06
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.07
544	0.09
545	0.12
546	0.14
547	0.19
548	0.24
549	0.25
550	0.27
551	0.32
552	0.3
553	0.3
554	0.31
555	0.28
556	0.28
557	0.3
558	0.28
559	0.24
560	0.24
561	0.23
562	0.2
563	0.17
564	0.12
565	0.1
566	0.09
567	0.06
568	0.06
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.1
576	0.13
577	0.13
578	0.18
579	0.23
580	0.24
581	0.24
582	0.25
583	0.26
584	0.3
585	0.29
586	0.26
587	0.24
588	0.23
589	0.24
590	0.23
591	0.19
592	0.12
593	0.11
594	0.1
595	0.07
596	0.06
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.02
603	0.02
604	0.02
605	0.02
606	0.02
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.08
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.14
618	0.14
619	0.14
620	0.13
621	0.13
622	0.09
623	0.08
624	0.09
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.11
653	0.13
654	0.15
655	0.2
656	0.22
657	0.29
658	0.34
659	0.35
660	0.36
661	0.38
662	0.36
663	0.33
664	0.31
665	0.25
666	0.21
667	0.23
668	0.2
669	0.16
670	0.16
671	0.14
672	0.14
673	0.14
674	0.2
675	0.16
676	0.16
677	0.19
678	0.18
679	0.18
680	0.21
681	0.2
682	0.13
683	0.15
684	0.15
685	0.12
686	0.12
687	0.12
688	0.08
689	0.07
690	0.07
691	0.05
692	0.06
693	0.07
694	0.07
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.15
699	0.18
700	0.17
701	0.16
702	0.19
703	0.18
704	0.2
705	0.21
706	0.17
707	0.2
708	0.23
709	0.25
710	0.28
711	0.29
712	0.31
713	0.31
714	0.32
715	0.31
716	0.28
717	0.26
718	0.2
719	0.2
720	0.21
721	0.22
722	0.19
723	0.16
724	0.17
725	0.2
726	0.23
727	0.29
728	0.27
729	0.27
730	0.35
731	0.36
732	0.44
733	0.41
734	0.38
735	0.33
736	0.36
737	0.35
738	0.29
739	0.3
740	0.21
741	0.2
742	0.19
743	0.18
744	0.13
745	0.12
746	0.09
747	0.07
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.09
754	0.11
755	0.11
756	0.14
757	0.15
758	0.16
759	0.22
760	0.26
761	0.29
762	0.34
763	0.36
764	0.35
765	0.36
766	0.36
767	0.31
768	0.27
769	0.23
770	0.17
771	0.16
772	0.16
773	0.15
774	0.14
775	0.13
776	0.13
777	0.13
778	0.11
779	0.1
780	0.08
781	0.07
782	0.07
783	0.07
784	0.08
785	0.07
786	0.09
787	0.11
788	0.12
789	0.14
790	0.15
791	0.15
792	0.15
793	0.17
794	0.18
795	0.17
796	0.18
797	0.17
798	0.16
799	0.16
800	0.15
801	0.15
802	0.12
803	0.1
804	0.09
805	0.12
806	0.13
807	0.13
808	0.13
809	0.13
810	0.14
811	0.16
812	0.2
813	0.18
814	0.19
815	0.19
816	0.19
817	0.18
818	0.17
819	0.15
820	0.11
821	0.1
822	0.07
823	0.06
824	0.05
825	0.05
826	0.06
827	0.05
828	0.04
829	0.04
830	0.04
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.06
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.08
840	0.1
841	0.11
842	0.13
843	0.18
844	0.19
845	0.21
846	0.22
847	0.21
848	0.19
849	0.19
850	0.17
851	0.14
852	0.14
853	0.12
854	0.11
855	0.1
856	0.1
857	0.1
858	0.1
859	0.11
860	0.11
861	0.14
862	0.21
863	0.26
864	0.29
865	0.31
866	0.3
867	0.3
868	0.3
869	0.28
870	0.22
871	0.21
872	0.19
873	0.16
874	0.16
875	0.13
876	0.11
877	0.1
878	0.09
879	0.05
880	0.05
881	0.04
882	0.05
883	0.06
884	0.07
885	0.1
886	0.14
887	0.2
888	0.22
889	0.3
890	0.38
891	0.4
892	0.42
893	0.42
894	0.41
895	0.39
896	0.41
897	0.35
898	0.26
899	0.23
900	0.2
901	0.19
902	0.16
903	0.13
904	0.1
905	0.09
906	0.17
907	0.18
908	0.2
909	0.24
910	0.28
911	0.33
912	0.43
913	0.51
914	0.48
915	0.5
916	0.55
917	0.53
918	0.52
919	0.53
920	0.43
921	0.34
922	0.31
923	0.29
924	0.23
925	0.25
926	0.24
927	0.18
928	0.21
929	0.21
930	0.22
931	0.24
932	0.25
933	0.24
934	0.28
935	0.29
936	0.3
937	0.3
938	0.28
939	0.32
940	0.32
941	0.31
942	0.25
943	0.28
944	0.26
945	0.29
946	0.34
947	0.28
948	0.28
949	0.28
950	0.28
951	0.27
952	0.27
953	0.26
954	0.22
955	0.22
956	0.22
957	0.22
958	0.21
959	0.18
960	0.17
961	0.21
962	0.22
963	0.21
964	0.2
965	0.24
966	0.25
967	0.29
968	0.34
969	0.32
970	0.38
971	0.44
972	0.46
973	0.42
974	0.46
975	0.47
976	0.44
977	0.39
978	0.3
979	0.26
980	0.24
981	0.24
982	0.21
983	0.17
984	0.16
985	0.19
986	0.23
987	0.2
988	0.22
989	0.21
990	0.21
991	0.21
992	0.2
993	0.2
994	0.18
995	0.21
996	0.21
997	0.22
998	0.21
999	0.19
1000	0.18
1001	0.17
1002	0.19
1003	0.2
1004	0.23
1005	0.23
1006	0.28
1007	0.32
1008	0.34
1009	0.41
1010	0.39
1011	0.35
1012	0.32
1013	0.37
1014	0.4
1015	0.42
1016	0.41
1017	0.34
1018	0.4
1019	0.39
1020	0.38
1021	0.34
1022	0.27
1023	0.21
1024	0.28
1025	0.28
1026	0.21
1027	0.22
1028	0.21
1029	0.18
1030	0.17
1031	0.17
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.07

A0A3N4LM00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer