Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4LJ00

Protein Details
Accession A0A3N4LJ00    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-252RGEEFEKRRRGRREQRRDNIDPSBasic
291-353PISTSRPRPRRTRSRSRSRSHSATRLRYHSRQRSPQPRRRWRSRSRSRSPPPRRDRDKNIELFHydrophilic
529-549SASGVGGRRKGRRNKAADLFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-244KRRRGRREQ
296-346RPRPRRTRSRSRSRSHSATRLRYHSRQRSPQPRRRWRSRSRSRSPPPRRDR
535-543GRRKGRRNK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MFASNTTSGYGSLAPLSQSLAEDVQITFDTDMMDEDEALAYEQQQQLQQQQQQQPQQNVDYPGLNADGVTIGFDAGGDMEMGMDTDTVQLVAEKVHLKGVDTMATGDIEAWARKWVGEEGGLLRVQWIDDSSSMFLPTPTYGLGNLIFPTAAHAQNALNLLTEPNPPMLGAVTQPTPAQQANLLLIRIARICDSHPNARLEVRIARVDDVKQKGARERSRFYLFNPEYDRGEEFEKRRRGRREQRRDNIDPSPNGDGDYQRRRFDHREHERRIAGSGDAAMYDDNMYDDEPISTSRPRPRRTRSRSRSRSHSATRLRYHSRQRSPQPRRRWRSRSRSRSPPPRRDRDKNIELFPETAKSEPKGLMGHYGEDRFYNPPVETVSRVADGLDMVGRIPTRAVKGIELFPEKASQKGISILGLASTSPPPSTVRVSGGKELFPEKLGSAAPAPSKRGGLASRITLPGNSASGVLGYHSDSGVGSDGTPVVNKGMGSTNAEDDLFAEKMVMGRRVGLGAVGGDLFNRIEAPERSASGVGGRRKGRRNKAADLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.13
29 0.15
30 0.16
31 0.19
32 0.21
33 0.27
34 0.35
35 0.4
36 0.43
37 0.5
38 0.56
39 0.62
40 0.67
41 0.66
42 0.63
43 0.62
44 0.58
45 0.53
46 0.47
47 0.4
48 0.32
49 0.28
50 0.24
51 0.2
52 0.14
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.19
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.18
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.17
144 0.13
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.16
180 0.21
181 0.26
182 0.3
183 0.32
184 0.32
185 0.33
186 0.32
187 0.27
188 0.26
189 0.23
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.22
195 0.26
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.28
200 0.33
201 0.41
202 0.46
203 0.45
204 0.45
205 0.47
206 0.51
207 0.5
208 0.45
209 0.47
210 0.4
211 0.39
212 0.4
213 0.36
214 0.31
215 0.32
216 0.31
217 0.21
218 0.24
219 0.24
220 0.23
221 0.3
222 0.37
223 0.4
224 0.47
225 0.53
226 0.61
227 0.67
228 0.75
229 0.78
230 0.8
231 0.85
232 0.86
233 0.83
234 0.77
235 0.73
236 0.67
237 0.56
238 0.48
239 0.41
240 0.32
241 0.28
242 0.24
243 0.2
244 0.21
245 0.3
246 0.3
247 0.3
248 0.31
249 0.35
250 0.39
251 0.43
252 0.48
253 0.5
254 0.56
255 0.59
256 0.64
257 0.6
258 0.56
259 0.5
260 0.4
261 0.29
262 0.19
263 0.14
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.09
281 0.13
282 0.21
283 0.29
284 0.35
285 0.44
286 0.52
287 0.62
288 0.7
289 0.77
290 0.79
291 0.83
292 0.87
293 0.85
294 0.84
295 0.8
296 0.79
297 0.73
298 0.72
299 0.69
300 0.68
301 0.66
302 0.64
303 0.63
304 0.62
305 0.66
306 0.67
307 0.67
308 0.67
309 0.72
310 0.77
311 0.81
312 0.83
313 0.84
314 0.85
315 0.86
316 0.88
317 0.89
318 0.88
319 0.88
320 0.91
321 0.9
322 0.88
323 0.9
324 0.89
325 0.9
326 0.9
327 0.9
328 0.88
329 0.88
330 0.89
331 0.86
332 0.86
333 0.85
334 0.83
335 0.78
336 0.71
337 0.64
338 0.56
339 0.49
340 0.4
341 0.32
342 0.24
343 0.2
344 0.18
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.17
349 0.15
350 0.15
351 0.2
352 0.18
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.19
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.13
363 0.13
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.16
370 0.16
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.14
385 0.15
386 0.16
387 0.19
388 0.22
389 0.26
390 0.28
391 0.27
392 0.24
393 0.29
394 0.27
395 0.26
396 0.25
397 0.2
398 0.18
399 0.2
400 0.19
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.14
414 0.17
415 0.18
416 0.22
417 0.27
418 0.3
419 0.35
420 0.36
421 0.33
422 0.32
423 0.32
424 0.28
425 0.24
426 0.22
427 0.15
428 0.16
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.16
433 0.2
434 0.22
435 0.25
436 0.24
437 0.25
438 0.24
439 0.27
440 0.25
441 0.24
442 0.25
443 0.26
444 0.28
445 0.29
446 0.29
447 0.25
448 0.25
449 0.22
450 0.19
451 0.16
452 0.12
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.09
475 0.1
476 0.15
477 0.16
478 0.2
479 0.21
480 0.22
481 0.22
482 0.22
483 0.2
484 0.17
485 0.18
486 0.14
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.13
491 0.17
492 0.19
493 0.15
494 0.16
495 0.18
496 0.18
497 0.18
498 0.15
499 0.11
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.06
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.12
511 0.14
512 0.19
513 0.22
514 0.23
515 0.25
516 0.26
517 0.26
518 0.26
519 0.32
520 0.33
521 0.38
522 0.44
523 0.5
524 0.59
525 0.69
526 0.74
527 0.77
528 0.78
529 0.8