Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4LI42

Protein Details
Accession A0A3N4LI42    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-113DRPIIKKGGKRRRREEDGEEBasic
163-187KIGEALKSKTKRRKKKDEVELEQFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-147PIIKKGGKRRRREEDGEEELGGVGRRTGGGGGGGRKGGRAVRAEGERPERPA
168-178LKSKTKRRKKK
410-420RQMAMKKGGKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MDITDGLEHLGPSASEEKPKLTADALAVLDERKADAEADDASDSDLSEIDDNLFKDYQQAIPLNNRPVVPIDEDAVARLGVHRRQRDPNEVTHDRPIIKKGGKRRRREEDGEEELGGVGRRTGGGGGGGRKGGRAVRAEGERPERPARILTAEEQRIADLDAKIGEALKSKTKRRKKKDEVELEQFQDDLIANLRDRMIAAAERDYADVKSGHAATHKIRMLEEVRSVITKPNLVVSCMDNNFLSAVRRWLEPLDNNALPAYSIQKDLFKYLTSINPDVENLRESGIGKIVSFYTKDVRPQPDIKRQANTLMRDWTRPILGRSDDYKTKLWQEAKYDPSQVFSQSASQRAPREDEDRDPLALPARNPNRTRVPMSMPKTYEIVPKSTVTPGGVKMFGSQADELVKRVKARQMAMKKGGKKSGLSIEGRGLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.23
4 0.24
5 0.28
6 0.29
7 0.27
8 0.24
9 0.25
10 0.21
11 0.25
12 0.23
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.18
17 0.15
18 0.14
19 0.09
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.12
38 0.13
39 0.16
40 0.16
41 0.14
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.32
49 0.38
50 0.39
51 0.4
52 0.38
53 0.34
54 0.35
55 0.34
56 0.29
57 0.24
58 0.21
59 0.2
60 0.2
61 0.19
62 0.17
63 0.14
64 0.1
65 0.12
66 0.16
67 0.2
68 0.28
69 0.34
70 0.39
71 0.49
72 0.55
73 0.62
74 0.61
75 0.62
76 0.64
77 0.62
78 0.6
79 0.56
80 0.54
81 0.47
82 0.45
83 0.41
84 0.4
85 0.41
86 0.42
87 0.47
88 0.54
89 0.61
90 0.69
91 0.75
92 0.77
93 0.8
94 0.82
95 0.79
96 0.77
97 0.75
98 0.67
99 0.57
100 0.47
101 0.38
102 0.31
103 0.24
104 0.14
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.14
120 0.16
121 0.16
122 0.18
123 0.22
124 0.25
125 0.27
126 0.31
127 0.35
128 0.33
129 0.35
130 0.36
131 0.32
132 0.3
133 0.29
134 0.26
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.27
139 0.27
140 0.27
141 0.25
142 0.23
143 0.2
144 0.2
145 0.18
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.17
156 0.23
157 0.32
158 0.42
159 0.52
160 0.62
161 0.69
162 0.79
163 0.82
164 0.87
165 0.9
166 0.9
167 0.88
168 0.85
169 0.79
170 0.69
171 0.58
172 0.47
173 0.36
174 0.25
175 0.18
176 0.1
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.19
204 0.2
205 0.18
206 0.18
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.08
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.16
239 0.16
240 0.2
241 0.23
242 0.21
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.14
248 0.13
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.19
260 0.21
261 0.21
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.18
267 0.15
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.16
283 0.21
284 0.27
285 0.31
286 0.35
287 0.42
288 0.49
289 0.55
290 0.62
291 0.61
292 0.58
293 0.55
294 0.58
295 0.57
296 0.52
297 0.46
298 0.45
299 0.42
300 0.41
301 0.41
302 0.35
303 0.31
304 0.3
305 0.28
306 0.25
307 0.26
308 0.28
309 0.29
310 0.33
311 0.34
312 0.36
313 0.37
314 0.35
315 0.37
316 0.4
317 0.42
318 0.4
319 0.43
320 0.46
321 0.49
322 0.5
323 0.49
324 0.42
325 0.4
326 0.37
327 0.32
328 0.26
329 0.21
330 0.24
331 0.23
332 0.27
333 0.27
334 0.3
335 0.33
336 0.34
337 0.37
338 0.35
339 0.37
340 0.37
341 0.4
342 0.42
343 0.4
344 0.38
345 0.34
346 0.31
347 0.31
348 0.3
349 0.26
350 0.3
351 0.36
352 0.43
353 0.44
354 0.5
355 0.53
356 0.56
357 0.6
358 0.55
359 0.56
360 0.57
361 0.61
362 0.62
363 0.55
364 0.51
365 0.49
366 0.45
367 0.44
368 0.37
369 0.35
370 0.3
371 0.3
372 0.3
373 0.3
374 0.3
375 0.25
376 0.26
377 0.26
378 0.27
379 0.26
380 0.24
381 0.23
382 0.23
383 0.22
384 0.22
385 0.18
386 0.16
387 0.21
388 0.21
389 0.21
390 0.24
391 0.25
392 0.25
393 0.3
394 0.34
395 0.35
396 0.4
397 0.49
398 0.54
399 0.61
400 0.68
401 0.72
402 0.74
403 0.75
404 0.77
405 0.71
406 0.63
407 0.6
408 0.6
409 0.59
410 0.54
411 0.49