FuNGI

A0A3N4LD40

Protein Details

Accession

A0A3N4LD40

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-149	FAPFQKIPKKTTKRDARQGTID	Hydrophilic
220-241	KAAKKEKESRREKRSTERKGKA	Basic
392-417	SGSQSQQKPIRRNRRRDRGGQNGRES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
218-263	AEKAAKKEKESRREKRSTERKGKASGKATVEKEKEREKEKEKATQK
402-408	RRNRRRD
611-643	RGGHWHRGGPRGGGFPMRGVSGRGGRGRGSGGG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSSAANNEPKLEKRSSRAQGGGGGPGRAVTGNTSSNAAKLKILVRKLPPAMTEDEFKTHTAEWIDFDNIEYFSFVKGKVSEDRAKASRHAGSSIKFKSQEQIVALREGIEGRIFTDSRGNQARPQVEFAPFQKIPKKTTKRDARQGTIDQDPEYIAFLEILKTGAPLQAASTLPSINATVNPADGVVGTDKPLDKPTSTPLIEFIRAQKAAGASASAAEKAAKKEKESRREKRSTERKGKASGKATVEKEKEREKEKEKATQKAVKLAVRVVNSEGAAAANRRSKNTAETPVTPTASDTWKVSTPQGTPVTASASAKPPRRERGTATIAAAILQRDLGLGGPLQRKDRRGGGGNAQQATTLSMPTDQASGEGSAQPTEPTPQTVPENAPSESGSQSQQKPIRRNRRRDRGGQNGRESNPQTPTSEPLKAPISILKKQNTSIVATSGDNLVTPVPPQILKREKSTTSNPPEASTAPQSLSAPATAQPSITTTQQTQAPAQSPIGPRGGRGPRLQRSLRGVNASNVPAVKAGNAVSTGASSSPKAPNQPSAMAPTAIIPAPAASSSQPTTPTVPTNPPATNTGTVLGVAGKVPSGPAASTGSNVGSHGPGSGRGGHWHRGGPRGGGFPMRGVSGRGGRGRGSGGGGMRGGPQGGNGSATME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.58
3	0.61
4	0.59
5	0.55
6	0.55
7	0.51
8	0.53
9	0.45
10	0.38
11	0.3
12	0.27
13	0.25
14	0.19
15	0.17
16	0.12
17	0.14
18	0.16
19	0.17
20	0.2
21	0.2
22	0.22
23	0.25
24	0.23
25	0.2
26	0.22
27	0.28
28	0.31
29	0.36
30	0.41
31	0.43
32	0.5
33	0.53
34	0.52
35	0.47
36	0.44
37	0.44
38	0.39
39	0.39
40	0.33
41	0.33
42	0.31
43	0.3
44	0.29
45	0.24
46	0.25
47	0.23
48	0.21
49	0.19
50	0.21
51	0.22
52	0.19
53	0.2
54	0.18
55	0.16
56	0.16
57	0.15
58	0.12
59	0.12
60	0.14
61	0.12
62	0.14
63	0.15
64	0.18
65	0.24
66	0.31
67	0.37
68	0.39
69	0.46
70	0.46
71	0.48
72	0.48
73	0.47
74	0.45
75	0.39
76	0.4
77	0.37
78	0.37
79	0.44
80	0.44
81	0.45
82	0.41
83	0.4
84	0.42
85	0.41
86	0.41
87	0.35
88	0.38
89	0.33
90	0.33
91	0.32
92	0.27
93	0.24
94	0.2
95	0.18
96	0.12
97	0.1
98	0.09
99	0.13
100	0.13
101	0.13
102	0.2
103	0.2
104	0.26
105	0.33
106	0.34
107	0.34
108	0.41
109	0.45
110	0.39
111	0.43
112	0.39
113	0.35
114	0.38
115	0.35
116	0.37
117	0.34
118	0.36
119	0.39
120	0.39
121	0.42
122	0.49
123	0.57
124	0.56
125	0.66
126	0.73
127	0.75
128	0.82
129	0.85
130	0.8
131	0.78
132	0.75
133	0.68
134	0.63
135	0.54
136	0.44
137	0.36
138	0.3
139	0.23
140	0.19
141	0.15
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.11
156	0.11
157	0.12
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.12
162	0.12
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.09
177	0.1
178	0.12
179	0.15
180	0.16
181	0.15
182	0.16
183	0.21
184	0.26
185	0.26
186	0.25
187	0.26
188	0.27
189	0.28
190	0.27
191	0.26
192	0.25
193	0.24
194	0.24
195	0.22
196	0.19
197	0.18
198	0.17
199	0.13
200	0.07
201	0.08
202	0.09
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.1
207	0.13
208	0.21
209	0.21
210	0.24
211	0.34
212	0.43
213	0.52
214	0.61
215	0.67
216	0.7
217	0.77
218	0.78
219	0.79
220	0.81
221	0.81
222	0.81
223	0.8
224	0.75
225	0.75
226	0.77
227	0.73
228	0.67
229	0.63
230	0.57
231	0.56
232	0.54
233	0.52
234	0.5
235	0.46
236	0.45
237	0.47
238	0.47
239	0.46
240	0.5
241	0.48
242	0.53
243	0.53
244	0.58
245	0.56
246	0.59
247	0.6
248	0.59
249	0.55
250	0.53
251	0.53
252	0.46
253	0.41
254	0.37
255	0.34
256	0.28
257	0.28
258	0.22
259	0.19
260	0.17
261	0.16
262	0.12
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.1
267	0.14
268	0.15
269	0.16
270	0.18
271	0.19
272	0.24
273	0.28
274	0.32
275	0.3
276	0.32
277	0.36
278	0.37
279	0.36
280	0.31
281	0.26
282	0.21
283	0.2
284	0.18
285	0.13
286	0.13
287	0.14
288	0.15
289	0.16
290	0.17
291	0.15
292	0.21
293	0.22
294	0.2
295	0.19
296	0.18
297	0.19
298	0.17
299	0.17
300	0.12
301	0.17
302	0.22
303	0.27
304	0.32
305	0.35
306	0.41
307	0.45
308	0.46
309	0.45
310	0.47
311	0.47
312	0.44
313	0.39
314	0.33
315	0.28
316	0.26
317	0.22
318	0.13
319	0.08
320	0.06
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.03
327	0.08
328	0.11
329	0.13
330	0.18
331	0.2
332	0.22
333	0.24
334	0.28
335	0.27
336	0.29
337	0.3
338	0.32
339	0.36
340	0.38
341	0.37
342	0.33
343	0.29
344	0.24
345	0.23
346	0.16
347	0.1
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.12
369	0.14
370	0.16
371	0.17
372	0.19
373	0.22
374	0.19
375	0.2
376	0.18
377	0.18
378	0.17
379	0.17
380	0.15
381	0.18
382	0.19
383	0.26
384	0.3
385	0.35
386	0.43
387	0.52
388	0.61
389	0.65
390	0.75
391	0.79
392	0.85
393	0.85
394	0.86
395	0.85
396	0.85
397	0.86
398	0.83
399	0.79
400	0.74
401	0.69
402	0.65
403	0.58
404	0.5
405	0.44
406	0.38
407	0.32
408	0.27
409	0.3
410	0.28
411	0.3
412	0.26
413	0.25
414	0.26
415	0.24
416	0.24
417	0.25
418	0.26
419	0.28
420	0.34
421	0.35
422	0.35
423	0.36
424	0.39
425	0.35
426	0.32
427	0.27
428	0.23
429	0.2
430	0.19
431	0.18
432	0.15
433	0.13
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.08
441	0.09
442	0.1
443	0.19
444	0.26
445	0.29
446	0.34
447	0.39
448	0.4
449	0.45
450	0.51
451	0.52
452	0.51
453	0.56
454	0.51
455	0.47
456	0.46
457	0.41
458	0.38
459	0.32
460	0.26
461	0.19
462	0.2
463	0.19
464	0.18
465	0.18
466	0.14
467	0.12
468	0.12
469	0.14
470	0.13
471	0.12
472	0.11
473	0.13
474	0.14
475	0.15
476	0.16
477	0.14
478	0.17
479	0.2
480	0.22
481	0.21
482	0.23
483	0.24
484	0.23
485	0.23
486	0.26
487	0.25
488	0.26
489	0.3
490	0.26
491	0.24
492	0.31
493	0.37
494	0.35
495	0.4
496	0.47
497	0.49
498	0.57
499	0.59
500	0.56
501	0.57
502	0.59
503	0.56
504	0.52
505	0.47
506	0.42
507	0.44
508	0.39
509	0.34
510	0.28
511	0.24
512	0.19
513	0.17
514	0.14
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.09
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.1
525	0.09
526	0.13
527	0.18
528	0.21
529	0.27
530	0.29
531	0.35
532	0.38
533	0.4
534	0.37
535	0.38
536	0.37
537	0.31
538	0.28
539	0.23
540	0.21
541	0.18
542	0.16
543	0.1
544	0.08
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.07
549	0.11
550	0.13
551	0.15
552	0.17
553	0.18
554	0.21
555	0.23
556	0.27
557	0.27
558	0.32
559	0.33
560	0.36
561	0.36
562	0.35
563	0.35
564	0.35
565	0.33
566	0.28
567	0.26
568	0.21
569	0.19
570	0.17
571	0.15
572	0.1
573	0.09
574	0.08
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.08
580	0.07
581	0.09
582	0.12
583	0.13
584	0.14
585	0.15
586	0.15
587	0.15
588	0.15
589	0.14
590	0.12
591	0.11
592	0.12
593	0.11
594	0.12
595	0.14
596	0.17
597	0.17
598	0.24
599	0.28
600	0.33
601	0.35
602	0.39
603	0.41
604	0.44
605	0.45
606	0.42
607	0.41
608	0.39
609	0.38
610	0.37
611	0.34
612	0.3
613	0.29
614	0.26
615	0.23
616	0.21
617	0.24
618	0.25
619	0.31
620	0.32
621	0.33
622	0.32
623	0.34
624	0.34
625	0.3
626	0.27
627	0.25
628	0.22
629	0.22
630	0.22
631	0.2
632	0.2
633	0.19
634	0.17
635	0.13
636	0.13
637	0.14
638	0.14
639	0.14

A0A3N4LD40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer