Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3N4LPJ2

Protein Details
Accession A0A3N4LPJ2    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MATAQPEPERRAKRKRTEDDLEERYMHydrophilic
291-335QNDRKLRVSRAKAVKRKNKPVDVTGPSSKKQKVFVPRDNPRQKEMHydrophilic
368-395TANPRIKLGGKKKGKPARARANARSSAWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-13K
294-355RKLRVSRAKAVKRKNKPVDVTGPSSKKQKVFVPRDNPRQKEMLGRARRLLGKAGAAKAKKAP
371-402PRIKLGGKKKGKPARARANARSSAWKQKAKKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MATAQPEPERRAKRKRTEDDLEERYMQRIQEEEVVENKKIEAVRKAKQEAKAALEEDGDTAEGEDEDSGDDSDGGESEDEQQNKNDKKGTTGTGSSELFPIRHETLEPQKHEDFDEAARTVFLGNVPSIAISSKSSYKILKSVFSAPGKIFKLRFRSIAFSEQIPRKAAFATHKLHEKQQTVNAYVVYQTKEAAREALKLNGSVVLDRHIRVDSVAHPAKHDTQRSVFIGNLDFEAQEESLWRHFAPCGTIEYVRIVRDGATNVGKGFAYVQFEDVVSVEQALLLDGRKMQNDRKLRVSRAKAVKRKNKPVDVTGPSSKKQKVFVPRDNPRQKEMLGRARRLLGKAGAAKAKKAPESFIFEGTRATVTANPRIKLGGKKKGKPARARANARSSAWKQKAKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.88
3 0.88
4 0.87
5 0.87
6 0.86
7 0.81
8 0.75
9 0.69
10 0.6
11 0.53
12 0.46
13 0.38
14 0.3
15 0.25
16 0.22
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.29
21 0.33
22 0.32
23 0.31
24 0.28
25 0.26
26 0.26
27 0.28
28 0.31
29 0.34
30 0.4
31 0.49
32 0.56
33 0.58
34 0.62
35 0.65
36 0.61
37 0.59
38 0.56
39 0.48
40 0.42
41 0.37
42 0.31
43 0.23
44 0.19
45 0.13
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.11
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.22
69 0.3
70 0.34
71 0.37
72 0.38
73 0.33
74 0.37
75 0.4
76 0.4
77 0.36
78 0.35
79 0.34
80 0.33
81 0.34
82 0.29
83 0.27
84 0.24
85 0.19
86 0.18
87 0.2
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.19
92 0.28
93 0.36
94 0.37
95 0.38
96 0.38
97 0.39
98 0.39
99 0.36
100 0.27
101 0.22
102 0.23
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.12
121 0.14
122 0.16
123 0.18
124 0.19
125 0.23
126 0.24
127 0.24
128 0.24
129 0.27
130 0.32
131 0.31
132 0.32
133 0.27
134 0.33
135 0.32
136 0.33
137 0.3
138 0.28
139 0.35
140 0.34
141 0.38
142 0.33
143 0.36
144 0.36
145 0.39
146 0.35
147 0.3
148 0.34
149 0.34
150 0.34
151 0.31
152 0.28
153 0.23
154 0.23
155 0.23
156 0.22
157 0.24
158 0.25
159 0.26
160 0.33
161 0.34
162 0.38
163 0.42
164 0.39
165 0.36
166 0.38
167 0.38
168 0.33
169 0.32
170 0.27
171 0.21
172 0.21
173 0.2
174 0.15
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.17
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.27
207 0.31
208 0.31
209 0.26
210 0.25
211 0.29
212 0.3
213 0.29
214 0.23
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.13
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.08
274 0.1
275 0.13
276 0.16
277 0.21
278 0.29
279 0.37
280 0.4
281 0.48
282 0.52
283 0.57
284 0.63
285 0.65
286 0.66
287 0.68
288 0.75
289 0.73
290 0.78
291 0.81
292 0.82
293 0.87
294 0.87
295 0.85
296 0.8
297 0.78
298 0.77
299 0.72
300 0.68
301 0.66
302 0.61
303 0.55
304 0.58
305 0.55
306 0.49
307 0.48
308 0.48
309 0.51
310 0.56
311 0.63
312 0.66
313 0.71
314 0.8
315 0.85
316 0.81
317 0.74
318 0.68
319 0.59
320 0.58
321 0.57
322 0.57
323 0.55
324 0.56
325 0.55
326 0.57
327 0.6
328 0.52
329 0.47
330 0.39
331 0.37
332 0.38
333 0.4
334 0.42
335 0.39
336 0.4
337 0.41
338 0.44
339 0.43
340 0.4
341 0.39
342 0.37
343 0.45
344 0.45
345 0.45
346 0.41
347 0.36
348 0.36
349 0.32
350 0.28
351 0.19
352 0.18
353 0.16
354 0.19
355 0.29
356 0.34
357 0.33
358 0.33
359 0.36
360 0.39
361 0.45
362 0.5
363 0.51
364 0.55
365 0.62
366 0.72
367 0.79
368 0.84
369 0.84
370 0.85
371 0.86
372 0.86
373 0.88
374 0.87
375 0.87
376 0.84
377 0.77
378 0.76
379 0.71
380 0.71
381 0.71
382 0.71