FuNGI

A0A3N4LKP7

Protein Details

Accession

A0A3N4LKP7

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-59	NPPSGPPKPIYRPRRNADPLRRRPDPKARRERPAAASG	Hydrophilic
189-211	YGGAQRQKKNAFKKKTQQVYQTD	Hydrophilic
449-468	KREEERKKAEEKKREEERKQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-59	PPKPIYRPRRNADPLRRRPDPKARRERPAAASG
398-416	REKKRRAQLEKKTGKKVIK
449-488	KREEERKKAEEKKREEERKQLEAEKKKREEEEAKKAAEKA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPVALTSKPPTAMDSAATPNPPSGPPKPIYRPRRNADPLRRRPDPKARRERPAAASGAAGPSHHRPSPINPLSAPAPPPPQEDTSTWTTFELKTTKRELMKGLRYHVMRLQHKNRVDITEPDQFTLPIRLHRRDPRAPPQGAKEEQAALAAEEEGKKLDPEEQKKLEEAQAAKEAEQAATLAAIAPYGGAQRQKKNAFKKKTQQVYQTDEVAKKLRYEEYFPWHIEDFDNKNTWVGNLEGALSDGCQAIFVMDGNCFRMIPVEKWYKFTQRSNFKTLSIEEAEAAMKKKSKTPRWLMEVTKMDEKAQKAKEEAENRAAMKSMYLVKGDRLANRPKEEVADADELDFEDNFQDDEEAPIMEGEEEENRQIEKRIKKEQLGANLFDLKDEKEYEQEEREKKRRAQLEKKTGKKVIKYLRGHEKNLTYESDSDENPYASTSEDSSVEEAKREEERKKAEEKKREEERKQLEAEKKKREEEEAKKAAEKAAAEKAASTTPSSSLQVKGTDADKPSKHRQLKRTTAADPYASESGTDTGTGRKKARNLAQVVASSTTNATKKRPREGGAGSDNDAAAAETSGGESLAKKAKIKIKVQQPGTGGPTPSSTTAQRPAGNVGTPRAVTPSVSGSRTASPGTGGTPASSGGSAIDITADEIRAVLKLKPEGQELKEFLSHFKGRVDRNTMAPFLALLKPLSRQKGKLICPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.23
4	0.26
5	0.27
6	0.28
7	0.26
8	0.25
9	0.26
10	0.27
11	0.3
12	0.28
13	0.32
14	0.35
15	0.44
16	0.52
17	0.6
18	0.69
19	0.73
20	0.79
21	0.78
22	0.85
23	0.86
24	0.86
25	0.87
26	0.88
27	0.88
28	0.86
29	0.88
30	0.83
31	0.83
32	0.83
33	0.83
34	0.83
35	0.83
36	0.83
37	0.84
38	0.86
39	0.85
40	0.8
41	0.76
42	0.68
43	0.57
44	0.5
45	0.42
46	0.36
47	0.28
48	0.21
49	0.18
50	0.21
51	0.25
52	0.25
53	0.27
54	0.27
55	0.33
56	0.44
57	0.46
58	0.44
59	0.39
60	0.41
61	0.41
62	0.42
63	0.39
64	0.32
65	0.33
66	0.31
67	0.35
68	0.36
69	0.36
70	0.36
71	0.35
72	0.36
73	0.37
74	0.36
75	0.33
76	0.3
77	0.29
78	0.26
79	0.29
80	0.31
81	0.27
82	0.31
83	0.36
84	0.41
85	0.43
86	0.45
87	0.48
88	0.5
89	0.56
90	0.56
91	0.55
92	0.56
93	0.52
94	0.53
95	0.49
96	0.49
97	0.48
98	0.54
99	0.57
100	0.59
101	0.62
102	0.64
103	0.63
104	0.59
105	0.54
106	0.49
107	0.46
108	0.46
109	0.43
110	0.39
111	0.36
112	0.31
113	0.29
114	0.29
115	0.25
116	0.24
117	0.3
118	0.33
119	0.41
120	0.5
121	0.57
122	0.6
123	0.68
124	0.7
125	0.73
126	0.73
127	0.69
128	0.67
129	0.68
130	0.61
131	0.54
132	0.46
133	0.38
134	0.34
135	0.3
136	0.23
137	0.14
138	0.13
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.16
148	0.23
149	0.29
150	0.38
151	0.41
152	0.42
153	0.43
154	0.45
155	0.41
156	0.38
157	0.33
158	0.28
159	0.3
160	0.3
161	0.28
162	0.28
163	0.25
164	0.2
165	0.18
166	0.14
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.03
174	0.03
175	0.04
176	0.05
177	0.07
178	0.12
179	0.17
180	0.23
181	0.32
182	0.4
183	0.48
184	0.58
185	0.67
186	0.7
187	0.75
188	0.8
189	0.82
190	0.84
191	0.82
192	0.8
193	0.77
194	0.76
195	0.69
196	0.64
197	0.58
198	0.49
199	0.45
200	0.39
201	0.33
202	0.27
203	0.26
204	0.26
205	0.24
206	0.28
207	0.31
208	0.34
209	0.38
210	0.37
211	0.37
212	0.32
213	0.31
214	0.27
215	0.28
216	0.25
217	0.24
218	0.25
219	0.22
220	0.23
221	0.22
222	0.21
223	0.17
224	0.13
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.11
248	0.13
249	0.13
250	0.2
251	0.28
252	0.29
253	0.33
254	0.36
255	0.4
256	0.43
257	0.49
258	0.5
259	0.51
260	0.56
261	0.58
262	0.57
263	0.5
264	0.48
265	0.42
266	0.37
267	0.29
268	0.24
269	0.17
270	0.16
271	0.15
272	0.14
273	0.15
274	0.11
275	0.13
276	0.13
277	0.2
278	0.28
279	0.36
280	0.44
281	0.52
282	0.58
283	0.61
284	0.66
285	0.62
286	0.61
287	0.57
288	0.51
289	0.46
290	0.39
291	0.34
292	0.32
293	0.31
294	0.3
295	0.28
296	0.27
297	0.25
298	0.28
299	0.33
300	0.34
301	0.36
302	0.32
303	0.32
304	0.31
305	0.3
306	0.26
307	0.19
308	0.15
309	0.14
310	0.12
311	0.11
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.18
316	0.2
317	0.21
318	0.23
319	0.29
320	0.33
321	0.35
322	0.36
323	0.31
324	0.3
325	0.27
326	0.22
327	0.19
328	0.16
329	0.14
330	0.13
331	0.12
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.1
358	0.16
359	0.21
360	0.27
361	0.36
362	0.39
363	0.42
364	0.49
365	0.49
366	0.52
367	0.49
368	0.44
369	0.37
370	0.36
371	0.33
372	0.26
373	0.23
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.11
379	0.13
380	0.15
381	0.19
382	0.25
383	0.3
384	0.36
385	0.43
386	0.48
387	0.5
388	0.55
389	0.59
390	0.62
391	0.66
392	0.69
393	0.73
394	0.75
395	0.78
396	0.78
397	0.76
398	0.71
399	0.64
400	0.62
401	0.6
402	0.6
403	0.57
404	0.57
405	0.62
406	0.63
407	0.62
408	0.58
409	0.52
410	0.45
411	0.44
412	0.38
413	0.29
414	0.24
415	0.25
416	0.22
417	0.19
418	0.18
419	0.17
420	0.15
421	0.14
422	0.13
423	0.1
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.12
435	0.13
436	0.18
437	0.22
438	0.24
439	0.27
440	0.33
441	0.36
442	0.46
443	0.54
444	0.57
445	0.63
446	0.67
447	0.7
448	0.76
449	0.81
450	0.76
451	0.76
452	0.73
453	0.7
454	0.66
455	0.64
456	0.62
457	0.62
458	0.67
459	0.67
460	0.65
461	0.63
462	0.61
463	0.61
464	0.62
465	0.6
466	0.62
467	0.59
468	0.56
469	0.54
470	0.52
471	0.46
472	0.39
473	0.3
474	0.24
475	0.23
476	0.23
477	0.21
478	0.2
479	0.2
480	0.19
481	0.19
482	0.16
483	0.11
484	0.12
485	0.14
486	0.16
487	0.16
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.18
492	0.19
493	0.18
494	0.2
495	0.21
496	0.26
497	0.27
498	0.33
499	0.41
500	0.49
501	0.57
502	0.61
503	0.68
504	0.71
505	0.78
506	0.8
507	0.77
508	0.69
509	0.66
510	0.61
511	0.53
512	0.44
513	0.38
514	0.3
515	0.24
516	0.21
517	0.16
518	0.14
519	0.13
520	0.12
521	0.09
522	0.14
523	0.19
524	0.24
525	0.27
526	0.3
527	0.35
528	0.43
529	0.5
530	0.52
531	0.52
532	0.5
533	0.51
534	0.48
535	0.45
536	0.38
537	0.3
538	0.22
539	0.2
540	0.21
541	0.2
542	0.21
543	0.26
544	0.32
545	0.39
546	0.47
547	0.53
548	0.52
549	0.56
550	0.59
551	0.6
552	0.59
553	0.55
554	0.48
555	0.42
556	0.38
557	0.3
558	0.26
559	0.17
560	0.1
561	0.08
562	0.06
563	0.04
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.1
570	0.16
571	0.19
572	0.21
573	0.28
574	0.35
575	0.43
576	0.5
577	0.54
578	0.58
579	0.65
580	0.66
581	0.65
582	0.6
583	0.57
584	0.56
585	0.51
586	0.42
587	0.34
588	0.32
589	0.29
590	0.28
591	0.26
592	0.23
593	0.24
594	0.3
595	0.34
596	0.34
597	0.34
598	0.36
599	0.36
600	0.37
601	0.34
602	0.3
603	0.29
604	0.27
605	0.26
606	0.24
607	0.22
608	0.19
609	0.19
610	0.23
611	0.23
612	0.24
613	0.25
614	0.24
615	0.26
616	0.28
617	0.27
618	0.2
619	0.17
620	0.17
621	0.17
622	0.17
623	0.15
624	0.13
625	0.13
626	0.13
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.06
636	0.08
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.09
643	0.11
644	0.11
645	0.16
646	0.2
647	0.25
648	0.28
649	0.35
650	0.4
651	0.42
652	0.48
653	0.45
654	0.44
655	0.43
656	0.41
657	0.37
658	0.39
659	0.38
660	0.31
661	0.36
662	0.39
663	0.41
664	0.48
665	0.53
666	0.48
667	0.53
668	0.56
669	0.51
670	0.45
671	0.39
672	0.31
673	0.27
674	0.26
675	0.21
676	0.17
677	0.17
678	0.24
679	0.31
680	0.39
681	0.41
682	0.42
683	0.5
684	0.58

A0A3N4LKP7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer