Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1WVC1

Protein Details
Accession K1WVC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-329KAEKSPKTPGMAKPKRRKSKAVGATPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-327SPLKTNIPAERKGSKAEKSPKTPGMAKPKRRKSKAVGATP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.833, cyto 11, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG mbe:MBM_05711  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MASQDLPLDEIQWKSTVLAQQMQGVHENSVLHYFSHSPFFDQTSNNAILASQATFNPNLFEVLQTRAAFEGRLKTMSGLEFVIAEQPEEMAPGTGTGIWVIRKQTRRKVPSEEDEITIHSNYFVVGDNIYMASTVADILCNRTMAIISSLNKVATSMTTLPDFSPALGHVYIPPPTSKRGKNVEPQLSRASKENTPLPEPLQASQKPPPAAATIGSNYLDNRVLEEAINASMTYGDDYMDAIPVTGQPGDFHFSSTGREAKDKLMVPGPVKGPLHVPSKTAKPVPAPSPLKTNIPAERKGSKAEKSPKTPGMAKPKRRKSKAVGATPAASPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.2
3 0.22
4 0.22
5 0.26
6 0.25
7 0.3
8 0.31
9 0.32
10 0.32
11 0.29
12 0.26
13 0.23
14 0.22
15 0.18
16 0.19
17 0.18
18 0.14
19 0.15
20 0.17
21 0.17
22 0.23
23 0.22
24 0.22
25 0.23
26 0.27
27 0.28
28 0.27
29 0.28
30 0.27
31 0.28
32 0.25
33 0.23
34 0.19
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.16
50 0.21
51 0.19
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.21
58 0.17
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.1
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.09
87 0.13
88 0.19
89 0.27
90 0.35
91 0.44
92 0.53
93 0.58
94 0.61
95 0.66
96 0.67
97 0.66
98 0.67
99 0.6
100 0.51
101 0.46
102 0.42
103 0.35
104 0.27
105 0.2
106 0.12
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.15
163 0.21
164 0.22
165 0.28
166 0.33
167 0.37
168 0.44
169 0.52
170 0.57
171 0.53
172 0.54
173 0.54
174 0.49
175 0.45
176 0.4
177 0.35
178 0.27
179 0.29
180 0.3
181 0.26
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.27
186 0.26
187 0.25
188 0.27
189 0.26
190 0.27
191 0.31
192 0.34
193 0.3
194 0.29
195 0.29
196 0.23
197 0.22
198 0.19
199 0.17
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.16
242 0.19
243 0.21
244 0.19
245 0.22
246 0.22
247 0.23
248 0.29
249 0.28
250 0.28
251 0.29
252 0.31
253 0.3
254 0.33
255 0.32
256 0.32
257 0.31
258 0.28
259 0.27
260 0.29
261 0.33
262 0.29
263 0.3
264 0.28
265 0.34
266 0.4
267 0.39
268 0.37
269 0.37
270 0.43
271 0.45
272 0.51
273 0.49
274 0.45
275 0.49
276 0.49
277 0.47
278 0.44
279 0.47
280 0.45
281 0.47
282 0.49
283 0.47
284 0.5
285 0.48
286 0.52
287 0.52
288 0.49
289 0.53
290 0.58
291 0.62
292 0.64
293 0.7
294 0.69
295 0.69
296 0.7
297 0.69
298 0.7
299 0.71
300 0.74
301 0.77
302 0.82
303 0.87
304 0.87
305 0.88
306 0.85
307 0.86
308 0.85
309 0.84
310 0.82
311 0.75
312 0.71
313 0.65