Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Y2K1

Protein Details
Accession A0A4P9Y2K1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-216FTGKATKATKGKKTQKPKVHLDIQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-80ARRGGGARRGGGRPGPSGGRAGEDRAPADYPRGSQEGSRPPRRTGGPRGAPREGGARGGRAPRREF
203-203K
226-249RSSRGGPRPNAPRGGKGPSAGGRR
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 8.5, nucl 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences KTQATPAKANNGGDARRGGGARRGGGRPGPSGGRAGEDRAPADYPRGSQEGSRPPRRTGGPRGAPREGGARGGRAPRREFDRHSGTGRVPSENKKDAGWGNASDELQASAKEGAVPGALNTDVSTTESTAPAVVEEEEKVKTLDEYLAEKTSRAAKITALPEVRKAGEGTSGKGDNKWKDAKAYERVEQDFFTGKATKATKGKKTQKPKVHLDIQQRFVEGDDTRRSSRGGPRPNAPRGGKGPSAGGRRAGVNVDDSRAFPELGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.31
3 0.3
4 0.3
5 0.25
6 0.26
7 0.29
8 0.3
9 0.34
10 0.34
11 0.35
12 0.39
13 0.4
14 0.36
15 0.35
16 0.33
17 0.29
18 0.29
19 0.26
20 0.26
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.24
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.21
29 0.23
30 0.21
31 0.18
32 0.2
33 0.22
34 0.2
35 0.21
36 0.28
37 0.35
38 0.42
39 0.51
40 0.5
41 0.5
42 0.55
43 0.59
44 0.59
45 0.57
46 0.59
47 0.59
48 0.64
49 0.68
50 0.65
51 0.6
52 0.53
53 0.49
54 0.39
55 0.35
56 0.27
57 0.22
58 0.23
59 0.3
60 0.33
61 0.34
62 0.36
63 0.35
64 0.41
65 0.45
66 0.46
67 0.46
68 0.5
69 0.48
70 0.48
71 0.47
72 0.41
73 0.42
74 0.39
75 0.35
76 0.31
77 0.34
78 0.38
79 0.39
80 0.38
81 0.32
82 0.34
83 0.31
84 0.3
85 0.27
86 0.2
87 0.19
88 0.21
89 0.2
90 0.17
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.2
144 0.21
145 0.25
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.19
152 0.18
153 0.13
154 0.17
155 0.18
156 0.17
157 0.19
158 0.22
159 0.21
160 0.24
161 0.29
162 0.25
163 0.3
164 0.33
165 0.3
166 0.32
167 0.36
168 0.39
169 0.42
170 0.44
171 0.44
172 0.44
173 0.45
174 0.42
175 0.39
176 0.34
177 0.28
178 0.24
179 0.22
180 0.18
181 0.16
182 0.21
183 0.23
184 0.26
185 0.32
186 0.39
187 0.45
188 0.54
189 0.64
190 0.67
191 0.77
192 0.82
193 0.84
194 0.84
195 0.84
196 0.82
197 0.81
198 0.78
199 0.78
200 0.76
201 0.72
202 0.66
203 0.57
204 0.48
205 0.4
206 0.37
207 0.27
208 0.25
209 0.26
210 0.29
211 0.3
212 0.31
213 0.31
214 0.33
215 0.42
216 0.45
217 0.49
218 0.5
219 0.57
220 0.65
221 0.7
222 0.74
223 0.67
224 0.64
225 0.59
226 0.6
227 0.54
228 0.46
229 0.46
230 0.44
231 0.47
232 0.42
233 0.4
234 0.35
235 0.34
236 0.35
237 0.31
238 0.25
239 0.25
240 0.24
241 0.25
242 0.24
243 0.23
244 0.25
245 0.24