Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IYI6

Protein Details
Accession A0A4V1IYI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-211VSNPCSPRSQKRRERDFCSICHydrophilic
475-494RRIGVRYDHRHRRTNVQRLKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16448  RING-H2  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTTDIPTELFIRLSPFLSPTDTLPRGYRETPAFLFEPIEKRVRAGRPILIGSKPWSVRTCATPDLEARSIKLKSSLVDAEHAALWLKEGNPCIIDVSAGFGTDCIQLGVEGVDNNGKLLRVRILVELLGEDDHIKIDMKKAHEWMTHPITIRLLAKNRNSSLASLLAFLQPNSRQSIKREGHEGLPGDGSVSNPCSPRSQKRRERDFCSICLVQLERSNVVKTSCGHAFHYLCIQQMTEQNHESHGVTGLVYRSRIFNCPLCRQRVDLGEEARDEDGGETYESAEEDLPTEEGRGPKEGVSMERRMERVEQMMSVMTLTLLSNLGTKERVGSSKDTKASRGSQSGLGLVNENNMDQLEGEGSSGALESSHPMNPASNASRPRVPKNIHSTHVSLMGGQGKEALDHSSPSRTVWIGGLGDKDPTRDQIIEIFEGVTNVRFVFHPDGMRKPYIFVDFSSEATAARALRLDGTFILGRRIGVRYDHRHRRTNVQRLKASSSTAEEDSKDNSSDYLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.2
5 0.21
6 0.21
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.32
11 0.35
12 0.38
13 0.38
14 0.41
15 0.35
16 0.4
17 0.38
18 0.39
19 0.36
20 0.31
21 0.32
22 0.3
23 0.31
24 0.29
25 0.33
26 0.28
27 0.3
28 0.37
29 0.4
30 0.42
31 0.42
32 0.42
33 0.42
34 0.47
35 0.49
36 0.43
37 0.4
38 0.37
39 0.4
40 0.37
41 0.37
42 0.35
43 0.34
44 0.36
45 0.38
46 0.4
47 0.37
48 0.38
49 0.36
50 0.36
51 0.39
52 0.4
53 0.35
54 0.31
55 0.33
56 0.31
57 0.29
58 0.31
59 0.26
60 0.22
61 0.27
62 0.29
63 0.24
64 0.26
65 0.25
66 0.22
67 0.21
68 0.2
69 0.15
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.09
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.12
124 0.16
125 0.19
126 0.23
127 0.26
128 0.31
129 0.33
130 0.35
131 0.37
132 0.38
133 0.38
134 0.36
135 0.34
136 0.29
137 0.29
138 0.3
139 0.27
140 0.27
141 0.3
142 0.35
143 0.41
144 0.41
145 0.42
146 0.4
147 0.36
148 0.33
149 0.29
150 0.23
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.16
157 0.14
158 0.16
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.25
163 0.35
164 0.35
165 0.36
166 0.39
167 0.37
168 0.35
169 0.37
170 0.34
171 0.25
172 0.22
173 0.19
174 0.15
175 0.14
176 0.12
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.18
183 0.23
184 0.32
185 0.42
186 0.5
187 0.57
188 0.67
189 0.77
190 0.8
191 0.82
192 0.83
193 0.76
194 0.68
195 0.65
196 0.54
197 0.43
198 0.37
199 0.3
200 0.21
201 0.21
202 0.2
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.14
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.22
215 0.22
216 0.21
217 0.23
218 0.2
219 0.18
220 0.17
221 0.15
222 0.12
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.19
231 0.14
232 0.12
233 0.09
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.22
246 0.31
247 0.35
248 0.38
249 0.38
250 0.38
251 0.38
252 0.38
253 0.37
254 0.31
255 0.28
256 0.25
257 0.24
258 0.23
259 0.2
260 0.15
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.15
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.23
291 0.23
292 0.23
293 0.24
294 0.21
295 0.19
296 0.17
297 0.15
298 0.13
299 0.13
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.14
318 0.19
319 0.24
320 0.3
321 0.36
322 0.35
323 0.35
324 0.38
325 0.4
326 0.39
327 0.37
328 0.32
329 0.29
330 0.29
331 0.29
332 0.25
333 0.2
334 0.17
335 0.14
336 0.14
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.05
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.17
362 0.19
363 0.23
364 0.26
365 0.28
366 0.34
367 0.38
368 0.43
369 0.47
370 0.47
371 0.5
372 0.56
373 0.59
374 0.56
375 0.56
376 0.53
377 0.45
378 0.46
379 0.37
380 0.27
381 0.23
382 0.25
383 0.21
384 0.18
385 0.18
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.1
391 0.12
392 0.14
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.19
397 0.16
398 0.17
399 0.16
400 0.17
401 0.14
402 0.16
403 0.17
404 0.15
405 0.18
406 0.18
407 0.2
408 0.18
409 0.19
410 0.21
411 0.19
412 0.19
413 0.21
414 0.24
415 0.22
416 0.21
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.12
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.08
426 0.13
427 0.17
428 0.2
429 0.26
430 0.29
431 0.36
432 0.41
433 0.44
434 0.4
435 0.37
436 0.38
437 0.36
438 0.33
439 0.27
440 0.3
441 0.28
442 0.28
443 0.28
444 0.24
445 0.19
446 0.19
447 0.21
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.13
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.21
460 0.18
461 0.19
462 0.2
463 0.21
464 0.19
465 0.24
466 0.33
467 0.39
468 0.49
469 0.6
470 0.64
471 0.72
472 0.74
473 0.78
474 0.79
475 0.8
476 0.79
477 0.78
478 0.78
479 0.74
480 0.78
481 0.69
482 0.62
483 0.55
484 0.5
485 0.44
486 0.4
487 0.38
488 0.32
489 0.31
490 0.31
491 0.3
492 0.27
493 0.22