Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Y9K6

Protein Details
Accession A0A4P9Y9K6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-199PTPTQPIRSRAGKKRRRAGSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-195RSRAGKKRRRA
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 7, cyto_mito 7, mito 4, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004871  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C  
IPR018846  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03178  CPSF_A  
PF10433  MMS1_N  
Amino Acid Sequences MPIPSGYYLSTLSPATSVVASLTAHLIDASTEDLVVVHVSSVAIYRRVKDRLQSLKTLSIHGHIHTARIYRPENRDTDILFILTDTCRVTFIAFDTPHFTHHVLAKGDFHDVVYRSPQHGLLLDINSSSTWATLHLSQRTLKFLPLTSDKLSNGDLVPGEAFNVPIEEARLIDLSFLPTPTQPIRSRAGKKRRRAGSAQPSPLSPSVLILWQNEQGGRHLSLYTLNVHSRELKKDRRFMHHVSKTSHKLIPIPEDGSILLSTEQGSLYAIKITDQGCNSSTTPSKKGPQNFNRADRKSNCVILAVGDAVPPTSLALLGEDTLFVGSHDADSCLVKLDSSLWKPLLADSTLKWGPLSIMDSLHNLASLSDMCFVNRGKDGSGDKQLVTCSGFGQYGSLRVLRAGIGMAEVVDMELPGIQRMWCLNNRTREEEVDDQSSKTPTRILLGFMSETRLISFSHGAEDKEVGDWSQAEQVSLPPLTGSCTTWLVAPLITASPASRYEISTKSPFLHVTAEEARVIAIGEEIGPPDSLSAQILDRWGNSVAVVHKGGSHLSLLQATEDTKRSTWALKEHGGYYFSQQVSCLDMGITDRVAVGLWNDFSVQILIIHPDGTMHPILQCDHPSLPRSVIMCSWDDDNGMKDQKAMPIDHTIISSTFLISALGDGQIYTREITMDEPSLGKPSIEVVGRNAAVLQSMEIVNPGGRTKVIFTAGAEWPRLIHPRGSLTRDTAGRPYSNIIRPSITLVHSQAPSQLAHAHILPLPITSASQAMAYASPEELGIGRMDALSQVQTRTLMLSELPGFKPATGLGKEHEGEEPRRIIHCGASMASLAILTLGRCPDESAVLSGTDSSIIHSRLILIDDGQEDFRVLDSVDFQRHEGGYSLAFGSFSSHTSRNYLIVGTAFDEVDREGICTRGRILVYEIIGSGMNDRRLRTVHAFVVPGAVLGLAITHNALEDESMKDGWASGLLMAGVADRLVGFRWHETEERLEVQSSLGGFTQVLSLSPSCSGDAIVSVGDMMWGSSIIRFDPLASPASLDNGRRGGLVKVAGHSETVWTTAMTMAHDTVVVLGDMEGNIRIKGQLSFMDTSGGILEQESRTEMEETRVPGLADKMDRLIPLSSYHLGQQINRIIPGKRGLDLVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.08
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.05
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.09
29 0.11
30 0.17
31 0.19
32 0.23
33 0.29
34 0.34
35 0.38
36 0.42
37 0.49
38 0.54
39 0.57
40 0.6
41 0.58
42 0.62
43 0.6
44 0.56
45 0.48
46 0.42
47 0.39
48 0.33
49 0.36
50 0.28
51 0.29
52 0.3
53 0.31
54 0.29
55 0.34
56 0.38
57 0.38
58 0.45
59 0.5
60 0.5
61 0.51
62 0.52
63 0.45
64 0.45
65 0.38
66 0.31
67 0.24
68 0.2
69 0.18
70 0.15
71 0.15
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.2
80 0.2
81 0.21
82 0.26
83 0.27
84 0.28
85 0.3
86 0.28
87 0.23
88 0.27
89 0.32
90 0.29
91 0.3
92 0.32
93 0.3
94 0.32
95 0.28
96 0.24
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.26
101 0.27
102 0.27
103 0.28
104 0.28
105 0.25
106 0.25
107 0.26
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.16
115 0.13
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.1
120 0.15
121 0.21
122 0.24
123 0.27
124 0.32
125 0.34
126 0.39
127 0.37
128 0.35
129 0.31
130 0.29
131 0.33
132 0.34
133 0.36
134 0.33
135 0.36
136 0.34
137 0.34
138 0.33
139 0.28
140 0.23
141 0.2
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.17
167 0.19
168 0.26
169 0.26
170 0.29
171 0.36
172 0.44
173 0.53
174 0.59
175 0.68
176 0.69
177 0.76
178 0.81
179 0.83
180 0.81
181 0.78
182 0.78
183 0.79
184 0.8
185 0.77
186 0.69
187 0.61
188 0.58
189 0.52
190 0.43
191 0.32
192 0.23
193 0.17
194 0.18
195 0.2
196 0.17
197 0.18
198 0.18
199 0.2
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.28
216 0.3
217 0.37
218 0.42
219 0.48
220 0.54
221 0.61
222 0.66
223 0.68
224 0.71
225 0.7
226 0.73
227 0.71
228 0.69
229 0.66
230 0.68
231 0.65
232 0.63
233 0.58
234 0.48
235 0.44
236 0.41
237 0.43
238 0.38
239 0.33
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.23
244 0.19
245 0.13
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.12
259 0.13
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.17
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.27
268 0.27
269 0.31
270 0.34
271 0.4
272 0.44
273 0.52
274 0.58
275 0.62
276 0.68
277 0.71
278 0.76
279 0.79
280 0.75
281 0.76
282 0.68
283 0.66
284 0.59
285 0.54
286 0.45
287 0.36
288 0.33
289 0.25
290 0.22
291 0.17
292 0.12
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.11
324 0.16
325 0.18
326 0.21
327 0.2
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.16
333 0.15
334 0.12
335 0.19
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.12
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.17
365 0.21
366 0.23
367 0.28
368 0.27
369 0.25
370 0.26
371 0.26
372 0.22
373 0.2
374 0.16
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.02
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.07
407 0.11
408 0.14
409 0.2
410 0.26
411 0.34
412 0.38
413 0.42
414 0.43
415 0.4
416 0.42
417 0.41
418 0.38
419 0.34
420 0.32
421 0.27
422 0.27
423 0.27
424 0.22
425 0.18
426 0.16
427 0.12
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.15
434 0.13
435 0.15
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.09
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.06
465 0.06
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.08
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.13
488 0.15
489 0.19
490 0.2
491 0.21
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.18
496 0.17
497 0.14
498 0.16
499 0.16
500 0.16
501 0.15
502 0.14
503 0.13
504 0.11
505 0.11
506 0.06
507 0.04
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.08
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.11
551 0.12
552 0.13
553 0.15
554 0.17
555 0.19
556 0.21
557 0.23
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.2
562 0.18
563 0.19
564 0.16
565 0.15
566 0.14
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.12
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.11
606 0.11
607 0.12
608 0.14
609 0.16
610 0.16
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.15
615 0.15
616 0.15
617 0.14
618 0.13
619 0.13
620 0.11
621 0.11
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.11
628 0.12
629 0.15
630 0.17
631 0.16
632 0.15
633 0.17
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.14
638 0.12
639 0.13
640 0.11
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.07
659 0.08
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.11
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.14
674 0.14
675 0.14
676 0.13
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.07
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.08
693 0.1
694 0.11
695 0.11
696 0.11
697 0.15
698 0.18
699 0.19
700 0.18
701 0.16
702 0.15
703 0.17
704 0.2
705 0.16
706 0.15
707 0.15
708 0.22
709 0.26
710 0.29
711 0.29
712 0.28
713 0.31
714 0.31
715 0.31
716 0.28
717 0.26
718 0.22
719 0.22
720 0.22
721 0.24
722 0.28
723 0.28
724 0.26
725 0.25
726 0.25
727 0.26
728 0.26
729 0.21
730 0.18
731 0.18
732 0.21
733 0.2
734 0.2
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.15
739 0.15
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.12
744 0.12
745 0.12
746 0.11
747 0.09
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.07
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.1
780 0.09
781 0.08
782 0.07
783 0.09
784 0.11
785 0.14
786 0.14
787 0.16
788 0.16
789 0.15
790 0.15
791 0.14
792 0.17
793 0.15
794 0.16
795 0.15
796 0.19
797 0.2
798 0.2
799 0.23
800 0.21
801 0.22
802 0.25
803 0.26
804 0.22
805 0.23
806 0.24
807 0.21
808 0.19
809 0.19
810 0.17
811 0.15
812 0.15
813 0.13
814 0.12
815 0.11
816 0.09
817 0.06
818 0.05
819 0.05
820 0.04
821 0.06
822 0.06
823 0.07
824 0.07
825 0.08
826 0.09
827 0.1
828 0.11
829 0.11
830 0.11
831 0.11
832 0.11
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.08
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.11
842 0.11
843 0.11
844 0.13
845 0.11
846 0.09
847 0.09
848 0.1
849 0.11
850 0.11
851 0.1
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.07
856 0.07
857 0.06
858 0.09
859 0.13
860 0.16
861 0.17
862 0.17
863 0.19
864 0.19
865 0.2
866 0.17
867 0.15
868 0.11
869 0.12
870 0.12
871 0.09
872 0.09
873 0.08
874 0.1
875 0.1
876 0.11
877 0.15
878 0.16
879 0.17
880 0.2
881 0.21
882 0.2
883 0.2
884 0.19
885 0.15
886 0.14
887 0.13
888 0.12
889 0.12
890 0.1
891 0.09
892 0.09
893 0.08
894 0.09
895 0.08
896 0.08
897 0.08
898 0.1
899 0.11
900 0.11
901 0.13
902 0.16
903 0.16
904 0.16
905 0.19
906 0.2
907 0.2
908 0.2
909 0.19
910 0.15
911 0.15
912 0.14
913 0.14
914 0.14
915 0.19
916 0.2
917 0.21
918 0.23
919 0.24
920 0.3
921 0.32
922 0.33
923 0.32
924 0.33
925 0.33
926 0.3
927 0.31
928 0.25
929 0.2
930 0.15
931 0.1
932 0.06
933 0.05
934 0.05
935 0.03
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.04
940 0.04
941 0.05
942 0.05
943 0.06
944 0.08
945 0.1
946 0.1
947 0.1
948 0.1
949 0.1
950 0.09
951 0.09
952 0.07
953 0.05
954 0.06
955 0.06
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.04
961 0.04
962 0.03
963 0.04
964 0.05
965 0.07
966 0.09
967 0.11
968 0.14
969 0.17
970 0.19
971 0.22
972 0.25
973 0.28
974 0.29
975 0.28
976 0.26
977 0.23
978 0.22
979 0.21
980 0.17
981 0.14
982 0.11
983 0.1
984 0.09
985 0.09
986 0.1
987 0.08
988 0.08
989 0.1
990 0.1
991 0.11
992 0.12
993 0.13
994 0.12
995 0.12
996 0.12
997 0.09
998 0.1
999 0.09
1000 0.08
1001 0.07
1002 0.06
1003 0.06
1004 0.05
1005 0.05
1006 0.04
1007 0.04
1008 0.04
1009 0.04
1010 0.06
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.09
1014 0.09
1015 0.11
1016 0.13
1017 0.15
1018 0.16
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.15
1022 0.2
1023 0.22
1024 0.2
1025 0.23
1026 0.22
1027 0.22
1028 0.22
1029 0.23
1030 0.2
1031 0.2
1032 0.23
1033 0.21
1034 0.21
1035 0.23
1036 0.23
1037 0.22
1038 0.21
1039 0.19
1040 0.15
1041 0.15
1042 0.14
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.13
1046 0.13
1047 0.12
1048 0.13
1049 0.12
1050 0.12
1051 0.12
1052 0.11
1053 0.09
1054 0.09
1055 0.08
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.06
1059 0.06
1060 0.07
1061 0.08
1062 0.09
1063 0.09
1064 0.09
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.12
1068 0.14
1069 0.16
1070 0.2
1071 0.22
1072 0.21
1073 0.23
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.19
1077 0.16
1078 0.1
1079 0.09
1080 0.12
1081 0.1
1082 0.11
1083 0.12
1084 0.12
1085 0.14
1086 0.17
1087 0.17
1088 0.18
1089 0.22
1090 0.24
1091 0.25
1092 0.26
1093 0.24
1094 0.24
1095 0.25
1096 0.26
1097 0.24
1098 0.23
1099 0.24
1100 0.24
1101 0.24
1102 0.25
1103 0.23
1104 0.19
1105 0.19
1106 0.23
1107 0.22
1108 0.21
1109 0.23
1110 0.26
1111 0.27
1112 0.27
1113 0.32
1114 0.34
1115 0.35
1116 0.38
1117 0.39
1118 0.35
1119 0.38
1120 0.45
1121 0.39
1122 0.33