Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Y3C5

Protein Details
Accession A0A4P9Y3C5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-265VQIRRKGPGKDKKKIKQEQCKKLYQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-255RRKGPGKDKKKIK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MVVVSQQARAPGCADLKDFLACPMEITRGEFAKALPGILANLEACDFCTVDAEFTGFTTESAQSSHFDSLDDRYAKHRTTAQTYQICQLGLCPFIYHPDTGEYTAHPYNFYVFPRRGATSNDPIGATFAVQATSLEFLRQQNFDLNRWVWHGIGYMTREEEGNRERTQVLADIHVDPPGQAFLDRAHQSIQDWLHHAPGAPTEKYLNLTTSNGYQKRLVFQHVRQRYPDVLDATGMHGFVQIRRKGPGKDKKKIKQEQCKKLYQEWMVKDVGLRSLLDVLVASKKPLVGHNMILDILFIHNTFHSSRPLPSHRSDFIREFHSLHPILFDTKWLAEEADIPWTMGLEDTSIQTLMTTSPRSTISSVQLAPGFDLYQGREKMHEAGYDAYATGLIFLDLIQPLLSSSPFPLFPVNQGYVQIPRPLQAHLNHLYMIKLGSIPFFLGSDEKFKEMEAQIPRREEKENVLLLTLPPGSRIDLRAIQWAISDLGPGVTIQAAGEDRWWVAPVNHSGSGVLTVERLQEVVARDGTLPVYVFKEDLWGTVLATLPPVKREMSSASPSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.23
4 0.24
5 0.23
6 0.2
7 0.2
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.2
12 0.19
13 0.21
14 0.23
15 0.22
16 0.23
17 0.22
18 0.2
19 0.24
20 0.23
21 0.2
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.16
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.16
52 0.18
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.26
58 0.26
59 0.24
60 0.27
61 0.32
62 0.33
63 0.35
64 0.37
65 0.35
66 0.42
67 0.48
68 0.52
69 0.54
70 0.55
71 0.55
72 0.5
73 0.45
74 0.36
75 0.32
76 0.25
77 0.2
78 0.18
79 0.15
80 0.13
81 0.17
82 0.2
83 0.17
84 0.15
85 0.17
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.17
90 0.21
91 0.23
92 0.23
93 0.2
94 0.18
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.25
100 0.28
101 0.31
102 0.33
103 0.32
104 0.35
105 0.39
106 0.39
107 0.41
108 0.39
109 0.35
110 0.33
111 0.32
112 0.26
113 0.19
114 0.12
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.12
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.23
129 0.25
130 0.26
131 0.3
132 0.29
133 0.27
134 0.29
135 0.29
136 0.22
137 0.2
138 0.19
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.18
148 0.18
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.19
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.16
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.08
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.21
177 0.22
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.13
185 0.16
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.19
192 0.19
193 0.16
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.18
198 0.26
199 0.25
200 0.26
201 0.27
202 0.26
203 0.3
204 0.31
205 0.32
206 0.3
207 0.34
208 0.42
209 0.47
210 0.49
211 0.45
212 0.47
213 0.43
214 0.4
215 0.38
216 0.29
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.17
221 0.16
222 0.13
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.23
231 0.27
232 0.3
233 0.4
234 0.47
235 0.49
236 0.56
237 0.65
238 0.7
239 0.77
240 0.82
241 0.82
242 0.83
243 0.84
244 0.85
245 0.82
246 0.81
247 0.73
248 0.69
249 0.65
250 0.6
251 0.56
252 0.47
253 0.44
254 0.37
255 0.34
256 0.3
257 0.23
258 0.18
259 0.12
260 0.1
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.14
275 0.13
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.14
294 0.2
295 0.25
296 0.28
297 0.3
298 0.34
299 0.34
300 0.37
301 0.39
302 0.36
303 0.34
304 0.33
305 0.31
306 0.29
307 0.26
308 0.28
309 0.24
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.2
355 0.19
356 0.16
357 0.13
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.15
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.16
370 0.16
371 0.17
372 0.16
373 0.14
374 0.11
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.15
398 0.2
399 0.2
400 0.19
401 0.2
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.24
406 0.19
407 0.2
408 0.2
409 0.21
410 0.25
411 0.23
412 0.28
413 0.28
414 0.29
415 0.28
416 0.28
417 0.26
418 0.22
419 0.19
420 0.13
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.15
432 0.16
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.22
437 0.21
438 0.27
439 0.3
440 0.36
441 0.4
442 0.45
443 0.47
444 0.44
445 0.47
446 0.42
447 0.39
448 0.4
449 0.38
450 0.33
451 0.32
452 0.3
453 0.27
454 0.28
455 0.23
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.15
460 0.16
461 0.18
462 0.2
463 0.23
464 0.24
465 0.3
466 0.3
467 0.28
468 0.26
469 0.26
470 0.22
471 0.17
472 0.16
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.17
492 0.22
493 0.27
494 0.27
495 0.27
496 0.26
497 0.25
498 0.26
499 0.21
500 0.15
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.09
507 0.12
508 0.14
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.17
513 0.19
514 0.19
515 0.17
516 0.14
517 0.12
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.12
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.17
526 0.15
527 0.14
528 0.16
529 0.18
530 0.12
531 0.15
532 0.19
533 0.17
534 0.19
535 0.21
536 0.2
537 0.2
538 0.23
539 0.27
540 0.3