FuNGI

A0A4V1IYH2

Protein Details

Accession

A0A4V1IYH2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-406	RRAAARHRAKVRQQQRRRVLNHP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
383-400	RRRAAARHRAKVRQQQRR

Subcellular Location(s)

cyto 18, cyto_nucl 11.5, nucl 3, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR010994 RuvA_2-like IPR036860 SH2_dom_sf IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR035420 Spt6_SH2 IPR035019 Spt6_SH2_N IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF14633 SH2_2
CDD	cd09918 SH2_Nterm_SPT6_like

Amino Acid Sequences

MPPIELGQDETALLYLESPRAYREVPGWSRVAKLCLGVARRHQCPAREFSILGLDSIRLLHWHALQHLIPQDQLVEYLERALVDAVSELGVNVNEVALSALATAPYVPGMGPRKVAALIKRSGLIIPSLRSRTDLITLKLMGKWVFMNAAPFLRLRGGVDVLDATRIHPADYELARKMAANARDEEEADPGALHPSDIVRALQDRGETGRLNELNLKDYADMLEARFHQPKRAILEAIKVELQVPYRDHRSAWTPLGPSQAFSLLSRTTDATLHPGVVALIRVTGTRDAPDGGRIVHGVLESGLDVVVRPELQPPPQGGGMERTGIYTPGQMVRGVVTNILKERFLVEASFRPEDVASAINLAARGLHVDPAFDREAEERDTRRRAAARHRAKVRQQQRRRVLNHPLFRQASTNEAESYLADKAPGDCVIRGSSRGTDHIAVTWKVAQGIYEHLDVVEKDKPNEYSMGQRLLVGSFEYADLDDLVVNHVEAMSKLVNELAKHPRCVSTPSLDALHTVLNNRVMAQEGRVAYGFCLNSERAGTFYLSWKYKLGSDPVDWVVKVNPGGYILNKLQYPSVGKLLEGFK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.11
4	0.12
5	0.12
6	0.14
7	0.16
8	0.17
9	0.19
10	0.21
11	0.29
12	0.31
13	0.35
14	0.37
15	0.36
16	0.4
17	0.41
18	0.4
19	0.31
20	0.28
21	0.27
22	0.29
23	0.32
24	0.32
25	0.39
26	0.43
27	0.45
28	0.51
29	0.52
30	0.53
31	0.55
32	0.56
33	0.51
34	0.47
35	0.44
36	0.39
37	0.42
38	0.36
39	0.3
40	0.24
41	0.19
42	0.16
43	0.16
44	0.15
45	0.08
46	0.1
47	0.13
48	0.15
49	0.17
50	0.18
51	0.23
52	0.23
53	0.27
54	0.3
55	0.27
56	0.25
57	0.22
58	0.22
59	0.17
60	0.17
61	0.14
62	0.11
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.08
70	0.07
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.05
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.05
80	0.05
81	0.04
82	0.05
83	0.05
84	0.04
85	0.04
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.05
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.05
94	0.04
95	0.1
96	0.15
97	0.17
98	0.18
99	0.19
100	0.2
101	0.22
102	0.26
103	0.25
104	0.27
105	0.28
106	0.28
107	0.28
108	0.28
109	0.26
110	0.23
111	0.21
112	0.18
113	0.18
114	0.23
115	0.24
116	0.24
117	0.25
118	0.26
119	0.24
120	0.28
121	0.3
122	0.26
123	0.28
124	0.29
125	0.29
126	0.28
127	0.29
128	0.22
129	0.18
130	0.16
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.13
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.12
142	0.11
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.12
150	0.11
151	0.09
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.1
156	0.12
157	0.15
158	0.17
159	0.2
160	0.18
161	0.19
162	0.19
163	0.18
164	0.2
165	0.2
166	0.22
167	0.21
168	0.22
169	0.24
170	0.24
171	0.25
172	0.23
173	0.19
174	0.15
175	0.13
176	0.11
177	0.08
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.09
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.19
197	0.18
198	0.19
199	0.22
200	0.21
201	0.21
202	0.21
203	0.21
204	0.14
205	0.14
206	0.13
207	0.1
208	0.1
209	0.08
210	0.11
211	0.11
212	0.15
213	0.21
214	0.2
215	0.24
216	0.26
217	0.29
218	0.31
219	0.32
220	0.3
221	0.25
222	0.31
223	0.27
224	0.25
225	0.22
226	0.17
227	0.15
228	0.15
229	0.15
230	0.12
231	0.13
232	0.15
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.19
237	0.22
238	0.24
239	0.24
240	0.25
241	0.22
242	0.23
243	0.29
244	0.27
245	0.22
246	0.19
247	0.18
248	0.16
249	0.14
250	0.15
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.07
298	0.08
299	0.1
300	0.12
301	0.13
302	0.15
303	0.15
304	0.15
305	0.13
306	0.15
307	0.14
308	0.13
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.11
313	0.1
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.1
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.13
336	0.17
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.15
342	0.14
343	0.11
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.09
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.13
359	0.14
360	0.12
361	0.13
362	0.11
363	0.14
364	0.17
365	0.2
366	0.19
367	0.25
368	0.29
369	0.29
370	0.32
371	0.33
372	0.35
373	0.42
374	0.5
375	0.54
376	0.59
377	0.66
378	0.69
379	0.74
380	0.79
381	0.79
382	0.79
383	0.79
384	0.81
385	0.83
386	0.85
387	0.81
388	0.79
389	0.79
390	0.78
391	0.76
392	0.69
393	0.67
394	0.59
395	0.55
396	0.51
397	0.4
398	0.35
399	0.29
400	0.27
401	0.19
402	0.18
403	0.17
404	0.15
405	0.16
406	0.13
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.1
412	0.12
413	0.11
414	0.11
415	0.12
416	0.15
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.18
421	0.18
422	0.2
423	0.21
424	0.2
425	0.19
426	0.21
427	0.24
428	0.21
429	0.21
430	0.21
431	0.18
432	0.18
433	0.17
434	0.15
435	0.11
436	0.15
437	0.16
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.14
442	0.13
443	0.16
444	0.18
445	0.17
446	0.18
447	0.22
448	0.23
449	0.24
450	0.26
451	0.24
452	0.27
453	0.29
454	0.32
455	0.29
456	0.28
457	0.27
458	0.25
459	0.24
460	0.16
461	0.12
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.07
470	0.06
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.09
482	0.11
483	0.13
484	0.14
485	0.2
486	0.28
487	0.31
488	0.34
489	0.36
490	0.37
491	0.37
492	0.41
493	0.4
494	0.35
495	0.34
496	0.34
497	0.34
498	0.3
499	0.29
500	0.26
501	0.23
502	0.19
503	0.18
504	0.18
505	0.19
506	0.19
507	0.19
508	0.18
509	0.19
510	0.18
511	0.18
512	0.2
513	0.18
514	0.19
515	0.19
516	0.19
517	0.17
518	0.22
519	0.2
520	0.15
521	0.18
522	0.17
523	0.18
524	0.2
525	0.19
526	0.15
527	0.17
528	0.18
529	0.16
530	0.22
531	0.28
532	0.29
533	0.3
534	0.3
535	0.3
536	0.33
537	0.35
538	0.35
539	0.33
540	0.32
541	0.36
542	0.38
543	0.4
544	0.36
545	0.33
546	0.28
547	0.27
548	0.26
549	0.21
550	0.18
551	0.17
552	0.19
553	0.19
554	0.24
555	0.22
556	0.26
557	0.26
558	0.26
559	0.25
560	0.27
561	0.31
562	0.28
563	0.32
564	0.28
565	0.27

A0A4V1IYH2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer