Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1IYH0

Protein Details
Accession A0A4V1IYH0    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-69GVPFHLRPPAPRPRRSKRRKYTTEQLSILSHydrophilic
108-132RELKCISMRKKAARRKEATREKETTHydrophilic
443-473LRGPEGESKKKERRRRRETRRKGKGTSSQAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-59LRPPAPRPRRSKRRK
116-124RKKAARRKE
449-466ESKKKERRRRRETRRKGK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047152  Caudal_homeobox  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MTIPPKPNPVSSNPLILPVHSSSPQAPPSFHPGTIKPPPGVPFHLRPPAPRPRRSKRRKYTTEQLSILSTAFSQDSSTPSLAHRTLLAHECGISERDVQVWYQNRRARELKCISMRKKAARRKEATREKETTSELETASGTETMNGTEPLNPHEFDQCKEKGGKERIGERHGEKEDARKHHGPIQTSPPKQTNSGRGSGKDSGIDGSSTDSSATSGSRTSNPSTTPSPLSDTSSFMGEKSSTVGGHEGSSQWLDSATVPTTTVVFESPTGMAEKESGYMGDHEDAPKGSSPLSEDMTTESSGNDEGDSRGTNSSMGTSTPSSSSASSSTSTSSSSRASSQMIGEKNRHAPTGRSSRMKSSSLFHGSSHNGREGPSGPSQARDATLPSISTDSIGVSSLPDEGSHPKVTSGPERMSSSFSNPSNGDMAFGSSQEPSSSTTSQLLRGPEGESKKKERRRRRETRRKGKGTSSQAQHHYHHYVHHHHHHYHLHPHATIPLIPGSGSSWKWVSQDGVQLAPDMNSPHPPPTSMAAMSSGDGTSPTDLDRSHPRPQEEAHTPGSPKSPNRTLLWVMRGQEAREDEVEEVGSSAEQEGTSTPDSMAKETDDKEEERDDSSSRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.42
3 0.38
4 0.36
5 0.3
6 0.32
7 0.26
8 0.28
9 0.24
10 0.3
11 0.35
12 0.33
13 0.32
14 0.32
15 0.39
16 0.4
17 0.39
18 0.38
19 0.35
20 0.41
21 0.48
22 0.5
23 0.42
24 0.43
25 0.45
26 0.45
27 0.49
28 0.47
29 0.44
30 0.48
31 0.55
32 0.52
33 0.53
34 0.57
35 0.61
36 0.64
37 0.67
38 0.69
39 0.72
40 0.82
41 0.88
42 0.91
43 0.91
44 0.93
45 0.93
46 0.92
47 0.92
48 0.91
49 0.89
50 0.8
51 0.71
52 0.61
53 0.52
54 0.43
55 0.33
56 0.22
57 0.14
58 0.12
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.18
72 0.22
73 0.26
74 0.26
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.17
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.19
87 0.26
88 0.3
89 0.38
90 0.41
91 0.41
92 0.48
93 0.54
94 0.5
95 0.52
96 0.53
97 0.53
98 0.59
99 0.67
100 0.65
101 0.68
102 0.73
103 0.72
104 0.76
105 0.76
106 0.77
107 0.78
108 0.81
109 0.8
110 0.84
111 0.85
112 0.83
113 0.82
114 0.76
115 0.69
116 0.66
117 0.58
118 0.5
119 0.42
120 0.36
121 0.28
122 0.24
123 0.21
124 0.17
125 0.16
126 0.14
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.15
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.3
144 0.27
145 0.28
146 0.31
147 0.33
148 0.36
149 0.41
150 0.45
151 0.43
152 0.51
153 0.53
154 0.54
155 0.56
156 0.49
157 0.5
158 0.46
159 0.45
160 0.37
161 0.4
162 0.44
163 0.44
164 0.49
165 0.44
166 0.45
167 0.48
168 0.51
169 0.45
170 0.42
171 0.47
172 0.49
173 0.48
174 0.51
175 0.49
176 0.47
177 0.48
178 0.49
179 0.47
180 0.42
181 0.47
182 0.45
183 0.42
184 0.45
185 0.43
186 0.39
187 0.3
188 0.26
189 0.2
190 0.18
191 0.16
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.12
205 0.15
206 0.17
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.25
211 0.26
212 0.25
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.27
217 0.24
218 0.24
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.16
223 0.16
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.12
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.18
328 0.2
329 0.22
330 0.22
331 0.24
332 0.29
333 0.29
334 0.29
335 0.24
336 0.23
337 0.28
338 0.36
339 0.38
340 0.38
341 0.38
342 0.43
343 0.46
344 0.46
345 0.4
346 0.33
347 0.35
348 0.35
349 0.34
350 0.29
351 0.28
352 0.29
353 0.31
354 0.3
355 0.25
356 0.2
357 0.2
358 0.21
359 0.19
360 0.2
361 0.18
362 0.2
363 0.18
364 0.19
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.14
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.1
389 0.13
390 0.15
391 0.15
392 0.15
393 0.17
394 0.2
395 0.23
396 0.25
397 0.23
398 0.25
399 0.28
400 0.29
401 0.3
402 0.29
403 0.28
404 0.29
405 0.28
406 0.28
407 0.25
408 0.26
409 0.24
410 0.22
411 0.19
412 0.13
413 0.14
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.19
426 0.2
427 0.23
428 0.25
429 0.23
430 0.2
431 0.21
432 0.21
433 0.23
434 0.29
435 0.33
436 0.35
437 0.43
438 0.52
439 0.6
440 0.69
441 0.74
442 0.79
443 0.83
444 0.89
445 0.91
446 0.93
447 0.95
448 0.96
449 0.96
450 0.94
451 0.89
452 0.86
453 0.84
454 0.82
455 0.79
456 0.74
457 0.7
458 0.69
459 0.68
460 0.61
461 0.57
462 0.52
463 0.44
464 0.43
465 0.41
466 0.43
467 0.45
468 0.53
469 0.54
470 0.51
471 0.56
472 0.58
473 0.57
474 0.57
475 0.55
476 0.5
477 0.43
478 0.43
479 0.39
480 0.34
481 0.3
482 0.23
483 0.19
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.16
489 0.15
490 0.16
491 0.16
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.21
496 0.19
497 0.25
498 0.24
499 0.24
500 0.23
501 0.22
502 0.21
503 0.19
504 0.18
505 0.14
506 0.13
507 0.16
508 0.18
509 0.21
510 0.22
511 0.23
512 0.23
513 0.25
514 0.27
515 0.23
516 0.22
517 0.21
518 0.21
519 0.2
520 0.18
521 0.15
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.15
531 0.24
532 0.29
533 0.37
534 0.42
535 0.45
536 0.47
537 0.5
538 0.54
539 0.51
540 0.5
541 0.46
542 0.45
543 0.43
544 0.42
545 0.45
546 0.42
547 0.41
548 0.44
549 0.47
550 0.47
551 0.5
552 0.53
553 0.53
554 0.54
555 0.55
556 0.51
557 0.46
558 0.47
559 0.46
560 0.41
561 0.41
562 0.36
563 0.34
564 0.3
565 0.3
566 0.23
567 0.22
568 0.22
569 0.16
570 0.14
571 0.1
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.12
580 0.14
581 0.14
582 0.14
583 0.18
584 0.19
585 0.2
586 0.21
587 0.21
588 0.25
589 0.26
590 0.31
591 0.31
592 0.31
593 0.34
594 0.36
595 0.34
596 0.32
597 0.32