Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Y7N9

Protein Details
Accession A0A4P9Y7N9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
434-463EKEDRRKAAAKRRKMQQRQRQQGQRPREGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
432-453RREKEDRRKAAAKRRKMQQRQR
894-911RGGRGRGRGGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.5, nucl 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLATKYPKVSSQVAEEPVREINGITLPIDISRPNPNGEEYDNLYLDMNNVVHPCCHPEDKPAPDTEEEMMLEVFKYIDRLMSMIRPRKVLYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAQEKRDAEDKETKAANDDEEEEEDEEKEKEEELRAGMDEDESPFVDVKTGKKHFDSNCITPGTPFMSKLAACLRYYVIRKLNTDPGWKHLKVILSDASVPGEGEHKIMDFIRRQRNSPGYNPNTMHVLYGLDADLIMLALATHEPYFKILREDVFAGQNGPDKCFACGGTGHFADSCPGKEALAAAKAEDGEDKPDKAQTPYVFLHVNVLREYLEIELRIADSGFPFDLERALDDWVFLCYFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLVDIWKRSLPHMGGYVTDSGEANLTRLQLICTELGQIEDKVFVERREKEDRRKAAAKRRKMQQRQRQQGQRPREGQGSSQPAPVNGEMSSFLPQGVDMASSSAMQLFSSKDPNPRAHPQPADKKANQSAAAALKSSLKKEVSTTEGSSEPTVIGKKRHLEEETTTEEEKAQGQAKVEEKPTKVVVEGDDIPKAVPKPKEPQADEDEEPEDNVRLWETGFKERYYRGKFGAELSDTELRQSLVRSYVEGLCWVLKYYYQGVPSWKWYYPYHYAPFASDFEGLGDMEFKFELGKPFKPFEQLMGVFPAASRSHLPTPFHHLMTQPSSEIHDFYPVNFDLDMNGKKFLWQAVILLPFIDEDRLLNALTPLYDQLTPEEKVRNSHGQDVLFVGQANASLYDTMCRLYGTEQDEVVDEEGRIALDPKVSQGLLGLVAKEPSFVPEATYPSPLEAYGLDELKHNQAINACYWNPLIAAGQFPAQLHPQVQMPARVLQSVDRNFLHEYRQSQMRGGRGRGRGGRGRGRGRGGMETYAPHQEQAMQHNVYYNRNGGGQEAPPSQYGQGYPTHAYPAQGGYPTQGYHPSPQAYGMPGGGAQQGGGWGGGNNGGWGGGGGGYGQPGVPRGGPPPSRYSQYNGTYSQGRGGGGYGQNPGSTGFEGGRYQGGGGRGGGGGGNGYPQSGYGRGGRGGGGRGGRGGYGGWGNGGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.49
4 0.51
5 0.48
6 0.48
7 0.48
8 0.49
9 0.47
10 0.42
11 0.39
12 0.36
13 0.34
14 0.27
15 0.2
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.21
27 0.23
28 0.25
29 0.27
30 0.29
31 0.31
32 0.32
33 0.34
34 0.31
35 0.34
36 0.31
37 0.3
38 0.28
39 0.24
40 0.22
41 0.2
42 0.16
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.21
49 0.23
50 0.28
51 0.26
52 0.34
53 0.42
54 0.48
55 0.52
56 0.5
57 0.49
58 0.45
59 0.46
60 0.38
61 0.33
62 0.26
63 0.22
64 0.19
65 0.15
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.2
77 0.29
78 0.36
79 0.38
80 0.4
81 0.41
82 0.44
83 0.44
84 0.4
85 0.35
86 0.34
87 0.32
88 0.3
89 0.3
90 0.26
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.12
95 0.15
96 0.21
97 0.29
98 0.39
99 0.47
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.79
104 0.81
105 0.78
106 0.74
107 0.75
108 0.74
109 0.72
110 0.75
111 0.73
112 0.68
113 0.7
114 0.64
115 0.55
116 0.53
117 0.44
118 0.4
119 0.42
120 0.4
121 0.4
122 0.42
123 0.4
124 0.37
125 0.37
126 0.32
127 0.25
128 0.26
129 0.22
130 0.21
131 0.23
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.17
159 0.25
160 0.3
161 0.32
162 0.34
163 0.42
164 0.42
165 0.5
166 0.53
167 0.48
168 0.49
169 0.49
170 0.46
171 0.38
172 0.38
173 0.33
174 0.27
175 0.23
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.21
180 0.26
181 0.25
182 0.23
183 0.25
184 0.26
185 0.29
186 0.32
187 0.37
188 0.37
189 0.37
190 0.4
191 0.43
192 0.5
193 0.48
194 0.53
195 0.47
196 0.47
197 0.51
198 0.48
199 0.45
200 0.39
201 0.39
202 0.32
203 0.34
204 0.31
205 0.25
206 0.25
207 0.24
208 0.21
209 0.17
210 0.16
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.15
220 0.19
221 0.28
222 0.38
223 0.4
224 0.42
225 0.49
226 0.57
227 0.57
228 0.59
229 0.61
230 0.56
231 0.61
232 0.6
233 0.52
234 0.47
235 0.42
236 0.34
237 0.24
238 0.19
239 0.12
240 0.12
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.02
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.08
257 0.1
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.18
263 0.2
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.17
268 0.17
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.15
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.15
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.26
310 0.21
311 0.25
312 0.25
313 0.27
314 0.25
315 0.23
316 0.28
317 0.24
318 0.25
319 0.19
320 0.19
321 0.16
322 0.15
323 0.16
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.06
373 0.04
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.15
383 0.14
384 0.16
385 0.19
386 0.19
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.17
418 0.2
419 0.25
420 0.35
421 0.4
422 0.48
423 0.56
424 0.6
425 0.61
426 0.66
427 0.67
428 0.68
429 0.72
430 0.73
431 0.71
432 0.75
433 0.79
434 0.81
435 0.85
436 0.84
437 0.86
438 0.86
439 0.88
440 0.88
441 0.87
442 0.85
443 0.83
444 0.81
445 0.73
446 0.66
447 0.61
448 0.52
449 0.44
450 0.42
451 0.41
452 0.33
453 0.33
454 0.3
455 0.26
456 0.27
457 0.26
458 0.2
459 0.12
460 0.12
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.12
483 0.14
484 0.19
485 0.23
486 0.26
487 0.31
488 0.36
489 0.4
490 0.42
491 0.44
492 0.47
493 0.53
494 0.57
495 0.59
496 0.54
497 0.54
498 0.52
499 0.51
500 0.44
501 0.35
502 0.3
503 0.25
504 0.24
505 0.19
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.17
510 0.17
511 0.15
512 0.15
513 0.16
514 0.18
515 0.18
516 0.19
517 0.19
518 0.18
519 0.18
520 0.18
521 0.17
522 0.15
523 0.11
524 0.09
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.18
530 0.19
531 0.23
532 0.23
533 0.24
534 0.25
535 0.28
536 0.29
537 0.27
538 0.26
539 0.22
540 0.21
541 0.19
542 0.17
543 0.15
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.15
548 0.17
549 0.19
550 0.22
551 0.24
552 0.22
553 0.23
554 0.24
555 0.21
556 0.19
557 0.17
558 0.14
559 0.14
560 0.15
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.15
568 0.15
569 0.17
570 0.23
571 0.31
572 0.39
573 0.39
574 0.43
575 0.43
576 0.47
577 0.44
578 0.39
579 0.33
580 0.25
581 0.23
582 0.18
583 0.13
584 0.08
585 0.08
586 0.06
587 0.05
588 0.05
589 0.09
590 0.11
591 0.17
592 0.19
593 0.2
594 0.22
595 0.25
596 0.33
597 0.35
598 0.35
599 0.3
600 0.31
601 0.31
602 0.31
603 0.32
604 0.24
605 0.19
606 0.21
607 0.22
608 0.2
609 0.19
610 0.17
611 0.14
612 0.13
613 0.13
614 0.11
615 0.1
616 0.11
617 0.11
618 0.13
619 0.13
620 0.13
621 0.13
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.07
627 0.07
628 0.09
629 0.12
630 0.14
631 0.15
632 0.16
633 0.19
634 0.21
635 0.25
636 0.27
637 0.24
638 0.25
639 0.25
640 0.29
641 0.32
642 0.36
643 0.34
644 0.33
645 0.33
646 0.3
647 0.32
648 0.27
649 0.22
650 0.16
651 0.14
652 0.11
653 0.12
654 0.1
655 0.08
656 0.08
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.07
663 0.13
664 0.15
665 0.19
666 0.22
667 0.24
668 0.25
669 0.29
670 0.28
671 0.24
672 0.28
673 0.24
674 0.22
675 0.23
676 0.22
677 0.18
678 0.17
679 0.18
680 0.11
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.18
685 0.22
686 0.25
687 0.24
688 0.33
689 0.35
690 0.35
691 0.32
692 0.28
693 0.29
694 0.3
695 0.29
696 0.2
697 0.17
698 0.19
699 0.18
700 0.18
701 0.14
702 0.16
703 0.15
704 0.15
705 0.19
706 0.16
707 0.17
708 0.16
709 0.15
710 0.11
711 0.16
712 0.19
713 0.15
714 0.16
715 0.15
716 0.16
717 0.17
718 0.17
719 0.14
720 0.11
721 0.12
722 0.14
723 0.16
724 0.15
725 0.14
726 0.13
727 0.11
728 0.11
729 0.1
730 0.06
731 0.04
732 0.06
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.08
744 0.11
745 0.15
746 0.16
747 0.18
748 0.22
749 0.21
750 0.24
751 0.29
752 0.34
753 0.32
754 0.38
755 0.39
756 0.34
757 0.33
758 0.33
759 0.28
760 0.21
761 0.19
762 0.12
763 0.09
764 0.09
765 0.08
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.08
777 0.13
778 0.16
779 0.17
780 0.16
781 0.17
782 0.17
783 0.17
784 0.17
785 0.12
786 0.09
787 0.07
788 0.08
789 0.07
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.08
794 0.08
795 0.09
796 0.11
797 0.11
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.1
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.1
806 0.1
807 0.1
808 0.09
809 0.09
810 0.11
811 0.1
812 0.12
813 0.14
814 0.19
815 0.2
816 0.22
817 0.21
818 0.19
819 0.2
820 0.17
821 0.15
822 0.11
823 0.12
824 0.12
825 0.13
826 0.12
827 0.13
828 0.15
829 0.17
830 0.19
831 0.16
832 0.15
833 0.18
834 0.19
835 0.2
836 0.24
837 0.21
838 0.21
839 0.21
840 0.2
841 0.16
842 0.15
843 0.14
844 0.09
845 0.1
846 0.09
847 0.1
848 0.11
849 0.11
850 0.12
851 0.13
852 0.14
853 0.13
854 0.14
855 0.15
856 0.18
857 0.2
858 0.22
859 0.22
860 0.25
861 0.25
862 0.24
863 0.23
864 0.22
865 0.29
866 0.28
867 0.31
868 0.27
869 0.29
870 0.31
871 0.32
872 0.32
873 0.28
874 0.28
875 0.28
876 0.34
877 0.32
878 0.34
879 0.37
880 0.4
881 0.42
882 0.45
883 0.48
884 0.46
885 0.52
886 0.53
887 0.57
888 0.56
889 0.58
890 0.61
891 0.62
892 0.65
893 0.63
894 0.62
895 0.59
896 0.55
897 0.53
898 0.46
899 0.39
900 0.34
901 0.3
902 0.28
903 0.3
904 0.27
905 0.22
906 0.2
907 0.22
908 0.24
909 0.27
910 0.32
911 0.27
912 0.27
913 0.33
914 0.35
915 0.34
916 0.34
917 0.3
918 0.24
919 0.25
920 0.25
921 0.21
922 0.22
923 0.2
924 0.23
925 0.23
926 0.24
927 0.23
928 0.24
929 0.22
930 0.21
931 0.19
932 0.16
933 0.17
934 0.2
935 0.21
936 0.21
937 0.25
938 0.24
939 0.24
940 0.23
941 0.22
942 0.21
943 0.2
944 0.19
945 0.17
946 0.19
947 0.18
948 0.18
949 0.21
950 0.21
951 0.25
952 0.3
953 0.29
954 0.28
955 0.29
956 0.3
957 0.26
958 0.25
959 0.2
960 0.15
961 0.13
962 0.14
963 0.13
964 0.11
965 0.08
966 0.07
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.06
971 0.05
972 0.06
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.06
977 0.06
978 0.06
979 0.05
980 0.05
981 0.04
982 0.04
983 0.04
984 0.05
985 0.05
986 0.05
987 0.06
988 0.06
989 0.07
990 0.09
991 0.1
992 0.12
993 0.15
994 0.24
995 0.28
996 0.32
997 0.38
998 0.4
999 0.44
1000 0.45
1001 0.48
1002 0.48
1003 0.5
1004 0.51
1005 0.46
1006 0.45
1007 0.44
1008 0.42
1009 0.41
1010 0.34
1011 0.28
1012 0.22
1013 0.21
1014 0.24
1015 0.22
1016 0.23
1017 0.22
1018 0.21
1019 0.21
1020 0.21
1021 0.21
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.15
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.16
1028 0.17
1029 0.17
1030 0.15
1031 0.15
1032 0.16
1033 0.17
1034 0.16
1035 0.15
1036 0.15
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.13
1040 0.1
1041 0.09
1042 0.07
1043 0.09
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.08
1047 0.08
1048 0.11
1049 0.12
1050 0.15
1051 0.16
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.22
1055 0.23
1056 0.23
1057 0.24
1058 0.26
1059 0.25
1060 0.22
1061 0.22
1062 0.22
1063 0.2
1064 0.18
1065 0.16
1066 0.14
1067 0.14
1068 0.13