FuNGI

A0A4P9Y177

Protein Details

Accession

A0A4P9Y177

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-24	SNPGRFTRGKGKQAARSGRG	Hydrophilic
514-533	GADKERKKKRDGPSGFKDPD	Basic
555-576	EVVNRLRLKLQKDPRNKKQAYQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-24	GKGKQAARSGRG
517-523	KERKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTLTSNPGRFTRGKGKQAARSGRGAQPPARAPAPSEPTKMAEEQYTTEVYSILSSDKEKTVRQHLMRLQSHLSTDPKDFTPPIKLVKRNVYNRELQEEKEAAELAAKEALEAKARAEEGEQAKKEGEGGDKVKEEEEEEEETPAAQEDLSNIAPYGGATYNRQNLFQKKTRFVYANREVLNARRQKLRDGQPWMLVDDDRQNIFEGKIQAKQRPTYFLLVIEDGNFRVVQVAKQYRFMRQPSYKTLTAEEAEAAMAKRQKQQTHNRWIMRNRSQDATDDVDANETLRPEEASSRPSLSRKLITVDARDRDRGGDEYLDYEGLGTRSDDDEGEQEAEREDEDERARKDQWSREVHAADSAAYDIDDMELFGGAVELDEGVKAEEGGPDAHSKMEDTRDLRRLGVEVAMAGRDESDDEEDPYAKAAGVRLKEERAREREARRQEVLMMQPTPQPGEGGEDKEVAVKKEEDIEGGTQETSVKKTPGEQSPEATPMTSGEGPSHVSAHKRVHSDIEGGADKERKKKRDGPSGFKDPDANLITEADVIEVIQSAKLTPKEVVNRLRLKLQKDPRNKKQAYQIILQVASLQNGVLVLNKKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.68
3	0.71
4	0.79
5	0.81
6	0.74
7	0.71
8	0.69
9	0.67
10	0.66
11	0.63
12	0.57
13	0.55
14	0.55
15	0.54
16	0.5
17	0.43
18	0.4
19	0.43
20	0.47
21	0.44
22	0.43
23	0.41
24	0.42
25	0.45
26	0.43
27	0.35
28	0.31
29	0.28
30	0.26
31	0.27
32	0.25
33	0.22
34	0.2
35	0.18
36	0.15
37	0.13
38	0.11
39	0.1
40	0.1
41	0.12
42	0.15
43	0.2
44	0.23
45	0.26
46	0.31
47	0.4
48	0.47
49	0.49
50	0.55
51	0.56
52	0.63
53	0.63
54	0.61
55	0.56
56	0.48
57	0.47
58	0.42
59	0.4
60	0.33
61	0.32
62	0.31
63	0.28
64	0.3
65	0.3
66	0.28
67	0.31
68	0.32
69	0.38
70	0.43
71	0.47
72	0.51
73	0.59
74	0.66
75	0.68
76	0.72
77	0.68
78	0.68
79	0.66
80	0.67
81	0.59
82	0.5
83	0.48
84	0.41
85	0.36
86	0.29
87	0.26
88	0.18
89	0.19
90	0.17
91	0.12
92	0.13
93	0.12
94	0.11
95	0.13
96	0.14
97	0.15
98	0.15
99	0.15
100	0.16
101	0.16
102	0.17
103	0.14
104	0.2
105	0.23
106	0.31
107	0.31
108	0.29
109	0.3
110	0.29
111	0.29
112	0.25
113	0.22
114	0.2
115	0.21
116	0.24
117	0.25
118	0.26
119	0.26
120	0.24
121	0.22
122	0.18
123	0.19
124	0.19
125	0.18
126	0.18
127	0.17
128	0.17
129	0.15
130	0.13
131	0.1
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.08
142	0.1
143	0.09
144	0.1
145	0.12
146	0.17
147	0.24
148	0.25
149	0.28
150	0.31
151	0.36
152	0.43
153	0.48
154	0.51
155	0.51
156	0.54
157	0.56
158	0.55
159	0.52
160	0.54
161	0.54
162	0.54
163	0.48
164	0.47
165	0.42
166	0.42
167	0.46
168	0.42
169	0.37
170	0.37
171	0.37
172	0.41
173	0.49
174	0.55
175	0.54
176	0.56
177	0.56
178	0.54
179	0.54
180	0.48
181	0.4
182	0.31
183	0.24
184	0.22
185	0.21
186	0.16
187	0.16
188	0.16
189	0.16
190	0.16
191	0.19
192	0.18
193	0.17
194	0.23
195	0.26
196	0.3
197	0.33
198	0.37
199	0.35
200	0.36
201	0.37
202	0.35
203	0.32
204	0.29
205	0.26
206	0.23
207	0.21
208	0.17
209	0.15
210	0.11
211	0.11
212	0.09
213	0.07
214	0.08
215	0.09
216	0.08
217	0.16
218	0.23
219	0.23
220	0.3
221	0.32
222	0.35
223	0.4
224	0.42
225	0.43
226	0.42
227	0.46
228	0.46
229	0.51
230	0.48
231	0.44
232	0.43
233	0.36
234	0.31
235	0.26
236	0.19
237	0.13
238	0.11
239	0.1
240	0.09
241	0.08
242	0.1
243	0.11
244	0.17
245	0.22
246	0.28
247	0.36
248	0.47
249	0.54
250	0.62
251	0.69
252	0.68
253	0.7
254	0.7
255	0.7
256	0.68
257	0.65
258	0.56
259	0.5
260	0.46
261	0.41
262	0.38
263	0.33
264	0.25
265	0.19
266	0.17
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.14
281	0.16
282	0.17
283	0.2
284	0.19
285	0.19
286	0.18
287	0.2
288	0.22
289	0.23
290	0.26
291	0.29
292	0.3
293	0.3
294	0.3
295	0.28
296	0.24
297	0.23
298	0.2
299	0.15
300	0.12
301	0.1
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.08
327	0.1
328	0.14
329	0.15
330	0.18
331	0.19
332	0.22
333	0.27
334	0.3
335	0.37
336	0.38
337	0.4
338	0.44
339	0.43
340	0.4
341	0.36
342	0.31
343	0.22
344	0.16
345	0.13
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.02
359	0.02
360	0.02
361	0.02
362	0.02
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.13
380	0.16
381	0.18
382	0.24
383	0.29
384	0.3
385	0.29
386	0.28
387	0.26
388	0.22
389	0.2
390	0.14
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.08
409	0.08
410	0.1
411	0.13
412	0.15
413	0.18
414	0.2
415	0.24
416	0.28
417	0.33
418	0.39
419	0.4
420	0.45
421	0.49
422	0.54
423	0.59
424	0.64
425	0.64
426	0.58
427	0.54
428	0.49
429	0.47
430	0.44
431	0.4
432	0.32
433	0.27
434	0.27
435	0.27
436	0.26
437	0.2
438	0.16
439	0.11
440	0.16
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.18
445	0.18
446	0.22
447	0.23
448	0.19
449	0.2
450	0.17
451	0.17
452	0.21
453	0.21
454	0.18
455	0.18
456	0.18
457	0.16
458	0.17
459	0.16
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.21
468	0.28
469	0.34
470	0.41
471	0.4
472	0.4
473	0.42
474	0.45
475	0.4
476	0.32
477	0.25
478	0.18
479	0.21
480	0.18
481	0.15
482	0.13
483	0.14
484	0.16
485	0.17
486	0.18
487	0.15
488	0.17
489	0.22
490	0.28
491	0.33
492	0.34
493	0.35
494	0.38
495	0.38
496	0.37
497	0.33
498	0.32
499	0.29
500	0.26
501	0.29
502	0.29
503	0.3
504	0.37
505	0.45
506	0.44
507	0.5
508	0.58
509	0.64
510	0.7
511	0.76
512	0.77
513	0.77
514	0.83
515	0.77
516	0.7
517	0.63
518	0.52
519	0.51
520	0.43
521	0.35
522	0.25
523	0.24
524	0.22
525	0.2
526	0.19
527	0.11
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.13
537	0.14
538	0.16
539	0.18
540	0.25
541	0.33
542	0.41
543	0.48
544	0.52
545	0.58
546	0.59
547	0.65
548	0.64
549	0.61
550	0.63
551	0.66
552	0.66
553	0.71
554	0.79
555	0.81
556	0.86
557	0.83
558	0.79
559	0.8
560	0.78
561	0.72
562	0.67
563	0.63
564	0.58
565	0.55
566	0.49
567	0.42
568	0.34
569	0.29
570	0.24
571	0.17
572	0.11
573	0.1
574	0.11
575	0.12

A0A4P9Y177

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer