FuNGI

A0A3M9Y844

Protein Details

Accession

A0A3M9Y844

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-58	QDQKPNPTGQQPRPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKSNAPRPQGAG	Hydrophilic
556-577	ETESTLRKKKLKKNGSSVQVSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-54	RPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKSNAPRP
536-546	AARKGKSLKRP
562-568	RKKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPSGLPNGQAQDQKPNPTGQQPRPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKSNAPRPQGAGAASSSRATPPSAALRPEVHTAGLLARITNNRTKTAANGGWTEPLPPGGREWKIVTTKRALMEGTRHHVMRFSSSRIEKEKLHIDPTDQNDFTRPVTLQRRDPRQPAAGREVKPEEEEPEPEPNPEDEKEAERIAQLKAEKDAWKAMEAAKSAPAIKDPNASTRTKQPKQEDRGVQFHRAPRSEKERKQQSLRYEEALPWHIEDADGKHVWVGSYVAPLSETTVCLVATTDGKFAMTPLEKWYKFQPKPNFTTMRIEEAEALMKQQSGVSRWHMQAQEKKAGQKDLEDWRKFKNGPSRIKTESSTFRGVSKSEKMDHDEIDFEGDEFQDDDEAPNFEPDNDEDQKESAERIKREQLGANVFGEGDEGKVDQEELETRLLEESRKREGKTINKALVKREKETIYKKDSDDEDGNRYFGPSDEEDSDDESKDGEDEAKKDEDKASSQDPSAQSQDANGAKDKDANSKGTLTPSGKQKEADAARKGKSLKRPGSPNLSESSETESTLRKKKLKKNGSSVQVSRSGTPLPSGHKHKVGMSSMSDGEATGGEMSDGQQRKKKIKLLGTGARSTPTGSRAGSPAPAGAAGSASPTSPNPRAGSPSRSGPIEPWEVFAALPPQGISSKELNRRFNERIGDGPGQTSKAGWINIVKDVAVFGRDKLLRPKEGAAPKRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.48
4	0.45
5	0.47
6	0.46
7	0.5
8	0.58
9	0.57
10	0.63
11	0.65
12	0.71
13	0.77
14	0.82
15	0.81
16	0.82
17	0.84
18	0.79
19	0.79
20	0.8
21	0.8
22	0.79
23	0.8
24	0.79
25	0.78
26	0.83
27	0.8
28	0.76
29	0.75
30	0.78
31	0.75
32	0.73
33	0.73
34	0.74
35	0.79
36	0.84
37	0.85
38	0.8
39	0.8
40	0.76
41	0.68
42	0.6
43	0.5
44	0.41
45	0.32
46	0.31
47	0.25
48	0.21
49	0.19
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.15
54	0.17
55	0.24
56	0.28
57	0.29
58	0.31
59	0.33
60	0.34
61	0.37
62	0.34
63	0.26
64	0.22
65	0.2
66	0.18
67	0.19
68	0.16
69	0.12
70	0.15
71	0.19
72	0.23
73	0.29
74	0.3
75	0.3
76	0.32
77	0.32
78	0.32
79	0.37
80	0.36
81	0.32
82	0.33
83	0.31
84	0.33
85	0.32
86	0.3
87	0.21
88	0.22
89	0.2
90	0.17
91	0.2
92	0.24
93	0.25
94	0.27
95	0.3
96	0.34
97	0.41
98	0.45
99	0.46
100	0.44
101	0.48
102	0.46
103	0.45
104	0.38
105	0.33
106	0.36
107	0.38
108	0.38
109	0.38
110	0.37
111	0.35
112	0.37
113	0.35
114	0.36
115	0.33
116	0.31
117	0.35
118	0.38
119	0.44
120	0.46
121	0.48
122	0.42
123	0.44
124	0.48
125	0.43
126	0.44
127	0.39
128	0.38
129	0.41
130	0.44
131	0.46
132	0.38
133	0.36
134	0.34
135	0.35
136	0.32
137	0.28
138	0.23
139	0.23
140	0.32
141	0.37
142	0.44
143	0.51
144	0.59
145	0.63
146	0.67
147	0.65
148	0.64
149	0.64
150	0.6
151	0.61
152	0.59
153	0.54
154	0.55
155	0.53
156	0.46
157	0.44
158	0.39
159	0.33
160	0.27
161	0.28
162	0.24
163	0.27
164	0.27
165	0.24
166	0.25
167	0.23
168	0.25
169	0.23
170	0.23
171	0.18
172	0.21
173	0.23
174	0.21
175	0.21
176	0.18
177	0.2
178	0.17
179	0.2
180	0.18
181	0.17
182	0.19
183	0.23
184	0.24
185	0.23
186	0.27
187	0.24
188	0.23
189	0.23
190	0.23
191	0.22
192	0.21
193	0.2
194	0.18
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.21
202	0.2
203	0.26
204	0.3
205	0.31
206	0.31
207	0.39
208	0.48
209	0.48
210	0.55
211	0.57
212	0.63
213	0.68
214	0.76
215	0.74
216	0.69
217	0.73
218	0.68
219	0.64
220	0.59
221	0.57
222	0.53
223	0.48
224	0.46
225	0.43
226	0.5
227	0.55
228	0.57
229	0.63
230	0.66
231	0.7
232	0.74
233	0.74
234	0.72
235	0.69
236	0.64
237	0.57
238	0.48
239	0.42
240	0.38
241	0.35
242	0.27
243	0.2
244	0.18
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.11
249	0.13
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.11
257	0.06
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.08
271	0.06
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.15
283	0.23
284	0.23
285	0.25
286	0.33
287	0.39
288	0.42
289	0.5
290	0.55
291	0.54
292	0.59
293	0.66
294	0.62
295	0.54
296	0.59
297	0.51
298	0.47
299	0.4
300	0.35
301	0.27
302	0.23
303	0.22
304	0.14
305	0.13
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.11
313	0.15
314	0.19
315	0.19
316	0.24
317	0.25
318	0.29
319	0.34
320	0.37
321	0.4
322	0.37
323	0.4
324	0.38
325	0.38
326	0.33
327	0.28
328	0.29
329	0.32
330	0.39
331	0.38
332	0.38
333	0.38
334	0.43
335	0.42
336	0.41
337	0.41
338	0.4
339	0.47
340	0.5
341	0.53
342	0.51
343	0.53
344	0.5
345	0.45
346	0.42
347	0.37
348	0.36
349	0.31
350	0.29
351	0.27
352	0.26
353	0.25
354	0.23
355	0.22
356	0.22
357	0.23
358	0.25
359	0.26
360	0.26
361	0.23
362	0.2
363	0.17
364	0.15
365	0.13
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.14
392	0.18
393	0.18
394	0.22
395	0.28
396	0.29
397	0.31
398	0.32
399	0.31
400	0.29
401	0.29
402	0.26
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.13
407	0.09
408	0.06
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.14
425	0.16
426	0.24
427	0.28
428	0.29
429	0.33
430	0.4
431	0.47
432	0.53
433	0.58
434	0.57
435	0.58
436	0.59
437	0.62
438	0.63
439	0.57
440	0.5
441	0.47
442	0.44
443	0.46
444	0.52
445	0.51
446	0.49
447	0.5
448	0.48
449	0.48
450	0.45
451	0.43
452	0.4
453	0.36
454	0.35
455	0.31
456	0.31
457	0.25
458	0.24
459	0.19
460	0.15
461	0.16
462	0.11
463	0.14
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.19
468	0.2
469	0.16
470	0.15
471	0.12
472	0.11
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.14
479	0.17
480	0.17
481	0.19
482	0.21
483	0.2
484	0.2
485	0.23
486	0.23
487	0.22
488	0.22
489	0.26
490	0.25
491	0.27
492	0.27
493	0.24
494	0.2
495	0.19
496	0.25
497	0.21
498	0.21
499	0.21
500	0.2
501	0.2
502	0.24
503	0.25
504	0.27
505	0.28
506	0.28
507	0.28
508	0.29
509	0.3
510	0.29
511	0.32
512	0.27
513	0.29
514	0.35
515	0.37
516	0.36
517	0.35
518	0.33
519	0.37
520	0.41
521	0.44
522	0.43
523	0.45
524	0.45
525	0.49
526	0.52
527	0.49
528	0.52
529	0.55
530	0.55
531	0.56
532	0.62
533	0.64
534	0.7
535	0.66
536	0.59
537	0.53
538	0.49
539	0.42
540	0.36
541	0.36
542	0.27
543	0.25
544	0.24
545	0.26
546	0.28
547	0.35
548	0.41
549	0.42
550	0.51
551	0.6
552	0.69
553	0.74
554	0.78
555	0.8
556	0.82
557	0.83
558	0.82
559	0.75
560	0.68
561	0.65
562	0.57
563	0.47
564	0.4
565	0.33
566	0.25
567	0.26
568	0.24
569	0.23
570	0.29
571	0.36
572	0.39
573	0.42
574	0.44
575	0.44
576	0.48
577	0.45
578	0.41
579	0.36
580	0.34
581	0.3
582	0.29
583	0.25
584	0.18
585	0.15
586	0.12
587	0.1
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.07
593	0.14
594	0.17
595	0.21
596	0.26
597	0.32
598	0.39
599	0.46
600	0.52
601	0.53
602	0.57
603	0.62
604	0.67
605	0.7
606	0.69
607	0.66
608	0.6
609	0.53
610	0.45
611	0.38
612	0.31
613	0.24
614	0.22
615	0.19
616	0.2
617	0.21
618	0.23
619	0.23
620	0.21
621	0.19
622	0.16
623	0.15
624	0.13
625	0.1
626	0.09
627	0.07
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.09
632	0.11
633	0.18
634	0.2
635	0.25
636	0.26
637	0.28
638	0.35
639	0.39
640	0.44
641	0.41
642	0.45
643	0.44
644	0.43
645	0.42
646	0.37
647	0.38
648	0.39
649	0.35
650	0.3
651	0.29
652	0.27
653	0.26
654	0.25
655	0.22
656	0.15
657	0.15
658	0.12
659	0.12
660	0.14
661	0.15
662	0.17
663	0.21
664	0.29
665	0.38
666	0.46
667	0.52
668	0.56
669	0.62
670	0.63
671	0.63
672	0.61
673	0.54
674	0.51
675	0.5
676	0.49
677	0.42
678	0.41
679	0.37
680	0.32
681	0.29
682	0.25
683	0.22
684	0.22
685	0.22
686	0.21
687	0.23
688	0.24
689	0.28
690	0.28
691	0.24
692	0.2
693	0.21
694	0.19
695	0.17
696	0.16
697	0.13
698	0.21
699	0.23
700	0.27
701	0.36
702	0.42
703	0.44
704	0.47
705	0.51
706	0.51
707	0.59

A0A3M9Y844

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer