Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M9Y242

Protein Details
Accession A0A3M9Y242    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-193VSPTPAKRGRGRPRKKDQYSSVHydrophilic
260-288PTPQPTASKVHKRRGRPSKAKTSMKRGQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-76IKRGAGRPSKKSKLPAPR
177-187AKRGRGRPRKK
213-215PRR
268-285KVHKRRGRPSKAKTSMKR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MPVATRYPSFSQHGGDELSDVSDVSMADAQTELSDDEPEPLIVSDIVPSTPKTGPVLPIKRGAGRPSKKSKLPAPRTADTKKTSTRNGTETCLQDTESDVFISGEDDQDCVSDGNDLDPEDGELLVPKKHSSKRLFPSRPIGRHASSGIENGKGGSDESEELSSTDGEGQPVSPTPAKRGRGRPRKKDQYSSVMVRPIAEKKRASSSTDSSKPRRSSRLHPSASGSDPVTKAKLVKRARGSSPVRFTQTTPQKSTGNKLPTPQPTASKVHKRRGRPSKAKTSMKRGQGAEQEWEVESIEDSLIDRKGGVHYYQVKWKGFPASQNTWEPRASLSKCKDIITAFQQRDKKTQKSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.22
4 0.17
5 0.16
6 0.13
7 0.11
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.09
20 0.07
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.2
41 0.25
42 0.34
43 0.4
44 0.39
45 0.44
46 0.45
47 0.48
48 0.49
49 0.5
50 0.5
51 0.51
52 0.58
53 0.62
54 0.67
55 0.66
56 0.7
57 0.72
58 0.72
59 0.74
60 0.74
61 0.72
62 0.7
63 0.72
64 0.71
65 0.69
66 0.62
67 0.6
68 0.58
69 0.56
70 0.57
71 0.57
72 0.56
73 0.55
74 0.54
75 0.52
76 0.5
77 0.46
78 0.43
79 0.36
80 0.31
81 0.25
82 0.24
83 0.22
84 0.17
85 0.14
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.16
116 0.21
117 0.3
118 0.35
119 0.43
120 0.52
121 0.62
122 0.66
123 0.63
124 0.69
125 0.69
126 0.66
127 0.61
128 0.57
129 0.47
130 0.44
131 0.41
132 0.33
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.15
163 0.21
164 0.25
165 0.31
166 0.41
167 0.5
168 0.59
169 0.69
170 0.74
171 0.78
172 0.85
173 0.85
174 0.82
175 0.77
176 0.74
177 0.69
178 0.63
179 0.55
180 0.47
181 0.41
182 0.34
183 0.31
184 0.3
185 0.29
186 0.29
187 0.28
188 0.27
189 0.34
190 0.36
191 0.37
192 0.35
193 0.36
194 0.39
195 0.46
196 0.5
197 0.47
198 0.53
199 0.56
200 0.56
201 0.59
202 0.55
203 0.56
204 0.61
205 0.67
206 0.61
207 0.57
208 0.56
209 0.52
210 0.49
211 0.42
212 0.32
213 0.25
214 0.23
215 0.23
216 0.2
217 0.17
218 0.19
219 0.21
220 0.29
221 0.31
222 0.37
223 0.44
224 0.49
225 0.51
226 0.57
227 0.58
228 0.57
229 0.59
230 0.56
231 0.52
232 0.48
233 0.46
234 0.47
235 0.52
236 0.5
237 0.48
238 0.47
239 0.47
240 0.48
241 0.52
242 0.5
243 0.48
244 0.43
245 0.43
246 0.47
247 0.48
248 0.52
249 0.49
250 0.45
251 0.42
252 0.46
253 0.51
254 0.55
255 0.57
256 0.62
257 0.66
258 0.69
259 0.75
260 0.8
261 0.83
262 0.82
263 0.83
264 0.85
265 0.88
266 0.9
267 0.87
268 0.86
269 0.83
270 0.8
271 0.77
272 0.68
273 0.64
274 0.62
275 0.57
276 0.51
277 0.44
278 0.38
279 0.31
280 0.3
281 0.23
282 0.16
283 0.13
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.15
295 0.15
296 0.21
297 0.28
298 0.32
299 0.41
300 0.47
301 0.46
302 0.44
303 0.47
304 0.47
305 0.42
306 0.46
307 0.45
308 0.46
309 0.5
310 0.58
311 0.58
312 0.55
313 0.52
314 0.46
315 0.41
316 0.42
317 0.4
318 0.41
319 0.43
320 0.48
321 0.5
322 0.51
323 0.5
324 0.43
325 0.46
326 0.46
327 0.5
328 0.45
329 0.51
330 0.56
331 0.56
332 0.64
333 0.66
334 0.67