FuNGI

A0A3M9YCZ6

Protein Details

Accession

A0A3M9YCZ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-54	ELPVASSQKTEKKQKKEKKKRSREDDPLVTDERKHKRSKSTANRAISPD	Hydrophilic
66-93	SVAEVEKPTKKSKKSKKSKQEDPADAGD	Hydrophilic
116-142	RSELKTSTKKSSSKKKGKKEATPESSE	Hydrophilic
415-436	QQELRRRKGKSGGVLRKERRYV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-29	EKKQKKEKKKRSRE
38-42	RKHKR
73-84	PTKKSKKSKKSK
102-105	KKRR
123-134	TKKSSSKKKGKK
419-433	RRRKGKSGGVLRKER

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, mito_nucl 10.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MAVKEELPVASSQKTEKKQKKEKKKRSREDDPLVTDERKHKRSKSTANRAISPDLSASANTDANDSVAEVEKPTKKSKKSKKSKQEDPADAGDAVQEVADKKKRRMSRSHDDEDDRSELKTSTKKSSSKKKGKKEATPESSEADQASGSSEDDEAETPDVMDIDTPLQPNPPKSTSRLHQPLDTPAKPRYPFFTQTVSLFLPIYPIGWAGPCTAAATQHLQPMVNRYVPVLGGVLLGFRNVAVSERPGREDAATSDSDVCKLGAIDEFAVGFGWVTADVDLFVPKRGAWMEGSINLESEGHVGVVCWGKFNASIESARLPPAWRWVHLGTDETAATSAHDDTVSNFTAEEQHGAVRQIHATGYWVDEAGQKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEAEARQRDAQQELRRRKGKSGGVLRKERRYVPDFSITKFGEVENEEEKALAQEVWEHTEPAKDTTETAQDGEYAGLSHEAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.5
3	0.57
4	0.65
5	0.74
6	0.83
7	0.88
8	0.91
9	0.94
10	0.94
11	0.96
12	0.96
13	0.96
14	0.96
15	0.95
16	0.93
17	0.91
18	0.86
19	0.8
20	0.74
21	0.65
22	0.59
23	0.58
24	0.57
25	0.55
26	0.57
27	0.58
28	0.64
29	0.72
30	0.78
31	0.8
32	0.82
33	0.84
34	0.83
35	0.82
36	0.76
37	0.7
38	0.6
39	0.5
40	0.4
41	0.32
42	0.26
43	0.2
44	0.18
45	0.16
46	0.17
47	0.15
48	0.16
49	0.14
50	0.13
51	0.13
52	0.11
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.17
58	0.22
59	0.26
60	0.36
61	0.43
62	0.5
63	0.61
64	0.71
65	0.75
66	0.81
67	0.88
68	0.9
69	0.92
70	0.93
71	0.93
72	0.92
73	0.88
74	0.82
75	0.74
76	0.66
77	0.55
78	0.44
79	0.34
80	0.24
81	0.16
82	0.11
83	0.08
84	0.07
85	0.13
86	0.21
87	0.25
88	0.29
89	0.38
90	0.45
91	0.51
92	0.6
93	0.63
94	0.67
95	0.73
96	0.76
97	0.74
98	0.72
99	0.67
100	0.61
101	0.56
102	0.45
103	0.36
104	0.3
105	0.24
106	0.23
107	0.28
108	0.27
109	0.31
110	0.38
111	0.45
112	0.53
113	0.63
114	0.7
115	0.75
116	0.81
117	0.83
118	0.87
119	0.88
120	0.89
121	0.88
122	0.88
123	0.84
124	0.79
125	0.7
126	0.63
127	0.54
128	0.46
129	0.35
130	0.25
131	0.17
132	0.11
133	0.11
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.06
151	0.08
152	0.08
153	0.09
154	0.12
155	0.14
156	0.17
157	0.22
158	0.23
159	0.24
160	0.27
161	0.33
162	0.33
163	0.41
164	0.47
165	0.44
166	0.44
167	0.43
168	0.48
169	0.51
170	0.49
171	0.42
172	0.38
173	0.42
174	0.4
175	0.39
176	0.36
177	0.33
178	0.35
179	0.35
180	0.36
181	0.31
182	0.31
183	0.33
184	0.28
185	0.23
186	0.19
187	0.15
188	0.12
189	0.1
190	0.1
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.11
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.13
208	0.13
209	0.18
210	0.19
211	0.16
212	0.15
213	0.13
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.08
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.07
231	0.11
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.06
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.12
278	0.14
279	0.17
280	0.15
281	0.15
282	0.14
283	0.13
284	0.1
285	0.1
286	0.07
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.06
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.11
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.12
301	0.13
302	0.15
303	0.15
304	0.16
305	0.15
306	0.15
307	0.13
308	0.22
309	0.22
310	0.21
311	0.25
312	0.25
313	0.27
314	0.26
315	0.27
316	0.19
317	0.19
318	0.18
319	0.13
320	0.12
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.08
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.1
338	0.11
339	0.12
340	0.14
341	0.15
342	0.13
343	0.13
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.12
354	0.14
355	0.14
356	0.18
357	0.17
358	0.21
359	0.25
360	0.32
361	0.34
362	0.42
363	0.49
364	0.53
365	0.57
366	0.63
367	0.61
368	0.61
369	0.57
370	0.5
371	0.41
372	0.34
373	0.3
374	0.21
375	0.19
376	0.12
377	0.1
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.08
395	0.09
396	0.11
397	0.12
398	0.13
399	0.16
400	0.21
401	0.3
402	0.35
403	0.45
404	0.53
405	0.62
406	0.67
407	0.67
408	0.69
409	0.7
410	0.68
411	0.68
412	0.69
413	0.69
414	0.72
415	0.8
416	0.81
417	0.81
418	0.79
419	0.74
420	0.7
421	0.65
422	0.6
423	0.56
424	0.59
425	0.53
426	0.5
427	0.53
428	0.46
429	0.42
430	0.38
431	0.32
432	0.26
433	0.26
434	0.27
435	0.21
436	0.22
437	0.2
438	0.19
439	0.2
440	0.16
441	0.15
442	0.11
443	0.09
444	0.13
445	0.15
446	0.21
447	0.22
448	0.22
449	0.22
450	0.27
451	0.28
452	0.26
453	0.28
454	0.22
455	0.23
456	0.26
457	0.31
458	0.27
459	0.27
460	0.24
461	0.2
462	0.21
463	0.19
464	0.15
465	0.1
466	0.09

A0A3M9YCZ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer