Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A3M9YCX4

Protein Details
Accession A0A3M9YCX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-108PTPTRASKPSKRTRDAPVKREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-110PTRASKPSKRTRDAPVKREPA
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 6, mito 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPVTRRSTGRTEVKAKPQYKEDSDSETDELARDEQAPEPESPPVPVKKEAPAAMSAFEKRRLENIAANQALLKDISATASKIIPASKPTPTRASKPSKRTRDAPVKREPAMATRRSSRVAGLGPDKDDAKRAFEDTALESPLERAKRMRFSGDLNLGDALVEGKKWSAGLEGLQGLKGLSRGAQPGQRTFTEDDIKNTTDKDLKDLRLRMDGLKLYEGWMPNTIKITPQRVYSLGFHPTEDKPVIFAGDKEGAIGVFDASQKAPEPPEDEDEEWDEPDPIISAFKFHTKTASAFVFSPADDNAVYTSSYDSTIRKLDLEKGMSVQVFAPDDVMEDMPMSAMEMPTNDSNLLYFSTLHGGFGRHDIRTPSGEHEVWSLSDNKIGGFSLHPLQPHLVATASLDRTMKIWDLRKITGKGDLQHPALLGEHESRLSVSYASWSPAGHLATSSYDDTIKIYDFTAASTWAPGHDIGAETMTPAVQVKHNNQTGRWVTILKPKWQLQPRDGIQKFTIGNMNRFVDVFAADGEQIAQLDGDGITAVPAVAHFHPTLDWVAGGNGSGKLTLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.75
3 0.71
4 0.7
5 0.7
6 0.67
7 0.66
8 0.59
9 0.57
10 0.55
11 0.53
12 0.47
13 0.39
14 0.34
15 0.28
16 0.26
17 0.19
18 0.17
19 0.14
20 0.14
21 0.17
22 0.21
23 0.23
24 0.23
25 0.24
26 0.26
27 0.26
28 0.27
29 0.3
30 0.32
31 0.33
32 0.36
33 0.37
34 0.39
35 0.45
36 0.45
37 0.41
38 0.39
39 0.35
40 0.33
41 0.34
42 0.33
43 0.3
44 0.35
45 0.34
46 0.31
47 0.34
48 0.37
49 0.36
50 0.38
51 0.42
52 0.44
53 0.42
54 0.41
55 0.38
56 0.34
57 0.31
58 0.24
59 0.17
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.19
72 0.22
73 0.29
74 0.33
75 0.37
76 0.44
77 0.47
78 0.52
79 0.56
80 0.63
81 0.65
82 0.71
83 0.77
84 0.78
85 0.8
86 0.79
87 0.8
88 0.8
89 0.81
90 0.78
91 0.78
92 0.74
93 0.7
94 0.69
95 0.59
96 0.57
97 0.55
98 0.52
99 0.46
100 0.46
101 0.47
102 0.45
103 0.44
104 0.37
105 0.33
106 0.3
107 0.31
108 0.31
109 0.3
110 0.29
111 0.3
112 0.3
113 0.26
114 0.29
115 0.25
116 0.23
117 0.22
118 0.23
119 0.22
120 0.21
121 0.23
122 0.21
123 0.22
124 0.19
125 0.17
126 0.15
127 0.16
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.19
132 0.23
133 0.31
134 0.33
135 0.36
136 0.33
137 0.36
138 0.43
139 0.45
140 0.4
141 0.34
142 0.31
143 0.27
144 0.25
145 0.2
146 0.13
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.08
168 0.1
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.22
173 0.25
174 0.24
175 0.27
176 0.26
177 0.28
178 0.32
179 0.3
180 0.3
181 0.3
182 0.31
183 0.27
184 0.26
185 0.24
186 0.22
187 0.21
188 0.23
189 0.25
190 0.28
191 0.34
192 0.37
193 0.36
194 0.36
195 0.37
196 0.32
197 0.31
198 0.29
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.14
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.21
213 0.25
214 0.22
215 0.23
216 0.25
217 0.24
218 0.26
219 0.25
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.21
224 0.23
225 0.22
226 0.23
227 0.21
228 0.18
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.19
259 0.18
260 0.16
261 0.14
262 0.12
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.17
304 0.2
305 0.21
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.14
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.16
348 0.17
349 0.14
350 0.16
351 0.17
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.21
360 0.19
361 0.18
362 0.18
363 0.16
364 0.11
365 0.13
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.1
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.1
382 0.09
383 0.1
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.22
394 0.26
395 0.3
396 0.34
397 0.4
398 0.41
399 0.4
400 0.42
401 0.4
402 0.37
403 0.39
404 0.4
405 0.34
406 0.33
407 0.31
408 0.24
409 0.22
410 0.19
411 0.15
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.08
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.12
426 0.13
427 0.17
428 0.17
429 0.14
430 0.13
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.16
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.12
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.09
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.11
467 0.17
468 0.23
469 0.32
470 0.38
471 0.4
472 0.39
473 0.47
474 0.47
475 0.44
476 0.41
477 0.33
478 0.31
479 0.39
480 0.45
481 0.42
482 0.47
483 0.49
484 0.57
485 0.63
486 0.67
487 0.62
488 0.67
489 0.65
490 0.68
491 0.64
492 0.59
493 0.52
494 0.5
495 0.45
496 0.38
497 0.4
498 0.33
499 0.35
500 0.36
501 0.37
502 0.32
503 0.32
504 0.29
505 0.22
506 0.19
507 0.16
508 0.11
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.08
529 0.09
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.14
534 0.16
535 0.17
536 0.14
537 0.14
538 0.11
539 0.12
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.1