FuNGI

A0A397JC21

Protein Details

Accession

A0A397JC21

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-49	KDTGHNKSAKSFKKESKKPFHENVKTERDL	Hydrophilic
58-80	NNELGKSKTKQARKDNQDTENND	Hydrophilic
394-420	FIPNSVLKNKKNNKKFIQKGYQPRVDP	Hydrophilic
453-481	FMEVRGKNFRAQKTKKKRGSYRGGKIDME	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
460-474	NFRAQKTKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006594 LisH IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF08513 LisH PF05022 SRP40_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH

Amino Acid Sequences

MNSLNTVPEELYSLVYHFLKDTGHNKSAKSFKKESKKPFHENVKTERDLIKIITDIKNNELGKSKTKQARKDNQDTENNDSDSSSESSESNESNESSSESGESSNESIKSSNKSIKSSSESSSESSSSSEDESSESDHDSSNDTESSGKSTIQKSQNSTSSSDTSSSSDSTSSSDDSSDSTSSSDDSSSNESDEEKEDEKVNHRIDSEKSSDEDDDSDIINIFKSNDSKKDNSSEEESSDSGNESSSSENKEQSNNFNDSTNKENPINIINNDFEDSESFSTIVSQSDTEKYTCGQNEFKSEIENDNSRTEILDSKCNIDFIETPNTIRSLDFNNEGHCSDNEFSEKNGNNKKHKISSDNYYSDQEYSTPCKRPNTNISETPSTIGKSPSWEHFIPNSVLKNKKNNKKFIQKGYQPRVDPNRIEFLDERLKDNSFMAKEGAIGSYGEKAHNDFMEVRGKNFRAQKTKKKRGSYRGGKIDMESHSIKFQD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.17
4	0.15
5	0.15
6	0.15
7	0.21
8	0.26
9	0.3
10	0.37
11	0.39
12	0.4
13	0.47
14	0.55
15	0.57
16	0.6
17	0.6
18	0.64
19	0.72
20	0.81
21	0.83
22	0.85
23	0.86
24	0.86
25	0.87
26	0.89
27	0.87
28	0.85
29	0.83
30	0.81
31	0.73
32	0.68
33	0.61
34	0.52
35	0.45
36	0.38
37	0.31
38	0.25
39	0.29
40	0.3
41	0.31
42	0.31
43	0.32
44	0.39
45	0.37
46	0.36
47	0.38
48	0.36
49	0.38
50	0.41
51	0.47
52	0.48
53	0.55
54	0.62
55	0.66
56	0.74
57	0.77
58	0.83
59	0.82
60	0.82
61	0.83
62	0.78
63	0.75
64	0.7
65	0.61
66	0.5
67	0.42
68	0.34
69	0.28
70	0.25
71	0.18
72	0.13
73	0.13
74	0.15
75	0.17
76	0.17
77	0.15
78	0.15
79	0.15
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.11
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.15
95	0.18
96	0.23
97	0.26
98	0.32
99	0.32
100	0.35
101	0.37
102	0.41
103	0.44
104	0.43
105	0.4
106	0.38
107	0.36
108	0.34
109	0.34
110	0.29
111	0.23
112	0.2
113	0.18
114	0.15
115	0.14
116	0.12
117	0.1
118	0.11
119	0.11
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.14
127	0.14
128	0.13
129	0.13
130	0.12
131	0.13
132	0.12
133	0.16
134	0.14
135	0.15
136	0.17
137	0.2
138	0.27
139	0.33
140	0.37
141	0.38
142	0.43
143	0.47
144	0.45
145	0.45
146	0.41
147	0.36
148	0.33
149	0.3
150	0.25
151	0.21
152	0.2
153	0.18
154	0.15
155	0.13
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.11
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.12
165	0.11
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.1
171	0.09
172	0.07
173	0.09
174	0.12
175	0.12
176	0.13
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.16
182	0.13
183	0.14
184	0.16
185	0.17
186	0.21
187	0.26
188	0.26
189	0.24
190	0.24
191	0.25
192	0.25
193	0.28
194	0.28
195	0.22
196	0.22
197	0.22
198	0.21
199	0.19
200	0.18
201	0.13
202	0.11
203	0.1
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.1
212	0.12
213	0.18
214	0.22
215	0.24
216	0.26
217	0.31
218	0.32
219	0.31
220	0.34
221	0.29
222	0.25
223	0.25
224	0.23
225	0.18
226	0.16
227	0.14
228	0.09
229	0.08
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.12
235	0.13
236	0.15
237	0.16
238	0.19
239	0.2
240	0.24
241	0.27
242	0.26
243	0.26
244	0.25
245	0.25
246	0.24
247	0.29
248	0.26
249	0.24
250	0.22
251	0.22
252	0.21
253	0.24
254	0.24
255	0.19
256	0.18
257	0.16
258	0.16
259	0.17
260	0.16
261	0.12
262	0.1
263	0.11
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.1
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.15
280	0.16
281	0.18
282	0.2
283	0.2
284	0.24
285	0.26
286	0.25
287	0.23
288	0.23
289	0.22
290	0.22
291	0.23
292	0.21
293	0.2
294	0.2
295	0.18
296	0.17
297	0.16
298	0.18
299	0.17
300	0.21
301	0.21
302	0.24
303	0.24
304	0.24
305	0.23
306	0.19
307	0.19
308	0.16
309	0.23
310	0.2
311	0.2
312	0.21
313	0.22
314	0.2
315	0.19
316	0.17
317	0.14
318	0.16
319	0.19
320	0.19
321	0.21
322	0.22
323	0.22
324	0.23
325	0.19
326	0.2
327	0.17
328	0.18
329	0.18
330	0.17
331	0.17
332	0.23
333	0.25
334	0.3
335	0.38
336	0.43
337	0.5
338	0.56
339	0.62
340	0.62
341	0.63
342	0.62
343	0.58
344	0.59
345	0.6
346	0.57
347	0.53
348	0.48
349	0.45
350	0.39
351	0.34
352	0.27
353	0.21
354	0.24
355	0.27
356	0.3
357	0.33
358	0.4
359	0.43
360	0.5
361	0.56
362	0.58
363	0.59
364	0.6
365	0.62
366	0.6
367	0.57
368	0.5
369	0.42
370	0.35
371	0.29
372	0.25
373	0.2
374	0.19
375	0.22
376	0.25
377	0.29
378	0.29
379	0.31
380	0.31
381	0.34
382	0.32
383	0.34
384	0.36
385	0.37
386	0.43
387	0.45
388	0.54
389	0.6
390	0.67
391	0.72
392	0.76
393	0.78
394	0.82
395	0.86
396	0.86
397	0.86
398	0.86
399	0.87
400	0.87
401	0.85
402	0.76
403	0.76
404	0.75
405	0.72
406	0.66
407	0.59
408	0.59
409	0.51
410	0.54
411	0.45
412	0.42
413	0.45
414	0.42
415	0.41
416	0.34
417	0.35
418	0.32
419	0.33
420	0.33
421	0.24
422	0.25
423	0.23
424	0.2
425	0.2
426	0.2
427	0.18
428	0.12
429	0.11
430	0.1
431	0.13
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.16
436	0.19
437	0.19
438	0.21
439	0.18
440	0.21
441	0.29
442	0.29
443	0.3
444	0.35
445	0.36
446	0.4
447	0.47
448	0.53
449	0.54
450	0.64
451	0.72
452	0.75
453	0.84
454	0.87
455	0.9
456	0.91
457	0.91
458	0.92
459	0.92
460	0.91
461	0.9
462	0.86
463	0.77
464	0.69
465	0.65
466	0.56
467	0.51
468	0.43
469	0.34

A0A397JC21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer