Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HTV0

Protein Details
Accession A0A397HTV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-168ERKQNYKSSKSRSLKKKRKRQPNNNNENSTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-157YKSSKSRSLKKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 11.666, cyto_nucl 10.166, mito 7, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MSTQFKLHPEKSIKQHQFMFNSFPAVSYVTSQIMLPFPPNISANEIVDKRRKDQIMLKSPNAFMIYRMSFLDHLTSLNRNFKMTDVSKLVSTYWRNEPDTVKDAYKKIAHEVEQELNERRKKNILFCKVSWKDSKLFERKQNYKSSKSRSLKKKRKRQPNNNNENSTKLDETLTFEYPNNFEFIPFNYGGGTTSFNTSLNDINNSLTHETQINSINNDNPNLGYEFINYFEDNIIKFDEVNNCTDYLNFEYDNNNMIDYYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.71
3 0.69
4 0.68
5 0.63
6 0.6
7 0.5
8 0.48
9 0.41
10 0.34
11 0.28
12 0.23
13 0.21
14 0.16
15 0.17
16 0.14
17 0.15
18 0.14
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.19
29 0.21
30 0.21
31 0.26
32 0.27
33 0.3
34 0.36
35 0.37
36 0.36
37 0.41
38 0.41
39 0.39
40 0.45
41 0.51
42 0.54
43 0.59
44 0.59
45 0.55
46 0.54
47 0.52
48 0.46
49 0.35
50 0.25
51 0.25
52 0.22
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.16
63 0.18
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.28
70 0.26
71 0.28
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.26
81 0.29
82 0.3
83 0.32
84 0.34
85 0.33
86 0.34
87 0.33
88 0.28
89 0.27
90 0.26
91 0.28
92 0.29
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.24
97 0.24
98 0.27
99 0.26
100 0.25
101 0.26
102 0.27
103 0.29
104 0.32
105 0.3
106 0.28
107 0.31
108 0.31
109 0.37
110 0.43
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.56
115 0.53
116 0.55
117 0.49
118 0.42
119 0.37
120 0.37
121 0.44
122 0.42
123 0.45
124 0.49
125 0.55
126 0.6
127 0.62
128 0.67
129 0.63
130 0.64
131 0.65
132 0.66
133 0.67
134 0.67
135 0.71
136 0.72
137 0.78
138 0.8
139 0.83
140 0.86
141 0.85
142 0.9
143 0.92
144 0.92
145 0.92
146 0.93
147 0.94
148 0.92
149 0.88
150 0.78
151 0.7
152 0.62
153 0.54
154 0.43
155 0.32
156 0.24
157 0.19
158 0.22
159 0.22
160 0.2
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.15
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.09
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.19
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.22
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.27
203 0.27
204 0.28
205 0.26
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.18
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.22
226 0.23
227 0.25
228 0.25
229 0.24
230 0.24
231 0.24
232 0.24
233 0.2
234 0.22
235 0.2
236 0.19
237 0.21
238 0.22
239 0.25
240 0.21
241 0.18