Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HNY6

Protein Details
Accession A0A397HNY6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-25SNLNQLFKRKNQPSLRSNSRPSSSHydrophilic
302-324EIETSRKEKKKIRSIRKDNENDDBasic
473-504YKAICNKPNTRSNPVRKPGRPPKTPVIPKTKTHydrophilic
535-556RTAKTTTKLKVQHTKRQPSIIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-318KRLAAPKKSAVPERPAAPRSNKRITEIETSRKEKKKIRSIRK
489-493KPGRP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSNLNQLFKRKNQPSLRSNSRPSSSFSSSSSSSRPTLESEDSGLTGLTSRNNNATTKRIFSKLDNLQKMLEKIMKNQEKMQDDIKSVKKEVAILSYDQDCVYSVILESAQNLLEKIIYPTFDQFKETAKSFMEKSDINFFSSLGHRWEPFYHKKIRVDVSTPISIAAKASKISAWKKNPAISNSFRKLFDKVEEDEEDTYMTRIIKNVWPKKKNIPNLQIAWVISIAEIILNPNNENIKISEEIIKPVLLKNLNKIENNESFEYESDSPERLEVAPKRLAAPKKSAVPERPAAPRSNKRITEIETSRKEKKKIRSIRKDNENDDDDDEADEGDKAYEANETYETDEGDEYYNEIINIDETKRYGNFCENVTEILRNIAKYCENFCEILRKYCEILWKFLRILRKYCEILRNIAKFFCANLRSYNSNFLRKCYKCNKIGHFARECLSEKKQFQNNNNKNVSYVEYNSENEYEIYKAICNKPNTRSNPVRKPGRPPKTPVIPKTKTIILKVQEPEILVDFEEDLFEETTPDIEMRERTAKTTTKLKVQHTKRQPSIIDRYP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.82
3 0.84
4 0.82
5 0.83
6 0.81
7 0.76
8 0.68
9 0.65
10 0.62
11 0.58
12 0.51
13 0.46
14 0.43
15 0.41
16 0.42
17 0.4
18 0.36
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.29
23 0.32
24 0.32
25 0.31
26 0.29
27 0.29
28 0.27
29 0.25
30 0.21
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.14
35 0.16
36 0.17
37 0.22
38 0.25
39 0.29
40 0.31
41 0.37
42 0.37
43 0.4
44 0.43
45 0.43
46 0.44
47 0.44
48 0.5
49 0.52
50 0.58
51 0.57
52 0.54
53 0.52
54 0.54
55 0.51
56 0.47
57 0.43
58 0.34
59 0.36
60 0.46
61 0.5
62 0.48
63 0.52
64 0.55
65 0.52
66 0.53
67 0.52
68 0.45
69 0.41
70 0.46
71 0.48
72 0.45
73 0.42
74 0.42
75 0.37
76 0.36
77 0.35
78 0.32
79 0.27
80 0.23
81 0.26
82 0.24
83 0.24
84 0.2
85 0.19
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.09
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.17
107 0.21
108 0.21
109 0.23
110 0.21
111 0.24
112 0.28
113 0.28
114 0.26
115 0.23
116 0.26
117 0.24
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.22
122 0.29
123 0.28
124 0.27
125 0.27
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.18
131 0.2
132 0.18
133 0.2
134 0.24
135 0.29
136 0.36
137 0.4
138 0.45
139 0.5
140 0.54
141 0.58
142 0.6
143 0.56
144 0.51
145 0.5
146 0.47
147 0.42
148 0.37
149 0.31
150 0.26
151 0.22
152 0.19
153 0.15
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.17
159 0.24
160 0.32
161 0.36
162 0.43
163 0.46
164 0.51
165 0.55
166 0.52
167 0.53
168 0.5
169 0.54
170 0.52
171 0.51
172 0.48
173 0.44
174 0.43
175 0.38
176 0.36
177 0.3
178 0.27
179 0.28
180 0.28
181 0.29
182 0.26
183 0.24
184 0.2
185 0.16
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.15
193 0.25
194 0.34
195 0.42
196 0.46
197 0.5
198 0.59
199 0.65
200 0.7
201 0.7
202 0.68
203 0.65
204 0.64
205 0.63
206 0.55
207 0.46
208 0.37
209 0.27
210 0.2
211 0.12
212 0.09
213 0.06
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.16
237 0.16
238 0.21
239 0.27
240 0.31
241 0.31
242 0.33
243 0.34
244 0.34
245 0.38
246 0.33
247 0.26
248 0.23
249 0.22
250 0.24
251 0.19
252 0.16
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.08
259 0.13
260 0.14
261 0.18
262 0.2
263 0.2
264 0.22
265 0.27
266 0.3
267 0.27
268 0.31
269 0.3
270 0.33
271 0.36
272 0.38
273 0.36
274 0.37
275 0.37
276 0.36
277 0.37
278 0.34
279 0.35
280 0.38
281 0.42
282 0.45
283 0.51
284 0.48
285 0.46
286 0.47
287 0.47
288 0.48
289 0.45
290 0.46
291 0.45
292 0.49
293 0.54
294 0.56
295 0.58
296 0.56
297 0.61
298 0.63
299 0.67
300 0.74
301 0.76
302 0.82
303 0.85
304 0.89
305 0.86
306 0.79
307 0.75
308 0.66
309 0.57
310 0.48
311 0.39
312 0.28
313 0.21
314 0.18
315 0.11
316 0.08
317 0.07
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.17
352 0.18
353 0.19
354 0.21
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.2
359 0.15
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.17
367 0.2
368 0.19
369 0.2
370 0.21
371 0.21
372 0.28
373 0.27
374 0.32
375 0.32
376 0.3
377 0.29
378 0.3
379 0.38
380 0.31
381 0.36
382 0.33
383 0.33
384 0.33
385 0.34
386 0.41
387 0.37
388 0.4
389 0.38
390 0.4
391 0.4
392 0.44
393 0.48
394 0.42
395 0.45
396 0.48
397 0.48
398 0.44
399 0.41
400 0.37
401 0.3
402 0.29
403 0.29
404 0.23
405 0.2
406 0.23
407 0.27
408 0.3
409 0.32
410 0.4
411 0.38
412 0.45
413 0.44
414 0.44
415 0.5
416 0.47
417 0.55
418 0.54
419 0.58
420 0.57
421 0.66
422 0.69
423 0.69
424 0.75
425 0.75
426 0.7
427 0.64
428 0.58
429 0.54
430 0.51
431 0.46
432 0.44
433 0.43
434 0.43
435 0.49
436 0.54
437 0.56
438 0.62
439 0.68
440 0.71
441 0.73
442 0.73
443 0.65
444 0.59
445 0.53
446 0.47
447 0.4
448 0.34
449 0.28
450 0.26
451 0.27
452 0.28
453 0.26
454 0.24
455 0.2
456 0.19
457 0.15
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.19
462 0.25
463 0.31
464 0.37
465 0.42
466 0.5
467 0.59
468 0.63
469 0.66
470 0.7
471 0.73
472 0.77
473 0.81
474 0.83
475 0.78
476 0.83
477 0.84
478 0.84
479 0.81
480 0.78
481 0.78
482 0.79
483 0.83
484 0.81
485 0.81
486 0.75
487 0.71
488 0.69
489 0.66
490 0.6
491 0.55
492 0.54
493 0.46
494 0.5
495 0.49
496 0.47
497 0.41
498 0.37
499 0.35
500 0.29
501 0.26
502 0.18
503 0.16
504 0.14
505 0.12
506 0.11
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.11
518 0.13
519 0.17
520 0.25
521 0.25
522 0.27
523 0.34
524 0.38
525 0.4
526 0.49
527 0.48
528 0.5
529 0.57
530 0.64
531 0.67
532 0.71
533 0.77
534 0.78
535 0.84
536 0.81
537 0.82
538 0.78
539 0.76