FuNGI

A0A397GXH6

Protein Details

Accession

A0A397GXH6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MSSTEKKQPPSYGNRKDWKPRTLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
183-197	KFKHKKIPRGPPSPP
285-297	QKEKEEKEKRLRM

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSSTEKKQPPSYGNRKDWKPRTLDDFEDGGAYPEIHIAQYPMDMGRNKINKSGGALPLQVDAEGNIRFDEIARQGHNESKIIHSQFKDLVPMNQRSDVEQITLERPNEDEVKETTEKTREALEKIVQGKIRAAQPKNVKTDKPSEPTYIRYTPGQQGESYNSGAGQRIIRMVEMPVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPAPVLHSPPRKVSAKEQQEWVIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGLQEVTINDNFAKLSEALFAADRHAREEVRQRALMREKLSQKEKEEKEKRLRMLAQKAREERAGISKSTNFSGSVVAESESESESDEEKVKEREDIRQDRRKEREREYRLSRMGAEQRAKHLAREQNRDISEKIALGLAKPTVSKESLYDSRLFNQSEGLSSGFKDEEVYDIYDKPLFAGSSASSIYNPKKNYDPDQFGGGNEESINKMLNNDRFGINSKVFQGADKTQVREGPVEFEKEEADPFGFSQFLDEAKKGSKRGMDTTHESSKNKRQKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.83
3	0.87
4	0.87
5	0.84
6	0.8
7	0.75
8	0.74
9	0.7
10	0.66
11	0.59
12	0.52
13	0.44
14	0.39
15	0.33
16	0.26
17	0.21
18	0.17
19	0.12
20	0.12
21	0.12
22	0.1
23	0.11
24	0.09
25	0.09
26	0.1
27	0.11
28	0.1
29	0.15
30	0.16
31	0.19
32	0.27
33	0.33
34	0.34
35	0.39
36	0.4
37	0.37
38	0.4
39	0.44
40	0.4
41	0.36
42	0.36
43	0.31
44	0.31
45	0.29
46	0.24
47	0.17
48	0.13
49	0.13
50	0.13
51	0.12
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.14
57	0.15
58	0.19
59	0.2
60	0.23
61	0.25
62	0.3
63	0.32
64	0.3
65	0.28
66	0.28
67	0.34
68	0.35
69	0.39
70	0.34
71	0.36
72	0.38
73	0.37
74	0.37
75	0.31
76	0.34
77	0.36
78	0.41
79	0.4
80	0.41
81	0.4
82	0.37
83	0.39
84	0.33
85	0.27
86	0.23
87	0.22
88	0.21
89	0.25
90	0.23
91	0.2
92	0.2
93	0.22
94	0.23
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.24
99	0.25
100	0.26
101	0.27
102	0.28
103	0.28
104	0.26
105	0.31
106	0.28
107	0.28
108	0.31
109	0.3
110	0.32
111	0.34
112	0.37
113	0.32
114	0.3
115	0.3
116	0.3
117	0.33
118	0.36
119	0.35
120	0.38
121	0.46
122	0.53
123	0.59
124	0.6
125	0.55
126	0.52
127	0.58
128	0.58
129	0.54
130	0.51
131	0.48
132	0.46
133	0.48
134	0.5
135	0.44
136	0.38
137	0.35
138	0.35
139	0.35
140	0.37
141	0.34
142	0.28
143	0.28
144	0.3
145	0.3
146	0.27
147	0.2
148	0.16
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.12
153	0.1
154	0.11
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.12
160	0.11
161	0.12
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.13
166	0.16
167	0.14
168	0.16
169	0.26
170	0.33
171	0.34
172	0.45
173	0.52
174	0.59
175	0.68
176	0.77
177	0.76
178	0.78
179	0.79
180	0.77
181	0.72
182	0.66
183	0.59
184	0.49
185	0.45
186	0.39
187	0.4
188	0.42
189	0.42
190	0.39
191	0.39
192	0.44
193	0.41
194	0.41
195	0.43
196	0.44
197	0.47
198	0.48
199	0.48
200	0.45
201	0.44
202	0.43
203	0.37
204	0.31
205	0.22
206	0.19
207	0.18
208	0.24
209	0.22
210	0.27
211	0.3
212	0.32
213	0.35
214	0.35
215	0.37
216	0.29
217	0.31
218	0.31
219	0.34
220	0.28
221	0.28
222	0.3
223	0.27
224	0.27
225	0.27
226	0.22
227	0.15
228	0.16
229	0.15
230	0.15
231	0.15
232	0.14
233	0.12
234	0.13
235	0.12
236	0.14
237	0.12
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.08
243	0.09
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.13
258	0.22
259	0.26
260	0.28
261	0.3
262	0.29
263	0.34
264	0.39
265	0.41
266	0.35
267	0.36
268	0.37
269	0.41
270	0.47
271	0.45
272	0.44
273	0.5
274	0.51
275	0.55
276	0.57
277	0.6
278	0.64
279	0.67
280	0.64
281	0.61
282	0.62
283	0.59
284	0.62
285	0.59
286	0.56
287	0.56
288	0.57
289	0.53
290	0.48
291	0.42
292	0.33
293	0.34
294	0.29
295	0.23
296	0.23
297	0.23
298	0.24
299	0.24
300	0.23
301	0.15
302	0.14
303	0.15
304	0.13
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.11
318	0.11
319	0.13
320	0.15
321	0.15
322	0.19
323	0.2
324	0.26
325	0.34
326	0.43
327	0.5
328	0.57
329	0.63
330	0.67
331	0.75
332	0.77
333	0.74
334	0.74
335	0.76
336	0.75
337	0.78
338	0.77
339	0.76
340	0.69
341	0.63
342	0.55
343	0.5
344	0.49
345	0.47
346	0.45
347	0.38
348	0.39
349	0.45
350	0.45
351	0.4
352	0.4
353	0.41
354	0.44
355	0.5
356	0.5
357	0.5
358	0.52
359	0.53
360	0.46
361	0.41
362	0.34
363	0.25
364	0.22
365	0.16
366	0.14
367	0.12
368	0.13
369	0.11
370	0.11
371	0.11
372	0.12
373	0.13
374	0.14
375	0.14
376	0.13
377	0.2
378	0.23
379	0.26
380	0.28
381	0.27
382	0.3
383	0.34
384	0.33
385	0.26
386	0.25
387	0.23
388	0.21
389	0.21
390	0.18
391	0.14
392	0.13
393	0.15
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.1
399	0.12
400	0.14
401	0.14
402	0.15
403	0.16
404	0.17
405	0.16
406	0.15
407	0.15
408	0.12
409	0.11
410	0.12
411	0.11
412	0.12
413	0.13
414	0.13
415	0.12
416	0.18
417	0.23
418	0.28
419	0.29
420	0.3
421	0.36
422	0.41
423	0.49
424	0.52
425	0.54
426	0.49
427	0.54
428	0.51
429	0.44
430	0.43
431	0.35
432	0.27
433	0.2
434	0.19
435	0.14
436	0.14
437	0.15
438	0.1
439	0.13
440	0.19
441	0.24
442	0.25
443	0.27
444	0.27
445	0.28
446	0.32
447	0.35
448	0.3
449	0.28
450	0.27
451	0.29
452	0.29
453	0.28
454	0.29
455	0.27
456	0.34
457	0.36
458	0.37
459	0.36
460	0.38
461	0.39
462	0.37
463	0.34
464	0.32
465	0.3
466	0.32
467	0.29
468	0.27
469	0.26
470	0.24
471	0.24
472	0.18
473	0.16
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.12
478	0.11
479	0.13
480	0.12
481	0.14
482	0.17
483	0.17
484	0.18
485	0.25
486	0.3
487	0.29
488	0.34
489	0.37
490	0.38
491	0.45
492	0.5
493	0.51
494	0.53
495	0.59
496	0.64
497	0.64
498	0.62
499	0.62
500	0.65

A0A397GXH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer