Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JMF1

Protein Details
Accession A0A397JMF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-448VSPEPLRPAKRRNTDRNNLEGLHydrophilic
504-525EQERLDQRRRLLKAKKNKEIEYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.499, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSTKKFGESSKSAAARATKKSDDPSKWKPGQTMPTAVPWLFLDELGVWDKSDKGNKPKPSQSPSQTPVQKPIPKLTSNNKFTDPTPKPTPKTTPKSTPNSTPKSMSIAKATPKTTHKAVPKQVVNNKKTVSQTVTESRPTTKTTKTGSQPIYEQTMPTAVPWLFLDEMGVWDNLDKNDKKKSFNSNLANENSTFSAKPAKTSPSHKSVNTNNTNTSFKTKSINTNSSTKSINTNSSTKSINLNSSTKSVNTNSRTKSINTNSIIKSESVNVNTNFSTKSFNNTNATKNNSTVFHKNYSTVSKNSANVSVKAVTPKPKALPVPSAAISMTIPTHAIQSKSESKGINSRYTQPKSALTSKVVSVQKTVNSMNKGSPIPKKSHITKVATSNYTLNKATLPKSNQTKSGSLNYNNNGSRSSEKVIGKKREVSPEPLRPAKRRNTDRNNLEGLDQRQISSIIQSMFPRRNARTYYDDDDDDDDLMEATGYEVIREEAVSSKLAKKEDDEQERLDQRRRLLKAKKNKEIEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.51
4 0.52
5 0.47
6 0.49
7 0.57
8 0.63
9 0.64
10 0.66
11 0.68
12 0.71
13 0.74
14 0.73
15 0.7
16 0.69
17 0.69
18 0.65
19 0.62
20 0.54
21 0.52
22 0.52
23 0.46
24 0.39
25 0.31
26 0.28
27 0.22
28 0.2
29 0.15
30 0.12
31 0.14
32 0.16
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.18
38 0.26
39 0.31
40 0.39
41 0.47
42 0.57
43 0.65
44 0.72
45 0.77
46 0.76
47 0.78
48 0.76
49 0.77
50 0.71
51 0.72
52 0.72
53 0.65
54 0.66
55 0.66
56 0.64
57 0.58
58 0.63
59 0.6
60 0.56
61 0.61
62 0.63
63 0.64
64 0.64
65 0.64
66 0.59
67 0.55
68 0.52
69 0.55
70 0.5
71 0.47
72 0.51
73 0.56
74 0.55
75 0.6
76 0.68
77 0.68
78 0.72
79 0.72
80 0.72
81 0.73
82 0.78
83 0.77
84 0.77
85 0.77
86 0.75
87 0.7
88 0.64
89 0.56
90 0.54
91 0.52
92 0.44
93 0.39
94 0.37
95 0.4
96 0.42
97 0.43
98 0.42
99 0.43
100 0.46
101 0.44
102 0.47
103 0.49
104 0.53
105 0.58
106 0.62
107 0.63
108 0.67
109 0.72
110 0.75
111 0.69
112 0.66
113 0.59
114 0.55
115 0.51
116 0.46
117 0.41
118 0.33
119 0.36
120 0.36
121 0.38
122 0.37
123 0.36
124 0.35
125 0.34
126 0.35
127 0.34
128 0.32
129 0.34
130 0.36
131 0.42
132 0.44
133 0.5
134 0.49
135 0.48
136 0.46
137 0.42
138 0.42
139 0.35
140 0.3
141 0.21
142 0.2
143 0.17
144 0.15
145 0.16
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.15
162 0.16
163 0.18
164 0.28
165 0.32
166 0.36
167 0.41
168 0.5
169 0.51
170 0.59
171 0.63
172 0.59
173 0.62
174 0.6
175 0.55
176 0.45
177 0.39
178 0.3
179 0.24
180 0.19
181 0.14
182 0.2
183 0.18
184 0.2
185 0.21
186 0.25
187 0.28
188 0.34
189 0.39
190 0.38
191 0.42
192 0.42
193 0.45
194 0.48
195 0.54
196 0.54
197 0.51
198 0.47
199 0.46
200 0.46
201 0.41
202 0.39
203 0.31
204 0.25
205 0.27
206 0.26
207 0.32
208 0.38
209 0.42
210 0.39
211 0.44
212 0.45
213 0.42
214 0.41
215 0.33
216 0.31
217 0.28
218 0.29
219 0.26
220 0.27
221 0.27
222 0.28
223 0.28
224 0.24
225 0.26
226 0.23
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.19
234 0.21
235 0.2
236 0.24
237 0.26
238 0.32
239 0.32
240 0.35
241 0.36
242 0.34
243 0.4
244 0.37
245 0.39
246 0.35
247 0.39
248 0.36
249 0.36
250 0.35
251 0.27
252 0.24
253 0.19
254 0.19
255 0.15
256 0.19
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.17
264 0.13
265 0.18
266 0.18
267 0.22
268 0.26
269 0.28
270 0.32
271 0.32
272 0.37
273 0.33
274 0.32
275 0.31
276 0.29
277 0.3
278 0.31
279 0.3
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.28
284 0.31
285 0.31
286 0.27
287 0.29
288 0.28
289 0.29
290 0.29
291 0.33
292 0.29
293 0.26
294 0.27
295 0.24
296 0.21
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.26
301 0.28
302 0.27
303 0.3
304 0.32
305 0.31
306 0.32
307 0.28
308 0.29
309 0.26
310 0.25
311 0.21
312 0.19
313 0.16
314 0.12
315 0.1
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.17
324 0.23
325 0.25
326 0.29
327 0.27
328 0.27
329 0.33
330 0.36
331 0.37
332 0.33
333 0.39
334 0.45
335 0.48
336 0.49
337 0.44
338 0.44
339 0.43
340 0.47
341 0.42
342 0.35
343 0.33
344 0.31
345 0.37
346 0.36
347 0.3
348 0.27
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.3
353 0.27
354 0.27
355 0.28
356 0.27
357 0.29
358 0.29
359 0.3
360 0.35
361 0.34
362 0.36
363 0.41
364 0.47
365 0.48
366 0.56
367 0.59
368 0.57
369 0.57
370 0.61
371 0.61
372 0.55
373 0.52
374 0.47
375 0.42
376 0.4
377 0.36
378 0.28
379 0.24
380 0.26
381 0.27
382 0.3
383 0.31
384 0.36
385 0.44
386 0.47
387 0.5
388 0.5
389 0.51
390 0.48
391 0.52
392 0.5
393 0.46
394 0.51
395 0.47
396 0.5
397 0.48
398 0.45
399 0.38
400 0.34
401 0.33
402 0.29
403 0.3
404 0.3
405 0.33
406 0.41
407 0.49
408 0.54
409 0.56
410 0.6
411 0.62
412 0.64
413 0.64
414 0.64
415 0.63
416 0.64
417 0.67
418 0.67
419 0.68
420 0.65
421 0.7
422 0.72
423 0.73
424 0.74
425 0.77
426 0.8
427 0.84
428 0.84
429 0.82
430 0.76
431 0.67
432 0.59
433 0.55
434 0.47
435 0.43
436 0.37
437 0.3
438 0.27
439 0.27
440 0.24
441 0.19
442 0.21
443 0.15
444 0.18
445 0.21
446 0.27
447 0.31
448 0.37
449 0.43
450 0.42
451 0.48
452 0.49
453 0.52
454 0.51
455 0.53
456 0.53
457 0.5
458 0.48
459 0.43
460 0.42
461 0.37
462 0.3
463 0.23
464 0.17
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.06
469 0.05
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.12
480 0.14
481 0.16
482 0.22
483 0.26
484 0.28
485 0.29
486 0.29
487 0.38
488 0.46
489 0.52
490 0.5
491 0.5
492 0.57
493 0.63
494 0.65
495 0.63
496 0.58
497 0.56
498 0.61
499 0.63
500 0.64
501 0.67
502 0.71
503 0.75
504 0.81
505 0.84