Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JDY3

Protein Details
Accession A0A397JDY3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-92LHELIIPTYKPKRKRSPRSQNKFIIFRKHydrophilic
251-278LHELIIPTYKPKRKRSPRSQNKFIIFRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-82PKRKRSPR
261-268PKRKRSPR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MPSHQYNSSSPSPSTSNQYNSSSPSSLPSHQYNYIPDPATLEYIIDSTITTEERQQIELIIFLPLHELIIPTYKPKRKRSPRSQNKFIIFRKDLQARITCENGPQYSCQLKIISNNAKKAWNNLDFEHTLLYEKIANIAKKVHRLMWPDYIYKPNRKEFHPYDSSLPHEYFSNHHINLINPMNSLTDLTNNQFHSPPYIKQLEMKSINNISSYDRSLRDIVDKFTTLEYIIDSTITTEERQQIELIIFLPLHELIIPTYKPKRKRSPRSQNKFIIFRKDLQARITCENGPQYSCQLKIISNNAKKAWNNLDFEHTLLYEKIANIAKKVHRLMWPDYIYKPNRKEFHPYDSSLPHEYFSNHHINLINPMNSLTDLTNNQFHSPPYIKQLEMKSINNISSYDRSLRDIVDKFSRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.41
4 0.42
5 0.46
6 0.45
7 0.45
8 0.48
9 0.42
10 0.36
11 0.35
12 0.35
13 0.34
14 0.37
15 0.38
16 0.38
17 0.41
18 0.43
19 0.43
20 0.43
21 0.46
22 0.41
23 0.36
24 0.34
25 0.31
26 0.3
27 0.25
28 0.2
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.1
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.14
39 0.2
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.17
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.12
57 0.13
58 0.18
59 0.27
60 0.34
61 0.43
62 0.53
63 0.63
64 0.7
65 0.81
66 0.86
67 0.88
68 0.92
69 0.94
70 0.94
71 0.92
72 0.88
73 0.86
74 0.8
75 0.78
76 0.7
77 0.64
78 0.62
79 0.59
80 0.54
81 0.49
82 0.5
83 0.44
84 0.45
85 0.44
86 0.36
87 0.33
88 0.35
89 0.32
90 0.27
91 0.24
92 0.26
93 0.26
94 0.26
95 0.25
96 0.22
97 0.22
98 0.25
99 0.33
100 0.37
101 0.39
102 0.43
103 0.43
104 0.48
105 0.47
106 0.48
107 0.48
108 0.43
109 0.41
110 0.38
111 0.41
112 0.35
113 0.35
114 0.3
115 0.22
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.1
120 0.1
121 0.14
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.23
126 0.25
127 0.3
128 0.32
129 0.32
130 0.33
131 0.38
132 0.41
133 0.43
134 0.43
135 0.39
136 0.4
137 0.44
138 0.44
139 0.47
140 0.48
141 0.47
142 0.48
143 0.48
144 0.54
145 0.5
146 0.54
147 0.51
148 0.48
149 0.44
150 0.43
151 0.44
152 0.37
153 0.33
154 0.25
155 0.21
156 0.2
157 0.17
158 0.2
159 0.22
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.25
165 0.27
166 0.22
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.18
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.25
188 0.26
189 0.28
190 0.3
191 0.29
192 0.27
193 0.26
194 0.27
195 0.23
196 0.22
197 0.17
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.19
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.12
243 0.13
244 0.18
245 0.27
246 0.34
247 0.43
248 0.53
249 0.63
250 0.7
251 0.81
252 0.86
253 0.88
254 0.92
255 0.94
256 0.94
257 0.92
258 0.88
259 0.86
260 0.8
261 0.78
262 0.7
263 0.64
264 0.62
265 0.59
266 0.54
267 0.49
268 0.5
269 0.44
270 0.45
271 0.44
272 0.36
273 0.33
274 0.35
275 0.32
276 0.27
277 0.24
278 0.26
279 0.26
280 0.26
281 0.25
282 0.22
283 0.22
284 0.25
285 0.33
286 0.37
287 0.39
288 0.43
289 0.43
290 0.48
291 0.47
292 0.48
293 0.48
294 0.43
295 0.41
296 0.38
297 0.41
298 0.35
299 0.35
300 0.3
301 0.22
302 0.17
303 0.15
304 0.14
305 0.1
306 0.1
307 0.14
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.23
312 0.25
313 0.3
314 0.32
315 0.32
316 0.33
317 0.38
318 0.41
319 0.43
320 0.43
321 0.39
322 0.4
323 0.44
324 0.44
325 0.47
326 0.48
327 0.47
328 0.48
329 0.48
330 0.54
331 0.5
332 0.54
333 0.51
334 0.48
335 0.44
336 0.43
337 0.44
338 0.37
339 0.33
340 0.25
341 0.21
342 0.2
343 0.17
344 0.2
345 0.22
346 0.19
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.25
351 0.27
352 0.22
353 0.16
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.15
367 0.18
368 0.19
369 0.19
370 0.21
371 0.22
372 0.21
373 0.25
374 0.26
375 0.28
376 0.3
377 0.29
378 0.27
379 0.26
380 0.27
381 0.23
382 0.22
383 0.17
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.17
389 0.17
390 0.17
391 0.2
392 0.21
393 0.26