Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HJB3

Protein Details
Accession A0A397HJB3    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-92LSKGELQKPKRTTKNSKAVVMHydrophilic
200-225SGKPKDKSGPVSKKKRTDEKKPDDARBasic
568-596YTSLFETETKRNKSKKNPKKLALAFEKPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-219KPKDKSGPVSKKKRTDEK
305-309KEKKG
577-587KRNKSKKNPKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MSNTKKRQHEEANSSNNNEVTTSEIKELERGIFESKSNYNNFETLLEYTENESPNVIHASIHALHRSFLPLLSKGELQKPKRTTKNSKAVVMIWLRENYVRYVNKLCSLLGHEEPALQIPALNILLDLLKIESTYLTASSKSHHFSNNHYYRVVEGLIDNENFNEQLKEEFCEKYWNIYDDLRFYFLKDASKIINLAMDSGKPKDKSGPVSKKKRTDEKKPDDARLNNLMENTLSILEGLRKIPTSPSEINNFWTDHPAPELSKKQDANANDTKDLDDMDDASDIELYDIFFEDGDFNMEEKDKKEKKGIKGNKDSSHNNNNIAENKLPILLQLSYHRRVFSDCWLALLKLPMTQELYKKVLLIMHKKIIPYMSQPIMLMDFLTESYNAGGAISILALNGLFTLINEHNLDYPDFYKKLYNLFDRNLMHVKYRARFFRLVDLFLSSTHLPVQLVASFIKRMSRLSLTSPPHGIVIIMPMIYNLIRRHPSCMVLIHRPSDSTSSTSDESDPYDFDEPDPMKSNAIDSSLWEMKTLQNHYFPNIATLAKIFQEKFTKISYNLEDFLDHTYTSLFETETKRNKSKKNPKKLALAFEKPKLVFPVVENENKENDDEESEIKLINLMNGWEIFEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.67
3 0.58
4 0.47
5 0.38
6 0.29
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.25
14 0.27
15 0.23
16 0.21
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.22
21 0.25
22 0.27
23 0.32
24 0.33
25 0.35
26 0.34
27 0.33
28 0.33
29 0.29
30 0.27
31 0.22
32 0.22
33 0.19
34 0.18
35 0.2
36 0.23
37 0.23
38 0.2
39 0.2
40 0.16
41 0.18
42 0.2
43 0.16
44 0.12
45 0.12
46 0.17
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.26
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.2
58 0.23
59 0.25
60 0.27
61 0.27
62 0.36
63 0.43
64 0.44
65 0.5
66 0.55
67 0.62
68 0.69
69 0.75
70 0.77
71 0.78
72 0.84
73 0.81
74 0.78
75 0.71
76 0.63
77 0.61
78 0.54
79 0.46
80 0.39
81 0.34
82 0.3
83 0.29
84 0.29
85 0.24
86 0.29
87 0.28
88 0.28
89 0.32
90 0.33
91 0.36
92 0.35
93 0.33
94 0.26
95 0.29
96 0.3
97 0.26
98 0.25
99 0.21
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.16
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.13
127 0.17
128 0.19
129 0.21
130 0.27
131 0.28
132 0.34
133 0.45
134 0.49
135 0.47
136 0.45
137 0.42
138 0.36
139 0.36
140 0.29
141 0.19
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.1
152 0.07
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.16
159 0.22
160 0.22
161 0.26
162 0.28
163 0.27
164 0.27
165 0.29
166 0.3
167 0.27
168 0.28
169 0.25
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.23
175 0.2
176 0.21
177 0.19
178 0.21
179 0.2
180 0.16
181 0.16
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.2
189 0.19
190 0.2
191 0.24
192 0.27
193 0.34
194 0.43
195 0.51
196 0.57
197 0.67
198 0.74
199 0.77
200 0.81
201 0.83
202 0.8
203 0.81
204 0.82
205 0.8
206 0.83
207 0.79
208 0.78
209 0.75
210 0.69
211 0.64
212 0.59
213 0.52
214 0.42
215 0.37
216 0.31
217 0.23
218 0.21
219 0.16
220 0.09
221 0.07
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.18
233 0.2
234 0.22
235 0.26
236 0.27
237 0.29
238 0.29
239 0.28
240 0.22
241 0.24
242 0.21
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.19
248 0.24
249 0.22
250 0.28
251 0.27
252 0.28
253 0.31
254 0.31
255 0.34
256 0.35
257 0.34
258 0.29
259 0.29
260 0.28
261 0.24
262 0.23
263 0.15
264 0.09
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.19
290 0.21
291 0.23
292 0.31
293 0.37
294 0.44
295 0.54
296 0.61
297 0.61
298 0.68
299 0.73
300 0.7
301 0.69
302 0.66
303 0.62
304 0.62
305 0.53
306 0.46
307 0.41
308 0.38
309 0.34
310 0.32
311 0.26
312 0.18
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.08
320 0.14
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.23
325 0.21
326 0.23
327 0.24
328 0.23
329 0.25
330 0.22
331 0.23
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.16
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.12
341 0.14
342 0.16
343 0.18
344 0.2
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.18
349 0.21
350 0.25
351 0.25
352 0.27
353 0.29
354 0.29
355 0.29
356 0.27
357 0.24
358 0.21
359 0.22
360 0.19
361 0.18
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.15
366 0.12
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.02
389 0.02
390 0.07
391 0.07
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.14
398 0.11
399 0.13
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.17
404 0.17
405 0.22
406 0.26
407 0.3
408 0.31
409 0.32
410 0.38
411 0.36
412 0.39
413 0.39
414 0.34
415 0.31
416 0.31
417 0.35
418 0.33
419 0.38
420 0.38
421 0.38
422 0.41
423 0.4
424 0.45
425 0.42
426 0.38
427 0.33
428 0.31
429 0.27
430 0.24
431 0.26
432 0.16
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.17
449 0.19
450 0.2
451 0.25
452 0.33
453 0.34
454 0.36
455 0.37
456 0.33
457 0.3
458 0.28
459 0.22
460 0.14
461 0.12
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.12
469 0.1
470 0.16
471 0.21
472 0.22
473 0.28
474 0.29
475 0.31
476 0.3
477 0.34
478 0.34
479 0.37
480 0.4
481 0.37
482 0.36
483 0.34
484 0.33
485 0.31
486 0.27
487 0.21
488 0.2
489 0.22
490 0.22
491 0.23
492 0.23
493 0.2
494 0.21
495 0.19
496 0.17
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.16
501 0.23
502 0.21
503 0.23
504 0.28
505 0.26
506 0.24
507 0.24
508 0.25
509 0.19
510 0.21
511 0.17
512 0.14
513 0.21
514 0.23
515 0.23
516 0.22
517 0.22
518 0.22
519 0.29
520 0.32
521 0.28
522 0.31
523 0.32
524 0.34
525 0.37
526 0.33
527 0.3
528 0.27
529 0.24
530 0.18
531 0.18
532 0.17
533 0.16
534 0.2
535 0.18
536 0.21
537 0.28
538 0.29
539 0.3
540 0.33
541 0.35
542 0.32
543 0.39
544 0.38
545 0.36
546 0.37
547 0.35
548 0.31
549 0.28
550 0.3
551 0.24
552 0.19
553 0.14
554 0.13
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.1
559 0.13
560 0.19
561 0.28
562 0.37
563 0.45
564 0.53
565 0.6
566 0.69
567 0.75
568 0.81
569 0.83
570 0.85
571 0.88
572 0.86
573 0.89
574 0.87
575 0.86
576 0.84
577 0.83
578 0.79
579 0.74
580 0.74
581 0.63
582 0.6
583 0.53
584 0.46
585 0.38
586 0.33
587 0.36
588 0.35
589 0.41
590 0.41
591 0.4
592 0.42
593 0.4
594 0.39
595 0.31
596 0.27
597 0.23
598 0.22
599 0.2
600 0.2
601 0.2
602 0.19
603 0.17
604 0.17
605 0.15
606 0.14
607 0.14
608 0.12
609 0.14
610 0.14