Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HC47

Protein Details
Accession A0A397HC47    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-51DNSDNRGPSSKKPKKEKREARFKQVCNKHTKNRIERAMNHydrophilic
152-172EETIISKKKRRKIGDKCPVCFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-34GPSSKKPKKEKREARF
158-163KKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MNNLKRKVGDIPDNSDNRGPSSKKPKKEKREARFKQVCNKHTKNRIERAMNEHMYLIDRKEISETRREYTILGPAGSVYTIIITNTLSCNCPDFLKGFQCKHILFVLLKVLKVDRTSKLIYQKALKTKELESIFVNSPKINLPSKRFINELEETIISKKKRRKIGDKCPVCFDAMETREDLVWCQTGCGNNIHKDCFDRWKQTVPVVTCVVCRAVWKDITLPEHPPLRYMCCLPSSLERYYSPGTSSSSLDKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.53
3 0.46
4 0.4
5 0.42
6 0.38
7 0.39
8 0.48
9 0.54
10 0.61
11 0.71
12 0.78
13 0.81
14 0.9
15 0.91
16 0.91
17 0.93
18 0.91
19 0.92
20 0.91
21 0.86
22 0.85
23 0.83
24 0.8
25 0.79
26 0.8
27 0.78
28 0.78
29 0.82
30 0.81
31 0.81
32 0.82
33 0.78
34 0.75
35 0.73
36 0.72
37 0.64
38 0.55
39 0.45
40 0.37
41 0.33
42 0.29
43 0.22
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.3
51 0.32
52 0.3
53 0.32
54 0.32
55 0.29
56 0.27
57 0.3
58 0.23
59 0.2
60 0.17
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.05
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.21
83 0.27
84 0.26
85 0.29
86 0.33
87 0.32
88 0.32
89 0.29
90 0.24
91 0.19
92 0.18
93 0.22
94 0.18
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.17
100 0.18
101 0.13
102 0.17
103 0.18
104 0.21
105 0.28
106 0.29
107 0.3
108 0.32
109 0.36
110 0.39
111 0.41
112 0.39
113 0.34
114 0.32
115 0.37
116 0.32
117 0.29
118 0.22
119 0.23
120 0.23
121 0.22
122 0.22
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.21
129 0.24
130 0.31
131 0.34
132 0.35
133 0.34
134 0.32
135 0.33
136 0.3
137 0.27
138 0.22
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.23
143 0.18
144 0.23
145 0.29
146 0.34
147 0.43
148 0.5
149 0.59
150 0.65
151 0.76
152 0.8
153 0.82
154 0.78
155 0.74
156 0.66
157 0.56
158 0.45
159 0.36
160 0.33
161 0.26
162 0.25
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.11
169 0.12
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.2
176 0.22
177 0.27
178 0.3
179 0.31
180 0.3
181 0.32
182 0.33
183 0.37
184 0.39
185 0.4
186 0.4
187 0.46
188 0.47
189 0.48
190 0.52
191 0.46
192 0.44
193 0.39
194 0.37
195 0.3
196 0.29
197 0.26
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.23
205 0.26
206 0.31
207 0.32
208 0.32
209 0.32
210 0.37
211 0.36
212 0.35
213 0.33
214 0.34
215 0.35
216 0.34
217 0.32
218 0.28
219 0.29
220 0.29
221 0.35
222 0.35
223 0.34
224 0.36
225 0.33
226 0.36
227 0.38
228 0.37
229 0.29
230 0.27
231 0.28
232 0.26
233 0.28