Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HHH6

Protein Details
Accession A0A397HHH6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-83LSQIRGYASKKKKKRAPFVPANALPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-73KKKKKRA
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 12.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSSVSSISHFTRRILISQFINFYTRTNLINAVNTINKTNTIKANNELTFPEYFKVVELSQIRGYASKKKKKRAPFVPANALPFLDAVSVIKAMEVGWPNHTYEVHVKLGFEKGVQNVRGSVSFPKSMSQTAHFLVFTRGAKVQEALDAGATVVGGEEIVAEIQQGTFKFGEVDRCLATPDMLPAVSKIARILGPKQLMPTLKKGTVTDDIKGAIREMAGKFEFKNDKAGIIHAGIGKLSWTVSELRENIRVLLNEINEQGKAHLSKSKSKPKSIINEVCLNATRAPGIYILDYKDIMSGEKLKFMELNYQDLSLYKLDDLDQNNMNNINIDKSMGIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.36
4 0.39
5 0.4
6 0.35
7 0.35
8 0.31
9 0.28
10 0.27
11 0.25
12 0.22
13 0.21
14 0.24
15 0.24
16 0.27
17 0.27
18 0.26
19 0.28
20 0.27
21 0.28
22 0.25
23 0.28
24 0.26
25 0.29
26 0.32
27 0.33
28 0.35
29 0.38
30 0.45
31 0.41
32 0.41
33 0.38
34 0.34
35 0.31
36 0.29
37 0.25
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.13
43 0.18
44 0.18
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.24
50 0.27
51 0.3
52 0.39
53 0.45
54 0.52
55 0.61
56 0.7
57 0.76
58 0.85
59 0.85
60 0.85
61 0.86
62 0.86
63 0.86
64 0.8
65 0.73
66 0.63
67 0.52
68 0.41
69 0.31
70 0.22
71 0.12
72 0.09
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.09
81 0.12
82 0.12
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.19
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.23
96 0.2
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.18
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.03
139 0.03
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.04
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.28
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.27
191 0.28
192 0.32
193 0.32
194 0.26
195 0.23
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.18
200 0.1
201 0.09
202 0.12
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.21
209 0.25
210 0.22
211 0.28
212 0.24
213 0.26
214 0.25
215 0.26
216 0.21
217 0.18
218 0.19
219 0.14
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.09
230 0.14
231 0.15
232 0.18
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.2
239 0.22
240 0.2
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.19
251 0.21
252 0.31
253 0.4
254 0.51
255 0.53
256 0.58
257 0.63
258 0.67
259 0.73
260 0.74
261 0.72
262 0.67
263 0.67
264 0.62
265 0.58
266 0.51
267 0.43
268 0.33
269 0.26
270 0.21
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.2
286 0.19
287 0.24
288 0.24
289 0.23
290 0.25
291 0.25
292 0.31
293 0.27
294 0.31
295 0.27
296 0.27
297 0.27
298 0.25
299 0.26
300 0.18
301 0.17
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.18
306 0.21
307 0.23
308 0.27
309 0.27
310 0.29
311 0.3
312 0.28
313 0.25
314 0.23
315 0.21
316 0.17
317 0.17