Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JL85

Protein Details
Accession A0A397JL85    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-65IASTSNPSRKRGRPKKEKASTASASTTTTTSPPPRKRGRPRKIQKSDDIPDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-32SRKRGRPKKEKA
45-59PPPRKRGRPRKIQKS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 13.5, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MNNMNNSSTSTIEIASTSNPSRKRGRPKKEKASTASASTTTTTSPPPRKRGRPRKIQKSDDIPDFKKIAKIKEFIKKHVPSVTTDTEDNVSENSKKMAQELWEKDTYKYFLNDDMMTEDETPTIPEGTVKIHEGFDLALTLHNIRAISIARIFAWEKIDKITATSEDETVFENNTRMRNIFENFTRSKAADFIRFTYLLWANKIEQGVDNLNHRGYNFQQFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.16
4 0.18
5 0.24
6 0.27
7 0.32
8 0.4
9 0.48
10 0.58
11 0.64
12 0.72
13 0.76
14 0.84
15 0.9
16 0.91
17 0.91
18 0.86
19 0.84
20 0.77
21 0.69
22 0.61
23 0.51
24 0.42
25 0.34
26 0.29
27 0.21
28 0.19
29 0.19
30 0.25
31 0.34
32 0.4
33 0.49
34 0.58
35 0.67
36 0.77
37 0.84
38 0.85
39 0.87
40 0.9
41 0.92
42 0.93
43 0.9
44 0.86
45 0.85
46 0.8
47 0.78
48 0.74
49 0.64
50 0.58
51 0.53
52 0.45
53 0.41
54 0.38
55 0.36
56 0.34
57 0.36
58 0.38
59 0.46
60 0.48
61 0.48
62 0.55
63 0.5
64 0.48
65 0.49
66 0.44
67 0.37
68 0.41
69 0.39
70 0.31
71 0.29
72 0.27
73 0.23
74 0.21
75 0.18
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.22
87 0.25
88 0.28
89 0.3
90 0.31
91 0.31
92 0.31
93 0.3
94 0.22
95 0.21
96 0.17
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.09
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.17
145 0.19
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.17
164 0.19
165 0.23
166 0.25
167 0.28
168 0.29
169 0.34
170 0.34
171 0.36
172 0.36
173 0.31
174 0.3
175 0.29
176 0.29
177 0.3
178 0.31
179 0.31
180 0.33
181 0.33
182 0.32
183 0.33
184 0.35
185 0.31
186 0.3
187 0.3
188 0.27
189 0.3
190 0.3
191 0.25
192 0.2
193 0.22
194 0.25
195 0.25
196 0.28
197 0.27
198 0.28
199 0.28
200 0.27
201 0.28
202 0.26