Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IM35

Protein Details
Accession A0A397IM35    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-129GENIPSKRLKSSKKEEKKPPAGKVQRIRBasic
347-378QSKLNSIPGKKNKRTRYRLRRVMLRINKKIRCHydrophilic
407-426GMIRRGQRRIRSKTARAMCTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-127KRLKSSKKEEKKPPAGKVQR
355-369GKKNKRTRYRLRRVM
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13.666, nucl 9.5, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010095  Transposase_IS605_OrfB_C  
IPR021027  Transposase_put_HTH  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0032196  P:transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF12323  HTH_OrfB_IS605  
PF07282  OrfB_Zn_ribbon  
Amino Acid Sequences MTSNIRKRPRSAMPVISTENTSGFLPFWNEYTQEESKKWWLPKKTTCAALDSNSWSESLKKRGHKSWFSIQMVVPTIAKQENLQSSQCLWRDITDYVQLPEGENIPSKRLKSSKKEEKKPPAGKVQRIRLYPTQNERLKLRKWMRTVRWTYNQCLIAIEKEGVKRNKKDLRARYINWGRSRGEYSFLPKIKSAEPLPEKLGYDSRLVMNRLGEFYLCIPKPLEIRTENQGPLFSETQEKEGSGVISLDPGWGRSRGEYSFLPKIKSAEPLPEKLGYDSRLVMNRLGEFYLCIPKPLEIRTENQGPLFSETQEKEGSGVISLDPGVRTFMTGYDPSGIAIDHKYDKLQSKLNSIPGKKNKRTRYRLRRVMLRINKKIRCLVDDCHHKLSKWLCENYRVILLPEFRTQGMIRRGQRRIRSKTARAMCTWSHYRFRQHLINKAREHPWCQIVVCTEEYTSKTCGFCGYIHEKLGGSKEFCCPQCKTKINRDINGARNILLKYLTKKESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.6
4 0.52
5 0.44
6 0.36
7 0.28
8 0.23
9 0.18
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.15
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.2
18 0.27
19 0.31
20 0.31
21 0.31
22 0.34
23 0.39
24 0.45
25 0.52
26 0.53
27 0.56
28 0.61
29 0.7
30 0.75
31 0.74
32 0.74
33 0.68
34 0.65
35 0.6
36 0.53
37 0.48
38 0.44
39 0.39
40 0.32
41 0.31
42 0.26
43 0.27
44 0.3
45 0.34
46 0.37
47 0.43
48 0.51
49 0.59
50 0.68
51 0.7
52 0.72
53 0.73
54 0.75
55 0.7
56 0.66
57 0.59
58 0.53
59 0.48
60 0.42
61 0.32
62 0.23
63 0.23
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.19
68 0.24
69 0.27
70 0.28
71 0.26
72 0.28
73 0.35
74 0.35
75 0.31
76 0.26
77 0.24
78 0.26
79 0.25
80 0.25
81 0.23
82 0.24
83 0.22
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.21
88 0.19
89 0.16
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.24
94 0.24
95 0.3
96 0.36
97 0.43
98 0.48
99 0.59
100 0.66
101 0.73
102 0.82
103 0.86
104 0.89
105 0.91
106 0.89
107 0.85
108 0.85
109 0.83
110 0.82
111 0.8
112 0.79
113 0.75
114 0.68
115 0.68
116 0.64
117 0.62
118 0.61
119 0.6
120 0.6
121 0.57
122 0.58
123 0.57
124 0.57
125 0.52
126 0.55
127 0.55
128 0.53
129 0.57
130 0.64
131 0.67
132 0.71
133 0.75
134 0.74
135 0.75
136 0.72
137 0.67
138 0.64
139 0.58
140 0.47
141 0.41
142 0.34
143 0.25
144 0.22
145 0.2
146 0.15
147 0.17
148 0.25
149 0.3
150 0.36
151 0.39
152 0.47
153 0.53
154 0.59
155 0.66
156 0.67
157 0.71
158 0.72
159 0.7
160 0.72
161 0.73
162 0.72
163 0.66
164 0.61
165 0.52
166 0.47
167 0.48
168 0.38
169 0.33
170 0.27
171 0.28
172 0.32
173 0.32
174 0.31
175 0.28
176 0.3
177 0.28
178 0.31
179 0.26
180 0.27
181 0.29
182 0.3
183 0.31
184 0.31
185 0.3
186 0.27
187 0.28
188 0.21
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.16
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.21
210 0.16
211 0.19
212 0.23
213 0.27
214 0.26
215 0.25
216 0.24
217 0.2
218 0.22
219 0.2
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.13
244 0.14
245 0.19
246 0.26
247 0.28
248 0.29
249 0.28
250 0.3
251 0.28
252 0.31
253 0.26
254 0.27
255 0.29
256 0.3
257 0.31
258 0.31
259 0.3
260 0.27
261 0.28
262 0.21
263 0.19
264 0.18
265 0.18
266 0.19
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.12
274 0.1
275 0.1
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.14
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.21
284 0.16
285 0.19
286 0.23
287 0.27
288 0.26
289 0.25
290 0.24
291 0.2
292 0.22
293 0.2
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.08
304 0.08
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.16
331 0.2
332 0.23
333 0.28
334 0.28
335 0.33
336 0.36
337 0.43
338 0.47
339 0.46
340 0.52
341 0.56
342 0.65
343 0.66
344 0.72
345 0.74
346 0.78
347 0.85
348 0.86
349 0.88
350 0.88
351 0.9
352 0.87
353 0.87
354 0.83
355 0.84
356 0.83
357 0.81
358 0.8
359 0.8
360 0.77
361 0.71
362 0.7
363 0.61
364 0.57
365 0.5
366 0.46
367 0.45
368 0.52
369 0.54
370 0.55
371 0.54
372 0.49
373 0.51
374 0.51
375 0.51
376 0.49
377 0.51
378 0.45
379 0.51
380 0.53
381 0.49
382 0.48
383 0.39
384 0.32
385 0.29
386 0.3
387 0.26
388 0.28
389 0.27
390 0.22
391 0.24
392 0.23
393 0.27
394 0.31
395 0.36
396 0.4
397 0.48
398 0.55
399 0.61
400 0.7
401 0.72
402 0.74
403 0.76
404 0.79
405 0.77
406 0.8
407 0.81
408 0.76
409 0.69
410 0.66
411 0.57
412 0.55
413 0.55
414 0.51
415 0.5
416 0.5
417 0.55
418 0.55
419 0.59
420 0.6
421 0.59
422 0.63
423 0.65
424 0.69
425 0.66
426 0.67
427 0.68
428 0.64
429 0.63
430 0.59
431 0.54
432 0.48
433 0.44
434 0.4
435 0.36
436 0.34
437 0.31
438 0.26
439 0.22
440 0.22
441 0.24
442 0.23
443 0.24
444 0.24
445 0.22
446 0.21
447 0.22
448 0.21
449 0.2
450 0.25
451 0.3
452 0.3
453 0.31
454 0.33
455 0.31
456 0.31
457 0.36
458 0.33
459 0.28
460 0.26
461 0.31
462 0.37
463 0.39
464 0.42
465 0.42
466 0.44
467 0.53
468 0.6
469 0.62
470 0.65
471 0.73
472 0.77
473 0.78
474 0.8
475 0.78
476 0.77
477 0.76
478 0.66
479 0.57
480 0.52
481 0.47
482 0.39
483 0.34
484 0.31
485 0.3
486 0.37