Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J0J5

Protein Details
Accession A0A397J0J5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-127LTGSKKANKTSRKKLINKDNNLKQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-179KKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, cyto 4, cyto_pero 2.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0097504  C:Gemini of coiled bodies  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MNFSQEYDPIESDKQLQNVEYYDSYEDEEYSHENSLDLLKDTNEDNSDVWDDSALIAAWDVAIKEYQSFHSVKATESSNVDENNTKNIDTKKTQDFDDLFDLTGSKKANKTSRKKLINKDNNLKQQQPEEEEEEEEEEEEDLLVNEIETFDQGTERVKSTEQEREYLPKSKSNEGKKGKGQIPLPKGFKSASSSSGGREYKSQSNIYNTSLYPPYTHHQQYPGYYSYPPPPPPHNSHHNLPPAAASSSFADFDKDGMTSSSSRTQKKQQGNNEPSGEEVTEDYEQDQDNQQYHWSEAANSAGYGWHPNFFYSNMPPPPPNYHHTEHYPNMQYPPRWSAKTPDIVPPIPPMIDDDSLKDLLMAWYFSGYYTGYYQAKKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.28
4 0.27
5 0.27
6 0.29
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.2
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.14
28 0.15
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.18
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.14
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.08
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.24
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.25
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.25
69 0.23
70 0.26
71 0.26
72 0.23
73 0.25
74 0.28
75 0.33
76 0.32
77 0.38
78 0.4
79 0.41
80 0.42
81 0.44
82 0.41
83 0.38
84 0.38
85 0.33
86 0.25
87 0.23
88 0.22
89 0.16
90 0.18
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.23
95 0.31
96 0.41
97 0.5
98 0.58
99 0.67
100 0.74
101 0.8
102 0.83
103 0.86
104 0.86
105 0.86
106 0.86
107 0.85
108 0.84
109 0.8
110 0.73
111 0.64
112 0.59
113 0.53
114 0.47
115 0.42
116 0.36
117 0.32
118 0.3
119 0.27
120 0.23
121 0.19
122 0.15
123 0.12
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.23
148 0.23
149 0.23
150 0.23
151 0.28
152 0.3
153 0.35
154 0.33
155 0.31
156 0.33
157 0.38
158 0.44
159 0.46
160 0.53
161 0.52
162 0.56
163 0.55
164 0.6
165 0.57
166 0.55
167 0.52
168 0.5
169 0.51
170 0.51
171 0.5
172 0.43
173 0.4
174 0.35
175 0.32
176 0.29
177 0.24
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.27
183 0.25
184 0.21
185 0.22
186 0.24
187 0.25
188 0.28
189 0.3
190 0.24
191 0.29
192 0.3
193 0.29
194 0.28
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.22
203 0.24
204 0.22
205 0.25
206 0.27
207 0.28
208 0.3
209 0.29
210 0.24
211 0.23
212 0.23
213 0.25
214 0.28
215 0.29
216 0.28
217 0.31
218 0.36
219 0.41
220 0.45
221 0.49
222 0.48
223 0.49
224 0.53
225 0.54
226 0.48
227 0.42
228 0.37
229 0.3
230 0.26
231 0.22
232 0.16
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.09
246 0.12
247 0.19
248 0.25
249 0.28
250 0.32
251 0.41
252 0.48
253 0.57
254 0.63
255 0.65
256 0.7
257 0.73
258 0.76
259 0.69
260 0.6
261 0.51
262 0.44
263 0.34
264 0.23
265 0.17
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.19
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.16
285 0.14
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.21
298 0.21
299 0.29
300 0.3
301 0.33
302 0.34
303 0.37
304 0.44
305 0.44
306 0.43
307 0.42
308 0.42
309 0.45
310 0.5
311 0.53
312 0.49
313 0.52
314 0.54
315 0.49
316 0.51
317 0.52
318 0.48
319 0.45
320 0.5
321 0.48
322 0.46
323 0.46
324 0.47
325 0.49
326 0.55
327 0.52
328 0.53
329 0.53
330 0.5
331 0.5
332 0.47
333 0.41
334 0.33
335 0.3
336 0.25
337 0.23
338 0.25
339 0.24
340 0.23
341 0.24
342 0.25
343 0.24
344 0.21
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.14
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.17
358 0.21
359 0.26