Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397I9Y0

Protein Details
Accession A0A397I9Y0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44KDVQTSRKKKVAKNERRKGKADEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-39RKKKVAKNERRKGKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 2.666, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MNNFKRKVDEITSDNDNEKDVQTSRKKKVAKNERRKGKADEREETRLAPYKHVCNKYTRLRMERAMTEYIYLIDCKEINSTKREYMILGPAGSLFVFLKALKVDSNSKLIYQKALLTNELKSIFNRSPRIILPSKSFVEQLKDQIQLIKKNKRKPIDGKCPICLELMNKKEKLVWCQSRCGNNIHEECFNLWKQRKPEVTCVYCQTEWKDLTLPPPPPLNAVQLQQEFELAFKRTKEYNQEQLPRLEFHYPHKLHRSETRGVADYQVRLFIALIIASPIIVSAGRVTYSSFSHSDDAGTDNNNNTIYVNQFLAFTIFLDVYKDESSNGLDNYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.38
3 0.33
4 0.28
5 0.25
6 0.24
7 0.22
8 0.29
9 0.37
10 0.46
11 0.52
12 0.59
13 0.65
14 0.67
15 0.75
16 0.77
17 0.78
18 0.8
19 0.83
20 0.86
21 0.86
22 0.85
23 0.83
24 0.83
25 0.81
26 0.78
27 0.77
28 0.73
29 0.72
30 0.68
31 0.6
32 0.55
33 0.52
34 0.45
35 0.43
36 0.42
37 0.44
38 0.52
39 0.57
40 0.55
41 0.54
42 0.62
43 0.65
44 0.69
45 0.68
46 0.65
47 0.64
48 0.67
49 0.65
50 0.61
51 0.55
52 0.49
53 0.4
54 0.35
55 0.3
56 0.25
57 0.2
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.14
64 0.17
65 0.19
66 0.24
67 0.27
68 0.28
69 0.3
70 0.3
71 0.27
72 0.25
73 0.27
74 0.25
75 0.21
76 0.19
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.12
81 0.07
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.16
91 0.17
92 0.22
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.25
97 0.23
98 0.2
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.21
108 0.17
109 0.21
110 0.22
111 0.26
112 0.29
113 0.26
114 0.27
115 0.28
116 0.34
117 0.32
118 0.31
119 0.3
120 0.32
121 0.32
122 0.29
123 0.3
124 0.25
125 0.26
126 0.25
127 0.25
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.25
132 0.27
133 0.31
134 0.37
135 0.42
136 0.45
137 0.52
138 0.59
139 0.59
140 0.64
141 0.65
142 0.68
143 0.7
144 0.74
145 0.69
146 0.65
147 0.62
148 0.55
149 0.45
150 0.35
151 0.27
152 0.25
153 0.27
154 0.29
155 0.27
156 0.27
157 0.3
158 0.3
159 0.32
160 0.34
161 0.38
162 0.36
163 0.41
164 0.46
165 0.48
166 0.48
167 0.46
168 0.38
169 0.36
170 0.37
171 0.33
172 0.29
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.23
178 0.24
179 0.27
180 0.3
181 0.37
182 0.43
183 0.44
184 0.52
185 0.53
186 0.53
187 0.51
188 0.52
189 0.49
190 0.42
191 0.4
192 0.34
193 0.31
194 0.28
195 0.26
196 0.24
197 0.2
198 0.23
199 0.27
200 0.26
201 0.23
202 0.25
203 0.24
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.21
208 0.22
209 0.25
210 0.23
211 0.24
212 0.21
213 0.2
214 0.16
215 0.14
216 0.16
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.16
221 0.18
222 0.21
223 0.3
224 0.34
225 0.41
226 0.48
227 0.54
228 0.54
229 0.56
230 0.55
231 0.47
232 0.43
233 0.39
234 0.32
235 0.31
236 0.39
237 0.37
238 0.41
239 0.48
240 0.47
241 0.46
242 0.53
243 0.53
244 0.47
245 0.51
246 0.5
247 0.44
248 0.42
249 0.43
250 0.37
251 0.33
252 0.29
253 0.24
254 0.19
255 0.17
256 0.16
257 0.12
258 0.1
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.15
277 0.16
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.19
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.17
288 0.19
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.14
312 0.18
313 0.2