Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397IY07

Protein Details
Accession A0A397IY07    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-133LITPEEREQRRQRYQQRRLEQQIQRENQHydrophilic
639-665AEEERKSKRTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
709-730SQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTHydrophilic
831-872VVKTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-626KQKGKK
644-657RKSKRTVLKKKKKE
839-871PKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF08284  RVP_2  
PF19259  Ty3_capsid  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MVIAKRRNDCVDKAIKQKNEALSEIVERELSREEKDPNYEITYTLKDLNRVKDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVQRLTPEEREQRRQLYRQRQLLITPEEREQRRQRYQQRRLEQQIQRENQNPVTVRLPASNSTTTSPSVTVGTSGTTSRHRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQVTPCVVTPPNNWDQLQNIQTFYQPIDFNLLNQQLAEAHLTASDSSDSSNTDTEDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYATYLEDDAEEWHDEINANDMADWAAWRAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGKTVDAYYARFKRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLIIMQAPGTLAAALELAQAYXNQQLAEAHLTASDSSDSSNTDTEDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNTWDEAKKIRKYATYLEDDAEEWHDEINANDMADWAAWRAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGKTVDAYYARFKRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLIIMQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEAEEERKSKRTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKERHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEIEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLEKRERDDSSDEDTPIKRPRETNIPEPKPSLNTFGLPKTTSVPVPKVVKTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVEQLQNQPAGLSWADALEVPSIRKSFFEVLRKPKEKEIKLADQKYSLKTTALKCNVAVGVYTVPTIVDSGAAISIVTRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKTQPLGIIRDLPITIQGQTIPIDVEVIDAATYSLLLRNNWLMKANVSYNWSDQELTLRWRGKTLTVPANCSKETKEEFSELIENTDEESVNESDTETEEFEEDDDEIIFKNTTIEDHDDESDEDTVPVFLSEKLNKNELDIGQLNTTQQQKFDKLMERNKDLFVNDVSSLGLYLHAKLFWGPEIAILGKKVEIVFHRRRNYFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.66
3 0.65
4 0.68
5 0.66
6 0.61
7 0.55
8 0.47
9 0.41
10 0.4
11 0.37
12 0.31
13 0.25
14 0.2
15 0.2
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.25
20 0.29
21 0.33
22 0.38
23 0.39
24 0.38
25 0.4
26 0.38
27 0.34
28 0.34
29 0.32
30 0.29
31 0.33
32 0.31
33 0.34
34 0.39
35 0.47
36 0.49
37 0.48
38 0.48
39 0.47
40 0.5
41 0.49
42 0.48
43 0.43
44 0.45
45 0.47
46 0.48
47 0.45
48 0.45
49 0.42
50 0.41
51 0.43
52 0.4
53 0.37
54 0.34
55 0.36
56 0.33
57 0.3
58 0.3
59 0.26
60 0.21
61 0.2
62 0.22
63 0.2
64 0.25
65 0.33
66 0.31
67 0.37
68 0.42
69 0.47
70 0.5
71 0.5
72 0.52
73 0.54
74 0.6
75 0.59
76 0.61
77 0.66
78 0.71
79 0.75
80 0.75
81 0.71
82 0.72
83 0.73
84 0.74
85 0.75
86 0.77
87 0.78
88 0.78
89 0.77
90 0.7
91 0.65
92 0.64
93 0.61
94 0.55
95 0.48
96 0.45
97 0.49
98 0.5
99 0.56
100 0.57
101 0.59
102 0.65
103 0.72
104 0.77
105 0.8
106 0.87
107 0.88
108 0.89
109 0.89
110 0.88
111 0.88
112 0.83
113 0.82
114 0.82
115 0.77
116 0.74
117 0.69
118 0.65
119 0.57
120 0.58
121 0.49
122 0.43
123 0.4
124 0.36
125 0.33
126 0.31
127 0.31
128 0.27
129 0.31
130 0.3
131 0.29
132 0.29
133 0.29
134 0.27
135 0.26
136 0.23
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.14
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.21
147 0.3
148 0.38
149 0.48
150 0.54
151 0.58
152 0.67
153 0.75
154 0.78
155 0.8
156 0.76
157 0.73
158 0.69
159 0.69
160 0.6
161 0.5
162 0.45
163 0.42
164 0.43
165 0.42
166 0.43
167 0.4
168 0.45
169 0.47
170 0.45
171 0.46
172 0.49
173 0.48
174 0.49
175 0.47
176 0.43
177 0.45
178 0.42
179 0.36
180 0.3
181 0.32
182 0.33
183 0.35
184 0.35
185 0.32
186 0.34
187 0.38
188 0.39
189 0.33
190 0.3
191 0.26
192 0.27
193 0.26
194 0.24
195 0.21
196 0.17
197 0.15
198 0.19
199 0.19
200 0.19
201 0.24
202 0.25
203 0.2
204 0.2
205 0.2
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.15
247 0.19
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.16
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.2
269 0.24
270 0.27
271 0.24
272 0.25
273 0.25
274 0.3
275 0.35
276 0.31
277 0.29
278 0.36
279 0.44
280 0.44
281 0.44
282 0.42
283 0.39
284 0.42
285 0.47
286 0.44
287 0.41
288 0.4
289 0.39
290 0.36
291 0.33
292 0.3
293 0.24
294 0.18
295 0.12
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.18
317 0.19
318 0.25
319 0.28
320 0.35
321 0.37
322 0.46
323 0.51
324 0.55
325 0.63
326 0.64
327 0.71
328 0.72
329 0.76
330 0.77
331 0.79
332 0.79
333 0.79
334 0.77
335 0.7
336 0.67
337 0.59
338 0.55
339 0.51
340 0.46
341 0.39
342 0.36
343 0.38
344 0.34
345 0.37
346 0.38
347 0.37
348 0.32
349 0.33
350 0.33
351 0.37
352 0.43
353 0.47
354 0.45
355 0.48
356 0.52
357 0.59
358 0.63
359 0.62
360 0.64
361 0.64
362 0.61
363 0.55
364 0.51
365 0.43
366 0.4
367 0.34
368 0.26
369 0.27
370 0.28
371 0.31
372 0.32
373 0.3
374 0.28
375 0.25
376 0.22
377 0.15
378 0.12
379 0.09
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.12
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.15
442 0.19
443 0.17
444 0.17
445 0.17
446 0.18
447 0.19
448 0.18
449 0.16
450 0.12
451 0.15
452 0.16
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.14
457 0.13
458 0.16
459 0.14
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.2
464 0.24
465 0.27
466 0.24
467 0.25
468 0.25
469 0.28
470 0.33
471 0.28
472 0.26
473 0.33
474 0.4
475 0.4
476 0.41
477 0.41
478 0.39
479 0.41
480 0.46
481 0.45
482 0.43
483 0.41
484 0.39
485 0.36
486 0.33
487 0.3
488 0.24
489 0.18
490 0.12
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.11
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.09
509 0.1
510 0.11
511 0.18
512 0.19
513 0.25
514 0.28
515 0.35
516 0.37
517 0.46
518 0.51
519 0.55
520 0.63
521 0.64
522 0.71
523 0.72
524 0.76
525 0.77
526 0.79
527 0.79
528 0.79
529 0.77
530 0.7
531 0.67
532 0.59
533 0.55
534 0.51
535 0.46
536 0.39
537 0.36
538 0.38
539 0.34
540 0.37
541 0.38
542 0.37
543 0.32
544 0.33
545 0.33
546 0.37
547 0.43
548 0.47
549 0.45
550 0.48
551 0.52
552 0.59
553 0.63
554 0.62
555 0.64
556 0.64
557 0.61
558 0.55
559 0.51
560 0.43
561 0.4
562 0.34
563 0.26
564 0.27
565 0.28
566 0.31
567 0.32
568 0.3
569 0.28
570 0.25
571 0.22
572 0.15
573 0.12
574 0.09
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.04
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.02
596 0.02
597 0.02
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.08
604 0.1
605 0.14
606 0.21
607 0.28
608 0.35
609 0.45
610 0.55
611 0.59
612 0.65
613 0.69
614 0.67
615 0.66
616 0.63
617 0.56
618 0.48
619 0.42
620 0.34
621 0.26
622 0.21
623 0.16
624 0.11
625 0.08
626 0.06
627 0.06
628 0.07
629 0.09
630 0.12
631 0.12
632 0.16
633 0.23
634 0.33
635 0.44
636 0.54
637 0.64
638 0.72
639 0.81
640 0.87
641 0.89
642 0.89
643 0.87
644 0.85
645 0.84
646 0.81
647 0.74
648 0.66
649 0.6
650 0.51
651 0.43
652 0.33
653 0.24
654 0.18
655 0.2
656 0.19
657 0.19
658 0.18
659 0.17
660 0.18
661 0.24
662 0.27
663 0.23
664 0.3
665 0.33
666 0.38
667 0.4
668 0.4
669 0.35
670 0.3
671 0.3
672 0.24
673 0.17
674 0.14
675 0.13
676 0.14
677 0.19
678 0.25
679 0.29
680 0.31
681 0.35
682 0.41
683 0.44
684 0.49
685 0.48
686 0.47
687 0.47
688 0.55
689 0.58
690 0.57
691 0.59
692 0.59
693 0.57
694 0.58
695 0.58
696 0.57
697 0.55
698 0.57
699 0.55
700 0.56
701 0.61
702 0.62
703 0.67
704 0.67
705 0.71
706 0.72
707 0.78
708 0.79
709 0.82
710 0.83
711 0.81
712 0.79
713 0.74
714 0.7
715 0.66
716 0.63
717 0.59
718 0.54
719 0.5
720 0.52
721 0.52
722 0.56
723 0.58
724 0.54
725 0.58
726 0.6
727 0.58
728 0.54
729 0.58
730 0.52
731 0.47
732 0.48
733 0.42
734 0.4
735 0.44
736 0.42
737 0.38
738 0.39
739 0.36
740 0.38
741 0.36
742 0.31
743 0.26
744 0.24
745 0.19
746 0.15
747 0.14
748 0.1
749 0.09
750 0.1
751 0.1
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.12
760 0.11
761 0.11
762 0.1
763 0.11
764 0.11
765 0.1
766 0.09
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.1
772 0.11
773 0.12
774 0.14
775 0.17
776 0.17
777 0.21
778 0.24
779 0.23
780 0.29
781 0.31
782 0.29
783 0.3
784 0.3
785 0.3
786 0.34
787 0.33
788 0.3
789 0.28
790 0.31
791 0.39
792 0.43
793 0.49
794 0.53
795 0.55
796 0.55
797 0.56
798 0.54
799 0.48
800 0.44
801 0.39
802 0.3
803 0.27
804 0.27
805 0.27
806 0.28
807 0.24
808 0.24
809 0.21
810 0.21
811 0.22
812 0.22
813 0.22
814 0.26
815 0.3
816 0.3
817 0.3
818 0.29
819 0.29
820 0.28
821 0.36
822 0.39
823 0.44
824 0.5
825 0.56
826 0.66
827 0.7
828 0.77
829 0.78
830 0.79
831 0.8
832 0.83
833 0.85
834 0.86
835 0.89
836 0.89
837 0.86
838 0.84
839 0.82
840 0.81
841 0.78
842 0.77
843 0.74
844 0.73
845 0.75
846 0.77
847 0.79
848 0.8
849 0.81
850 0.81
851 0.81
852 0.84
853 0.82
854 0.78
855 0.72
856 0.68
857 0.64
858 0.65
859 0.6
860 0.54
861 0.52
862 0.51
863 0.52
864 0.47
865 0.42
866 0.35
867 0.32
868 0.28
869 0.19
870 0.15
871 0.12
872 0.09
873 0.08
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.09
881 0.09
882 0.12
883 0.13
884 0.13
885 0.13
886 0.16
887 0.2
888 0.26
889 0.34
890 0.39
891 0.49
892 0.59
893 0.65
894 0.63
895 0.66
896 0.7
897 0.63
898 0.64
899 0.62
900 0.62
901 0.67
902 0.7
903 0.64
904 0.6
905 0.61
906 0.56
907 0.52
908 0.42
909 0.34
910 0.35
911 0.38
912 0.41
913 0.42
914 0.4
915 0.36
916 0.38
917 0.36
918 0.3
919 0.25
920 0.17
921 0.13
922 0.12
923 0.12
924 0.08
925 0.08
926 0.08
927 0.08
928 0.06
929 0.05
930 0.04
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.04
935 0.04
936 0.05
937 0.05
938 0.05
939 0.04
940 0.05
941 0.06
942 0.07
943 0.07
944 0.06
945 0.07
946 0.07
947 0.07
948 0.07
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.06
953 0.07
954 0.07
955 0.07
956 0.08
957 0.08
958 0.09
959 0.11
960 0.16
961 0.22
962 0.25
963 0.26
964 0.27
965 0.29
966 0.32
967 0.36
968 0.36
969 0.34
970 0.37
971 0.4
972 0.39
973 0.38
974 0.34
975 0.28
976 0.26
977 0.22
978 0.17
979 0.13
980 0.12
981 0.12
982 0.12
983 0.13
984 0.1
985 0.09
986 0.09
987 0.08
988 0.08
989 0.06
990 0.06
991 0.05
992 0.05
993 0.05
994 0.04
995 0.04
996 0.04
997 0.07
998 0.09
999 0.1
1000 0.12
1001 0.18
1002 0.21
1003 0.22
1004 0.24
1005 0.22
1006 0.22
1007 0.27
1008 0.27
1009 0.25
1010 0.25
1011 0.26
1012 0.26
1013 0.27
1014 0.27
1015 0.23
1016 0.2
1017 0.23
1018 0.23
1019 0.25
1020 0.31
1021 0.33
1022 0.32
1023 0.34
1024 0.35
1025 0.34
1026 0.38
1027 0.41
1028 0.43
1029 0.41
1030 0.48
1031 0.51
1032 0.55
1033 0.52
1034 0.47
1035 0.42
1036 0.4
1037 0.42
1038 0.41
1039 0.39
1040 0.37
1041 0.36
1042 0.37
1043 0.39
1044 0.31
1045 0.28
1046 0.23
1047 0.19
1048 0.18
1049 0.19
1050 0.15
1051 0.11
1052 0.15
1053 0.13
1054 0.13
1055 0.13
1056 0.12
1057 0.11
1058 0.13
1059 0.14
1060 0.1
1061 0.11
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.1
1067 0.09
1068 0.08
1069 0.08
1070 0.08
1071 0.09
1072 0.09
1073 0.08
1074 0.09
1075 0.09
1076 0.1
1077 0.14
1078 0.18
1079 0.2
1080 0.23
1081 0.24
1082 0.24
1083 0.24
1084 0.26
1085 0.23
1086 0.18
1087 0.16
1088 0.13
1089 0.12
1090 0.1
1091 0.1
1092 0.09
1093 0.1
1094 0.15
1095 0.22
1096 0.3
1097 0.33
1098 0.37
1099 0.37
1100 0.39
1101 0.42
1102 0.37
1103 0.37
1104 0.32
1105 0.31
1106 0.29
1107 0.3
1108 0.28
1109 0.28
1110 0.33
1111 0.27
1112 0.28
1113 0.31
1114 0.33
1115 0.35
1116 0.41
1117 0.45
1118 0.48
1119 0.57
1120 0.62
1121 0.64
1122 0.64
1123 0.63
1124 0.59
1125 0.51
1126 0.46
1127 0.38
1128 0.33
1129 0.26
1130 0.23
1131 0.21
1132 0.17
1133 0.16
1134 0.12
1135 0.13
1136 0.1
1137 0.12
1138 0.13
1139 0.12
1140 0.13
1141 0.14
1142 0.15
1143 0.14
1144 0.15
1145 0.14
1146 0.13
1147 0.16
1148 0.18
1149 0.19
1150 0.18
1151 0.17
1152 0.15
1153 0.17
1154 0.16
1155 0.18
1156 0.22
1157 0.3
1158 0.39
1159 0.48
1160 0.57