FuNGI

A0A397JSK8

Protein Details

Accession

A0A397JSK8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
298-322	EALMIQRERKRRDKQRKLAEMSKYN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
306-313	RKRRDKQR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSGSFFGFDTTMPPLKSDQLAGLDSNGVSTHQDETEEEELERKIKDFALESEEEFEDFGYEQNFDLGTKLEESGDDMNDETFGVVVDVGKYFDFTESTTKIVDTIQKEEEIYIGRKENSSPDNNADENNNRRPSYAALWGNNSDIIINGKNNHSNDIPNLSESPISPSIWGSFHSSSSNRKDSITLPQEVPNISGTFENNQRYTPPPPLNTSPPPGFGPSRQPNPPHPPASLEQIEAQLHRQAGITEKRMLSLAEVEAALLGVNGRPQPPMYPSAETVFREQENGVFLEQEAALLKQEALMIQRERKRRDKQRKLAEMSKYNGLMTQNDKEFINRIQISQLVTDDPYADDFYYQVYTAIRTRQPNSQIFSPQIGGAGFTGQERGRHRSRGSESGSLKMQQQVLRIVNDARRKPKMTQLSLEGALGKIALNSVRNPRQLLQVSSKNTDLLHHAGPNSNGGFHHQHQKIPSISSHGVIDHRKVLRSIENVYSVVLSLEELRRNQPPLPRPYFDHEREAFDKWNEEYTEYAKTMWEELRVTEMIGVSYPHPFISILSVAKGKKVIPRVLRHCLPEQILTLITMLVANFESLDVCKGAVWGTQENVGSRMLEEVELFMNTVVPPLLQFVAEAPLRIVLGLFGLFIERNNIVWVARSKVGLAFLTMFLSRAEILKQGGGTIQGLPPPEERELIQWQELYNRLFSILQNHFLSLFPPFLIGIDDMYVWQFLAAMAVGASTEQQHILVTEVRERVLETVLQASRLSADKKSHKIANVNLFLNALGLDASQLKI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.27
4	0.26
5	0.24
6	0.23
7	0.24
8	0.23
9	0.22
10	0.2
11	0.18
12	0.17
13	0.14
14	0.11
15	0.11
16	0.12
17	0.13
18	0.12
19	0.14
20	0.14
21	0.2
22	0.22
23	0.22
24	0.21
25	0.21
26	0.21
27	0.23
28	0.23
29	0.17
30	0.17
31	0.17
32	0.2
33	0.2
34	0.22
35	0.26
36	0.27
37	0.27
38	0.29
39	0.28
40	0.25
41	0.22
42	0.19
43	0.13
44	0.11
45	0.12
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.1
51	0.09
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.12
57	0.11
58	0.11
59	0.14
60	0.16
61	0.15
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.09
68	0.06
69	0.06
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.08
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.11
82	0.16
83	0.17
84	0.18
85	0.18
86	0.17
87	0.17
88	0.19
89	0.24
90	0.21
91	0.25
92	0.26
93	0.26
94	0.27
95	0.26
96	0.25
97	0.23
98	0.22
99	0.21
100	0.23
101	0.23
102	0.24
103	0.25
104	0.3
105	0.32
106	0.35
107	0.35
108	0.36
109	0.4
110	0.39
111	0.4
112	0.38
113	0.39
114	0.41
115	0.46
116	0.48
117	0.43
118	0.43
119	0.43
120	0.42
121	0.39
122	0.4
123	0.38
124	0.34
125	0.38
126	0.38
127	0.38
128	0.34
129	0.29
130	0.2
131	0.15
132	0.15
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.19
137	0.25
138	0.26
139	0.28
140	0.27
141	0.27
142	0.28
143	0.3
144	0.28
145	0.24
146	0.24
147	0.22
148	0.21
149	0.19
150	0.22
151	0.19
152	0.19
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.18
157	0.19
158	0.18
159	0.17
160	0.18
161	0.22
162	0.24
163	0.3
164	0.37
165	0.4
166	0.35
167	0.35
168	0.36
169	0.34
170	0.42
171	0.4
172	0.36
173	0.33
174	0.36
175	0.37
176	0.35
177	0.34
178	0.26
179	0.2
180	0.17
181	0.16
182	0.14
183	0.15
184	0.21
185	0.24
186	0.22
187	0.23
188	0.24
189	0.27
190	0.3
191	0.35
192	0.35
193	0.34
194	0.39
195	0.43
196	0.48
197	0.48
198	0.51
199	0.43
200	0.4
201	0.39
202	0.36
203	0.34
204	0.29
205	0.35
206	0.36
207	0.41
208	0.43
209	0.46
210	0.51
211	0.58
212	0.63
213	0.56
214	0.49
215	0.47
216	0.44
217	0.47
218	0.4
219	0.32
220	0.26
221	0.26
222	0.26
223	0.22
224	0.21
225	0.17
226	0.15
227	0.15
228	0.14
229	0.11
230	0.17
231	0.22
232	0.24
233	0.26
234	0.26
235	0.26
236	0.26
237	0.25
238	0.19
239	0.16
240	0.13
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.06
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.05
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.13
257	0.17
258	0.18
259	0.2
260	0.2
261	0.22
262	0.26
263	0.25
264	0.25
265	0.24
266	0.21
267	0.2
268	0.18
269	0.17
270	0.15
271	0.15
272	0.12
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.11
288	0.13
289	0.19
290	0.26
291	0.32
292	0.38
293	0.47
294	0.56
295	0.64
296	0.73
297	0.78
298	0.82
299	0.85
300	0.89
301	0.87
302	0.84
303	0.8
304	0.75
305	0.66
306	0.59
307	0.49
308	0.39
309	0.34
310	0.27
311	0.22
312	0.19
313	0.21
314	0.18
315	0.19
316	0.19
317	0.17
318	0.18
319	0.17
320	0.21
321	0.18
322	0.17
323	0.17
324	0.19
325	0.19
326	0.17
327	0.17
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.09
345	0.13
346	0.17
347	0.19
348	0.21
349	0.26
350	0.32
351	0.35
352	0.37
353	0.36
354	0.34
355	0.32
356	0.31
357	0.26
358	0.2
359	0.16
360	0.13
361	0.1
362	0.08
363	0.07
364	0.05
365	0.05
366	0.07
367	0.07
368	0.11
369	0.14
370	0.19
371	0.22
372	0.26
373	0.27
374	0.32
375	0.36
376	0.39
377	0.4
378	0.42
379	0.4
380	0.39
381	0.39
382	0.33
383	0.3
384	0.25
385	0.24
386	0.18
387	0.19
388	0.21
389	0.22
390	0.21
391	0.21
392	0.2
393	0.22
394	0.27
395	0.3
396	0.31
397	0.33
398	0.35
399	0.36
400	0.42
401	0.46
402	0.43
403	0.41
404	0.4
405	0.39
406	0.36
407	0.35
408	0.27
409	0.18
410	0.14
411	0.12
412	0.07
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.08
418	0.15
419	0.2
420	0.21
421	0.23
422	0.24
423	0.3
424	0.31
425	0.32
426	0.32
427	0.34
428	0.36
429	0.36
430	0.35
431	0.29
432	0.27
433	0.24
434	0.21
435	0.17
436	0.16
437	0.15
438	0.15
439	0.16
440	0.16
441	0.18
442	0.15
443	0.12
444	0.11
445	0.13
446	0.17
447	0.17
448	0.26
449	0.25
450	0.28
451	0.28
452	0.33
453	0.31
454	0.29
455	0.28
456	0.24
457	0.24
458	0.22
459	0.21
460	0.18
461	0.2
462	0.2
463	0.21
464	0.21
465	0.21
466	0.21
467	0.21
468	0.22
469	0.23
470	0.24
471	0.26
472	0.23
473	0.24
474	0.23
475	0.22
476	0.2
477	0.15
478	0.13
479	0.09
480	0.06
481	0.06
482	0.09
483	0.11
484	0.12
485	0.15
486	0.17
487	0.2
488	0.23
489	0.28
490	0.33
491	0.4
492	0.45
493	0.45
494	0.46
495	0.51
496	0.57
497	0.53
498	0.53
499	0.45
500	0.45
501	0.45
502	0.44
503	0.39
504	0.32
505	0.31
506	0.24
507	0.27
508	0.21
509	0.2
510	0.19
511	0.18
512	0.2
513	0.18
514	0.17
515	0.14
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.15
520	0.13
521	0.12
522	0.16
523	0.15
524	0.15
525	0.13
526	0.12
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.07
531	0.09
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.11
538	0.13
539	0.11
540	0.13
541	0.17
542	0.17
543	0.18
544	0.19
545	0.18
546	0.21
547	0.27
548	0.33
549	0.36
550	0.46
551	0.52
552	0.58
553	0.6
554	0.59
555	0.56
556	0.53
557	0.47
558	0.4
559	0.34
560	0.27
561	0.23
562	0.19
563	0.16
564	0.12
565	0.09
566	0.08
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.07
581	0.08
582	0.11
583	0.11
584	0.12
585	0.15
586	0.16
587	0.17
588	0.17
589	0.16
590	0.13
591	0.12
592	0.12
593	0.1
594	0.09
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.07
608	0.08
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.12
613	0.12
614	0.12
615	0.1
616	0.11
617	0.11
618	0.11
619	0.1
620	0.05
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.1
632	0.11
633	0.1
634	0.15
635	0.17
636	0.18
637	0.2
638	0.2
639	0.19
640	0.2
641	0.22
642	0.18
643	0.17
644	0.15
645	0.13
646	0.15
647	0.14
648	0.13
649	0.11
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.11
655	0.12
656	0.13
657	0.13
658	0.12
659	0.12
660	0.12
661	0.12
662	0.12
663	0.12
664	0.13
665	0.14
666	0.16
667	0.17
668	0.19
669	0.2
670	0.2
671	0.19
672	0.22
673	0.27
674	0.28
675	0.29
676	0.26
677	0.25
678	0.29
679	0.32
680	0.29
681	0.24
682	0.21
683	0.2
684	0.2
685	0.21
686	0.25
687	0.24
688	0.29
689	0.28
690	0.28
691	0.28
692	0.26
693	0.26
694	0.19
695	0.17
696	0.11
697	0.11
698	0.1
699	0.09
700	0.11
701	0.11
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.1
707	0.09
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.05
712	0.06
713	0.05
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.11
727	0.15
728	0.15
729	0.2
730	0.21
731	0.22
732	0.22
733	0.22
734	0.21
735	0.19
736	0.18
737	0.14
738	0.2
739	0.2
740	0.22
741	0.21
742	0.19
743	0.2
744	0.23
745	0.24
746	0.22
747	0.3
748	0.38
749	0.45
750	0.52
751	0.55
752	0.57
753	0.62
754	0.66
755	0.67
756	0.66
757	0.6
758	0.53
759	0.48
760	0.41
761	0.34
762	0.25
763	0.15
764	0.08
765	0.06
766	0.07

A0A397JSK8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer