Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397G897

Protein Details
Accession A0A397G897    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-324AGKEHSTRLKSKKSKAKNYLEIEQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-119RGARTTERGRGSRGGRRGRE
333-365FPRGRGRGRGSRGGGRRDQDIGGGGGGGGRRGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MASVASRNLFDLLNDNEEDVESVMPEKETTREVVVQKKVDRSRASPKEARIRHEYPLRGGFKTPPVNNRSEDTRSSAPRDRNVGPRFNREGGDYPGRTSRGARTTERGRGSRGGRRGREHDRHSSTGRFDSDKKETQAWGNPTAWENSEQTEPTVPDPNTTAGWGGDGTTESAGNAWRADSTDAVNETTAKSGWDAPDESPTSLEAAVGGGEIVPPADWEEGKGEQPAWESKEDETANEEPVPIVEEEVKTFDEYLAEKAQKSLDISLPEVRKANEGADDSQWKDAVPLEKDDEEDMLFAGKEHSTRLKSKKSKAKNYLEIEQTFIERSGGGFPRGRGRGRGSRGGGRRDQDIGGGGGGGGRRGRGGYVNLDDQRAFPSLGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.15
7 0.11
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.16
17 0.18
18 0.24
19 0.28
20 0.36
21 0.42
22 0.46
23 0.49
24 0.57
25 0.58
26 0.6
27 0.6
28 0.58
29 0.63
30 0.65
31 0.69
32 0.66
33 0.68
34 0.71
35 0.71
36 0.7
37 0.68
38 0.62
39 0.61
40 0.63
41 0.58
42 0.53
43 0.58
44 0.56
45 0.48
46 0.47
47 0.44
48 0.44
49 0.5
50 0.48
51 0.48
52 0.49
53 0.52
54 0.52
55 0.51
56 0.49
57 0.45
58 0.43
59 0.4
60 0.42
61 0.42
62 0.46
63 0.5
64 0.49
65 0.49
66 0.53
67 0.51
68 0.55
69 0.56
70 0.59
71 0.56
72 0.6
73 0.6
74 0.57
75 0.53
76 0.47
77 0.45
78 0.42
79 0.45
80 0.37
81 0.33
82 0.35
83 0.35
84 0.33
85 0.31
86 0.31
87 0.3
88 0.34
89 0.35
90 0.37
91 0.43
92 0.5
93 0.54
94 0.49
95 0.46
96 0.48
97 0.51
98 0.51
99 0.53
100 0.54
101 0.54
102 0.58
103 0.62
104 0.65
105 0.69
106 0.67
107 0.68
108 0.65
109 0.64
110 0.62
111 0.58
112 0.51
113 0.47
114 0.43
115 0.36
116 0.32
117 0.34
118 0.37
119 0.38
120 0.38
121 0.36
122 0.35
123 0.35
124 0.4
125 0.37
126 0.35
127 0.3
128 0.29
129 0.28
130 0.27
131 0.24
132 0.2
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.2
142 0.18
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.06
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.12
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.24
255 0.24
256 0.25
257 0.25
258 0.23
259 0.22
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.23
268 0.24
269 0.23
270 0.19
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.23
278 0.24
279 0.24
280 0.22
281 0.16
282 0.14
283 0.11
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.11
291 0.17
292 0.21
293 0.29
294 0.37
295 0.47
296 0.55
297 0.64
298 0.72
299 0.76
300 0.83
301 0.85
302 0.88
303 0.87
304 0.84
305 0.82
306 0.79
307 0.69
308 0.6
309 0.51
310 0.42
311 0.33
312 0.27
313 0.2
314 0.13
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.2
319 0.22
320 0.24
321 0.32
322 0.38
323 0.39
324 0.38
325 0.44
326 0.49
327 0.53
328 0.6
329 0.57
330 0.6
331 0.65
332 0.68
333 0.67
334 0.6
335 0.56
336 0.51
337 0.46
338 0.38
339 0.32
340 0.25
341 0.19
342 0.16
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.12
352 0.15
353 0.18
354 0.23
355 0.27
356 0.36
357 0.37
358 0.39
359 0.38
360 0.35
361 0.34
362 0.3
363 0.25