Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JIJ8

Protein Details
Accession A0A397JIJ8    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
499-518ATLLHFRHKKTKKYESSSEDHydrophilic
523-550SSEDEKSRFKKKEQKKKKPSSNEEMDELHydrophilic
570-598KQAGRRERTNEPRKPFPRNNNNNNNNINNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
529-541SRFKKKEQKKKKP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MDFVSDSGPSVSPKEEYFAICIDDDFVKRFENRKDSVFCKTYEINSVTNSQAQLSIDIYNYDGTQKPAQVRSISISTGIYPLYIHMISLSQIEELNRAITEIAALYQQKIRDIVDQTPDDQDPVWKLSDLEELRRIHEQLKLLFQIRDNCVKIIQDLEQLQNMNQRNRINQESQHQRSHSQPEIQRPTSPRIRSHVYQQTSNRSSLNLSLSQYTTPLTVRSGNLSLVESVSSRTRSPPTPTFFNRLEERSPSPLENLRQFQRDYLTGIDSHSSDEETTYIYQPIAGSSRPNPNQNLIDFSDQLIINYLQHNSQEEGQQEQQEEQEEEQDNQNNNLLFQYYNPNIRNNNNTPEPEEDNLPSGSSSEYTNNNSEESEEEMVFVVKLPKFSGTHNEDPKEWLEDFVMACHANNWNDERTKNAFGAYLRKGACEWYLEWYKANDGADWPTTRDAFSAKYCNDAFKEQWLDELRGLKQRKGESIEEYYYQVKKMARQAGINANATLLHFRHKKTKKYESSSEDSDNESSEDEKSRFKKKEQKKKKPSSNEEMDELTKRFNKLQINLIQQVEGIAKQAGRRERTNEPRKPFPRNNNNNNNNINNQNYHNNYTPNYNPNYNPNYNNSYNSNFLRRCYKCNEQDIRMKLLGYNLSALTKADRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.2
8 0.2
9 0.19
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.21
15 0.25
16 0.31
17 0.37
18 0.42
19 0.44
20 0.49
21 0.55
22 0.55
23 0.6
24 0.57
25 0.5
26 0.48
27 0.48
28 0.43
29 0.44
30 0.44
31 0.36
32 0.35
33 0.37
34 0.33
35 0.32
36 0.3
37 0.23
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.17
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.17
51 0.2
52 0.24
53 0.29
54 0.32
55 0.37
56 0.35
57 0.35
58 0.36
59 0.35
60 0.32
61 0.27
62 0.24
63 0.2
64 0.2
65 0.17
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.19
98 0.21
99 0.24
100 0.26
101 0.31
102 0.32
103 0.31
104 0.34
105 0.33
106 0.28
107 0.24
108 0.23
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.24
116 0.23
117 0.25
118 0.3
119 0.3
120 0.32
121 0.35
122 0.34
123 0.28
124 0.3
125 0.3
126 0.26
127 0.3
128 0.32
129 0.32
130 0.32
131 0.34
132 0.37
133 0.37
134 0.42
135 0.38
136 0.34
137 0.33
138 0.32
139 0.29
140 0.24
141 0.22
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.22
148 0.26
149 0.29
150 0.28
151 0.31
152 0.32
153 0.33
154 0.38
155 0.43
156 0.41
157 0.4
158 0.46
159 0.52
160 0.55
161 0.57
162 0.53
163 0.5
164 0.51
165 0.54
166 0.5
167 0.47
168 0.46
169 0.5
170 0.57
171 0.56
172 0.56
173 0.52
174 0.55
175 0.55
176 0.55
177 0.48
178 0.45
179 0.5
180 0.47
181 0.52
182 0.54
183 0.49
184 0.52
185 0.53
186 0.57
187 0.53
188 0.53
189 0.44
190 0.36
191 0.33
192 0.29
193 0.28
194 0.21
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.11
214 0.11
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.18
222 0.21
223 0.27
224 0.33
225 0.36
226 0.42
227 0.45
228 0.48
229 0.46
230 0.47
231 0.44
232 0.4
233 0.37
234 0.34
235 0.33
236 0.32
237 0.32
238 0.28
239 0.27
240 0.28
241 0.29
242 0.31
243 0.32
244 0.31
245 0.32
246 0.32
247 0.31
248 0.28
249 0.26
250 0.22
251 0.19
252 0.17
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.21
276 0.23
277 0.27
278 0.27
279 0.3
280 0.32
281 0.31
282 0.31
283 0.25
284 0.24
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.1
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.19
319 0.15
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.07
324 0.08
325 0.13
326 0.13
327 0.19
328 0.2
329 0.24
330 0.26
331 0.28
332 0.34
333 0.32
334 0.36
335 0.33
336 0.33
337 0.32
338 0.33
339 0.33
340 0.27
341 0.25
342 0.2
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.12
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.11
353 0.14
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.23
376 0.26
377 0.33
378 0.39
379 0.4
380 0.38
381 0.39
382 0.39
383 0.34
384 0.27
385 0.19
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.12
390 0.12
391 0.09
392 0.08
393 0.09
394 0.11
395 0.1
396 0.12
397 0.14
398 0.17
399 0.19
400 0.19
401 0.23
402 0.25
403 0.27
404 0.25
405 0.23
406 0.22
407 0.21
408 0.28
409 0.25
410 0.27
411 0.24
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.23
416 0.18
417 0.16
418 0.17
419 0.2
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.21
424 0.21
425 0.21
426 0.15
427 0.13
428 0.15
429 0.17
430 0.17
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.15
436 0.14
437 0.14
438 0.17
439 0.22
440 0.2
441 0.25
442 0.25
443 0.27
444 0.29
445 0.29
446 0.27
447 0.26
448 0.3
449 0.24
450 0.3
451 0.29
452 0.29
453 0.28
454 0.31
455 0.27
456 0.32
457 0.34
458 0.31
459 0.34
460 0.34
461 0.37
462 0.39
463 0.39
464 0.36
465 0.4
466 0.4
467 0.36
468 0.35
469 0.34
470 0.3
471 0.27
472 0.26
473 0.22
474 0.24
475 0.31
476 0.36
477 0.35
478 0.36
479 0.4
480 0.44
481 0.48
482 0.45
483 0.37
484 0.29
485 0.27
486 0.25
487 0.23
488 0.15
489 0.18
490 0.2
491 0.23
492 0.34
493 0.41
494 0.5
495 0.57
496 0.67
497 0.7
498 0.74
499 0.81
500 0.78
501 0.77
502 0.73
503 0.68
504 0.58
505 0.51
506 0.43
507 0.35
508 0.28
509 0.22
510 0.17
511 0.15
512 0.18
513 0.16
514 0.23
515 0.28
516 0.37
517 0.41
518 0.48
519 0.57
520 0.63
521 0.73
522 0.78
523 0.84
524 0.86
525 0.93
526 0.95
527 0.95
528 0.94
529 0.93
530 0.91
531 0.84
532 0.75
533 0.68
534 0.6
535 0.52
536 0.44
537 0.39
538 0.32
539 0.31
540 0.3
541 0.32
542 0.36
543 0.36
544 0.44
545 0.47
546 0.5
547 0.53
548 0.51
549 0.45
550 0.38
551 0.36
552 0.28
553 0.2
554 0.14
555 0.11
556 0.11
557 0.13
558 0.2
559 0.26
560 0.3
561 0.35
562 0.39
563 0.48
564 0.58
565 0.66
566 0.69
567 0.69
568 0.75
569 0.78
570 0.83
571 0.82
572 0.82
573 0.83
574 0.85
575 0.88
576 0.88
577 0.89
578 0.87
579 0.84
580 0.78
581 0.71
582 0.66
583 0.59
584 0.51
585 0.48
586 0.48
587 0.46
588 0.47
589 0.46
590 0.44
591 0.42
592 0.45
593 0.46
594 0.45
595 0.46
596 0.45
597 0.44
598 0.49
599 0.56
600 0.55
601 0.54
602 0.53
603 0.55
604 0.53
605 0.55
606 0.51
607 0.46
608 0.47
609 0.47
610 0.5
611 0.44
612 0.45
613 0.51
614 0.5
615 0.52
616 0.54
617 0.6
618 0.59
619 0.68
620 0.73
621 0.7
622 0.76
623 0.74
624 0.73
625 0.64
626 0.55
627 0.46
628 0.43
629 0.38
630 0.3
631 0.28
632 0.22
633 0.22
634 0.22
635 0.21