Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H1T5

Protein Details
Accession A0A397H1T5    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-76ADVERKLKKTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
208-231DTPIKRPRETNIPEPKKRKRRKLKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-36KQKGKK
54-67RKLKKTVLKKKKKE
213-232RPRETNIPEPKXKRKRRKLK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEADVERKLKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLTKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNDWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLGKRERNDSSDEDTPIKRPRETNIPEPKXKRKRRKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.05
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.14
15 0.18
16 0.24
17 0.33
18 0.4
19 0.48
20 0.58
21 0.68
22 0.71
23 0.76
24 0.8
25 0.78
26 0.77
27 0.74
28 0.69
29 0.63
30 0.55
31 0.45
32 0.36
33 0.3
34 0.23
35 0.17
36 0.12
37 0.08
38 0.08
39 0.1
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.19
44 0.25
45 0.35
46 0.46
47 0.55
48 0.63
49 0.71
50 0.81
51 0.87
52 0.9
53 0.91
54 0.89
55 0.88
56 0.86
57 0.85
58 0.78
59 0.7
60 0.65
61 0.55
62 0.47
63 0.37
64 0.27
65 0.21
66 0.22
67 0.21
68 0.22
69 0.21
70 0.2
71 0.22
72 0.27
73 0.3
74 0.26
75 0.34
76 0.36
77 0.4
78 0.42
79 0.42
80 0.37
81 0.33
82 0.32
83 0.25
84 0.17
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.18
89 0.24
90 0.27
91 0.29
92 0.32
93 0.39
94 0.41
95 0.45
96 0.44
97 0.43
98 0.43
99 0.5
100 0.53
101 0.52
102 0.54
103 0.54
104 0.52
105 0.53
106 0.54
107 0.5
108 0.47
109 0.48
110 0.44
111 0.45
112 0.5
113 0.51
114 0.54
115 0.57
116 0.64
117 0.66
118 0.74
119 0.75
120 0.78
121 0.8
122 0.79
123 0.76
124 0.72
125 0.68
126 0.64
127 0.61
128 0.57
129 0.53
130 0.47
131 0.47
132 0.44
133 0.44
134 0.45
135 0.4
136 0.42
137 0.44
138 0.43
139 0.37
140 0.44
141 0.39
142 0.33
143 0.35
144 0.32
145 0.31
146 0.35
147 0.37
148 0.33
149 0.37
150 0.37
151 0.39
152 0.38
153 0.33
154 0.28
155 0.26
156 0.21
157 0.17
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.14
183 0.15
184 0.18
185 0.22
186 0.26
187 0.27
188 0.3
189 0.35
190 0.35
191 0.41
192 0.42
193 0.42
194 0.42
195 0.39
196 0.42
197 0.45
198 0.44
199 0.41
200 0.39
201 0.41
202 0.48
203 0.53
204 0.58
205 0.61
206 0.67
207 0.73
208 0.81
209 0.86
210 0.87
211 0.91