Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JMG6

Protein Details
Accession A0A397JMG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
595-616IGIRKGAPKKRASKKVDEKSLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
597-610IRKGAPKKRASKKV
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
Amino Acid Sequences MWEPVRGTLQWQSFPRAIGVELPYVVALLRNNYIEVHNIMDQQVVQSVQLSSKSRTISTGPGIKVQVAGLTEKLKWENVILESSNNNIDNNKTPQQSIIEQANFLATVPTRLIIAGSESVMALAATPLIVQVDSMLDANCVEEALEMAEQAISTATPENVHSERMRHEFNYIHQKSGFIYLGETFFDLAVSLFEKGKTDPRILIRLFPEMREVIGDDDPINMYSGVKAVADRLGSIEDIVSSSMIKNYDPHIKPDIDTSPATQELRKALITNAKDMLQKFLTWDRGQRKSTSNVLTKKDKVILKAVDNALLRLYTESDSEDLLRSLLESENECDLDLCKKVLEENEKFYPLSLLYKQRKEYRKTLEIWQRLIDQENSDLDFPDGLKQMADLLAKLDDQELVWECASWVIHKNEIIGAKIFILQDAKKPLLVDPSTVLQELRSVGKEGLKLFLEYLVDTRKSQEDEHHTEYVLLSIQDIKAESLKKETRLKFDALTKEFTEHKQSGQTYLSFLMNQPIEDSFSQARTRLILFLQSSNRYKADEVLLKLKEAEILKAELAVVYGKLEQHEIALKILINDLKDYRGGEIYCLQAGRVIGIRKGAPKKRASKKVDEKSLTTKRRTLFLTLLKVYLEMDNRDEMVDIVIHLLNTQAVYLDIMEVLSLLPEYWSIEMLNNFLVRSLRQSYHNYREGQILKGLCRGENLMIKYELSQAYQDIGPIIITQNVVCASCKKHISGAEFMRQPNNDIIHVQCDFDKSSRDNSLEIIDSTTTPSTSNIEESNLIPLSAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.32
4 0.28
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.2
9 0.19
10 0.18
11 0.16
12 0.15
13 0.12
14 0.11
15 0.12
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.16
30 0.18
31 0.14
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.19
37 0.22
38 0.23
39 0.27
40 0.29
41 0.28
42 0.31
43 0.31
44 0.32
45 0.36
46 0.4
47 0.37
48 0.4
49 0.4
50 0.37
51 0.35
52 0.3
53 0.24
54 0.18
55 0.18
56 0.15
57 0.17
58 0.17
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.2
64 0.21
65 0.2
66 0.24
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.23
71 0.26
72 0.23
73 0.21
74 0.19
75 0.21
76 0.25
77 0.31
78 0.36
79 0.34
80 0.34
81 0.36
82 0.39
83 0.38
84 0.37
85 0.38
86 0.32
87 0.3
88 0.3
89 0.27
90 0.23
91 0.2
92 0.17
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.14
146 0.15
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.26
151 0.3
152 0.33
153 0.28
154 0.31
155 0.29
156 0.35
157 0.43
158 0.39
159 0.37
160 0.34
161 0.34
162 0.32
163 0.35
164 0.29
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.18
184 0.21
185 0.22
186 0.26
187 0.29
188 0.36
189 0.36
190 0.39
191 0.34
192 0.39
193 0.37
194 0.33
195 0.32
196 0.25
197 0.25
198 0.2
199 0.19
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.12
235 0.23
236 0.23
237 0.27
238 0.3
239 0.3
240 0.3
241 0.33
242 0.32
243 0.25
244 0.25
245 0.22
246 0.2
247 0.22
248 0.23
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.22
260 0.22
261 0.25
262 0.24
263 0.26
264 0.2
265 0.19
266 0.19
267 0.22
268 0.25
269 0.23
270 0.3
271 0.34
272 0.4
273 0.42
274 0.43
275 0.43
276 0.42
277 0.48
278 0.48
279 0.48
280 0.47
281 0.51
282 0.54
283 0.52
284 0.5
285 0.5
286 0.44
287 0.39
288 0.39
289 0.37
290 0.33
291 0.36
292 0.34
293 0.32
294 0.3
295 0.28
296 0.21
297 0.18
298 0.15
299 0.1
300 0.11
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.09
328 0.13
329 0.21
330 0.21
331 0.26
332 0.28
333 0.29
334 0.29
335 0.27
336 0.24
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.23
341 0.28
342 0.33
343 0.37
344 0.45
345 0.52
346 0.54
347 0.58
348 0.57
349 0.57
350 0.56
351 0.6
352 0.61
353 0.58
354 0.54
355 0.47
356 0.4
357 0.35
358 0.34
359 0.26
360 0.17
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.09
408 0.1
409 0.09
410 0.12
411 0.15
412 0.15
413 0.14
414 0.14
415 0.15
416 0.19
417 0.19
418 0.17
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.15
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.12
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.12
438 0.13
439 0.11
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.14
447 0.16
448 0.16
449 0.21
450 0.26
451 0.32
452 0.37
453 0.36
454 0.33
455 0.32
456 0.31
457 0.25
458 0.18
459 0.11
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.18
470 0.2
471 0.25
472 0.34
473 0.37
474 0.41
475 0.42
476 0.44
477 0.4
478 0.44
479 0.47
480 0.4
481 0.4
482 0.34
483 0.33
484 0.33
485 0.32
486 0.32
487 0.25
488 0.24
489 0.26
490 0.26
491 0.27
492 0.27
493 0.25
494 0.2
495 0.21
496 0.2
497 0.15
498 0.14
499 0.16
500 0.14
501 0.14
502 0.13
503 0.11
504 0.13
505 0.13
506 0.16
507 0.13
508 0.15
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.15
513 0.16
514 0.14
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.19
519 0.23
520 0.27
521 0.29
522 0.3
523 0.31
524 0.28
525 0.27
526 0.25
527 0.26
528 0.25
529 0.25
530 0.3
531 0.3
532 0.28
533 0.28
534 0.26
535 0.24
536 0.2
537 0.18
538 0.13
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.06
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.14
561 0.14
562 0.11
563 0.12
564 0.13
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.13
569 0.15
570 0.15
571 0.15
572 0.17
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.15
577 0.14
578 0.13
579 0.13
580 0.14
581 0.14
582 0.14
583 0.16
584 0.19
585 0.25
586 0.34
587 0.4
588 0.44
589 0.51
590 0.6
591 0.68
592 0.77
593 0.76
594 0.78
595 0.82
596 0.84
597 0.86
598 0.79
599 0.73
600 0.73
601 0.76
602 0.73
603 0.66
604 0.62
605 0.53
606 0.55
607 0.53
608 0.48
609 0.45
610 0.44
611 0.48
612 0.43
613 0.42
614 0.37
615 0.34
616 0.31
617 0.27
618 0.22
619 0.16
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.16
625 0.13
626 0.11
627 0.09
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.04
651 0.04
652 0.06
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.14
660 0.14
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.12
665 0.17
666 0.21
667 0.22
668 0.27
669 0.36
670 0.43
671 0.51
672 0.57
673 0.54
674 0.5
675 0.56
676 0.53
677 0.47
678 0.43
679 0.37
680 0.32
681 0.35
682 0.35
683 0.26
684 0.26
685 0.26
686 0.25
687 0.29
688 0.29
689 0.28
690 0.28
691 0.28
692 0.27
693 0.3
694 0.26
695 0.21
696 0.2
697 0.17
698 0.19
699 0.18
700 0.17
701 0.13
702 0.12
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.1
708 0.09
709 0.11
710 0.12
711 0.13
712 0.13
713 0.16
714 0.19
715 0.25
716 0.28
717 0.28
718 0.32
719 0.37
720 0.41
721 0.46
722 0.48
723 0.5
724 0.52
725 0.53
726 0.54
727 0.49
728 0.47
729 0.44
730 0.4
731 0.33
732 0.31
733 0.3
734 0.29
735 0.29
736 0.27
737 0.23
738 0.23
739 0.24
740 0.24
741 0.28
742 0.25
743 0.31
744 0.36
745 0.37
746 0.34
747 0.33
748 0.35
749 0.32
750 0.3
751 0.26
752 0.2
753 0.19
754 0.21
755 0.21
756 0.17
757 0.15
758 0.16
759 0.16
760 0.17
761 0.2
762 0.18
763 0.2
764 0.21
765 0.21
766 0.25
767 0.23