Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JDG5

Protein Details
Accession A0A397JDG5    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-24DLNQLFKRKNQPSLHPNSRPSSHydrophilic
326-348EIETSRKEKKKIRSIRKDEENDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-342KRLAAPKKSAVPERPAAPRSNKRITEIETSRKEKKKIRSIRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041078  Plavaka  
Pfam View protein in Pfam  
PF18759  Plavaka  
Amino Acid Sequences MSDLNQLFKRKNQPSLHPNSRPSSSFSSSSSSSRPTLESEDSDLTSLTSRNNDATTKRIFSKLDNLQKMLEKIMKNQEKMQNDIKSVKEEVAILSYDQDCVYSVILELAQDLLEKIIYPTFDQFKETAKSFMEKSDINFFSSLGHRWEPFYYKKIRVDLTKKLRALRSTLCARVKTSIFEVCKVPPISIVAEALKISAWKKNPAISNSFRKLFDKVEEDEEDTYMTRIIKNVWPKKKNIPNLQIAWVISIAEIILNPNNENIKISEEIIKPVLLKNLNKIENNESFEYKSDSPERLEVASKRLAAPKKSAVPERPAAPRSNKRITEIETSRKEKKKIRSIRKDEENDDDDDEADEGDKAYEANEAYETDEGDEYYNEIINIDETKRYGNFCENRNVTEIFAKTLRKFCEILRNIAEIFAKYCGNIAKYCGNIAKYCENIVKYCGNFCEYCENIAKYYEILRNFFAQTSEDATTTDTLGKNSLHPIYISLGNIPTWRRNKEDAKQLLGYFPILSAKNKTEKESSDFKKLARKTFHDSIKFLLDPLFQGDGGVDFNIDDEDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.8
3 0.83
4 0.8
5 0.8
6 0.76
7 0.73
8 0.65
9 0.61
10 0.58
11 0.52
12 0.46
13 0.42
14 0.42
15 0.4
16 0.41
17 0.39
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.29
23 0.32
24 0.33
25 0.32
26 0.33
27 0.34
28 0.32
29 0.31
30 0.27
31 0.22
32 0.19
33 0.18
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.21
39 0.25
40 0.25
41 0.3
42 0.33
43 0.35
44 0.36
45 0.39
46 0.38
47 0.38
48 0.45
49 0.5
50 0.54
51 0.54
52 0.53
53 0.51
54 0.54
55 0.51
56 0.47
57 0.43
58 0.34
59 0.37
60 0.46
61 0.5
62 0.48
63 0.55
64 0.57
65 0.54
66 0.59
67 0.6
68 0.54
69 0.51
70 0.54
71 0.48
72 0.44
73 0.42
74 0.37
75 0.29
76 0.25
77 0.21
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.13
107 0.17
108 0.18
109 0.2
110 0.21
111 0.24
112 0.28
113 0.28
114 0.26
115 0.23
116 0.26
117 0.24
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.23
122 0.29
123 0.28
124 0.27
125 0.27
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.18
131 0.2
132 0.18
133 0.2
134 0.23
135 0.25
136 0.27
137 0.32
138 0.35
139 0.39
140 0.43
141 0.46
142 0.48
143 0.52
144 0.54
145 0.58
146 0.61
147 0.62
148 0.61
149 0.61
150 0.62
151 0.55
152 0.54
153 0.48
154 0.45
155 0.43
156 0.47
157 0.46
158 0.43
159 0.42
160 0.42
161 0.38
162 0.33
163 0.31
164 0.3
165 0.27
166 0.27
167 0.28
168 0.24
169 0.3
170 0.28
171 0.25
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.12
185 0.14
186 0.19
187 0.21
188 0.26
189 0.31
190 0.33
191 0.38
192 0.4
193 0.48
194 0.48
195 0.49
196 0.45
197 0.42
198 0.41
199 0.36
200 0.34
201 0.29
202 0.25
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.25
207 0.23
208 0.19
209 0.15
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.14
217 0.24
218 0.33
219 0.41
220 0.45
221 0.48
222 0.58
223 0.64
224 0.69
225 0.68
226 0.66
227 0.63
228 0.62
229 0.61
230 0.53
231 0.44
232 0.35
233 0.26
234 0.19
235 0.12
236 0.09
237 0.06
238 0.04
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.15
258 0.15
259 0.18
260 0.15
261 0.15
262 0.19
263 0.26
264 0.29
265 0.3
266 0.31
267 0.32
268 0.33
269 0.36
270 0.32
271 0.26
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.16
283 0.18
284 0.16
285 0.17
286 0.19
287 0.18
288 0.19
289 0.24
290 0.26
291 0.25
292 0.28
293 0.29
294 0.33
295 0.36
296 0.39
297 0.37
298 0.38
299 0.39
300 0.39
301 0.4
302 0.37
303 0.37
304 0.4
305 0.45
306 0.47
307 0.53
308 0.5
309 0.48
310 0.49
311 0.49
312 0.5
313 0.47
314 0.48
315 0.47
316 0.51
317 0.56
318 0.58
319 0.6
320 0.58
321 0.63
322 0.65
323 0.69
324 0.75
325 0.77
326 0.81
327 0.85
328 0.87
329 0.83
330 0.75
331 0.71
332 0.62
333 0.53
334 0.45
335 0.35
336 0.25
337 0.2
338 0.17
339 0.1
340 0.08
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.15
375 0.22
376 0.26
377 0.29
378 0.38
379 0.38
380 0.38
381 0.4
382 0.39
383 0.31
384 0.31
385 0.28
386 0.21
387 0.23
388 0.25
389 0.25
390 0.3
391 0.31
392 0.3
393 0.31
394 0.31
395 0.38
396 0.37
397 0.4
398 0.38
399 0.37
400 0.34
401 0.35
402 0.33
403 0.22
404 0.21
405 0.17
406 0.13
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.17
413 0.19
414 0.2
415 0.23
416 0.24
417 0.24
418 0.24
419 0.27
420 0.29
421 0.26
422 0.28
423 0.29
424 0.28
425 0.27
426 0.29
427 0.3
428 0.26
429 0.28
430 0.26
431 0.26
432 0.24
433 0.25
434 0.3
435 0.25
436 0.28
437 0.31
438 0.3
439 0.28
440 0.29
441 0.27
442 0.19
443 0.24
444 0.26
445 0.23
446 0.24
447 0.25
448 0.27
449 0.27
450 0.27
451 0.22
452 0.19
453 0.18
454 0.2
455 0.2
456 0.17
457 0.16
458 0.17
459 0.17
460 0.16
461 0.19
462 0.15
463 0.14
464 0.17
465 0.17
466 0.18
467 0.22
468 0.23
469 0.19
470 0.18
471 0.19
472 0.2
473 0.22
474 0.21
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.2
479 0.22
480 0.27
481 0.32
482 0.35
483 0.39
484 0.47
485 0.55
486 0.6
487 0.67
488 0.65
489 0.64
490 0.65
491 0.6
492 0.53
493 0.45
494 0.38
495 0.28
496 0.22
497 0.2
498 0.18
499 0.2
500 0.23
501 0.27
502 0.35
503 0.38
504 0.42
505 0.43
506 0.45
507 0.49
508 0.54
509 0.53
510 0.55
511 0.55
512 0.53
513 0.57
514 0.58
515 0.62
516 0.6
517 0.61
518 0.6
519 0.67
520 0.73
521 0.7
522 0.66
523 0.61
524 0.59
525 0.53
526 0.44
527 0.38
528 0.3
529 0.25
530 0.27
531 0.25
532 0.17
533 0.17
534 0.17
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.09
539 0.07
540 0.07