Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HCB5

Protein Details
Accession A0A397HCB5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-72FEMATSKRGRKPKVKSSETNTEIHydrophilic
116-141TSPPAKETKTTTKRGRKPKINSTENDHydrophilic
156-177VEATTTKRRGRKKETATNNTDTHydrophilic
196-215QNTTTNRRGKRKNNEVNEATHydrophilic
304-324QESKGKKSKTKQEEEKRLARFBasic
542-561SSKRDTSTYHYNRYRYRRYRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-61RGRKP
251-257RKKARKT
270-316ASKSKGKGKGKAAENEESSKVPKRKRKAADDEDGQESKGKKSKTKQE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MIKHDSSRSYRSYLFKYLIHFQSSYHLFLKSLISVFISLLPPFTNKTLGFEMATSKRGRKPKVKSSETNTEINEIETSPPPIKSLEETTTTTKRGRKTKVISTENDTENKNDTVVTSPPAKETKTTTKRGRKPKINSTENDTKNNEEVESPKLTEVEATTTKRRGRKKETATNNTDTDNSNETNNDDTIISAETIQNTTTNRRGKRKNNEVNEATSTEITEKPSTGRKSKRKVEDIPSDSDNETKTQTSGRKKARKTTNKIAQSSSTTAASKSKGKGKGKAAENEESSKVPKRKRKAADDEDGQESKGKKSKTKQEEEKRLARFRTTCSSATKDRIGRAVSQRMYMIDRTEINDLHQEFTVLGSIGNVYTVVITKVPSCSCPDFQKGNLCKHVLFIYLKVLRVDRQSNLIYQKALLSDELKSIFDNAAPDPTVLASKKVQEQYAAISSGSQPAEEANDKRRPIDGDCPICYESLDEKENLVWCKNGCGNNLHKDCFSQWKKSKSAYDKVTCVYCRIEWEEEKSGEPTNEEGYINLAEAQGMSSKRDTSTYHYNRYRYRRYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.47
3 0.48
4 0.52
5 0.5
6 0.48
7 0.42
8 0.36
9 0.41
10 0.41
11 0.4
12 0.33
13 0.29
14 0.25
15 0.27
16 0.29
17 0.23
18 0.21
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.19
24 0.18
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.17
30 0.19
31 0.2
32 0.19
33 0.24
34 0.26
35 0.27
36 0.26
37 0.24
38 0.3
39 0.27
40 0.32
41 0.3
42 0.33
43 0.38
44 0.46
45 0.54
46 0.57
47 0.64
48 0.7
49 0.77
50 0.81
51 0.82
52 0.82
53 0.84
54 0.78
55 0.73
56 0.64
57 0.56
58 0.47
59 0.39
60 0.32
61 0.22
62 0.21
63 0.17
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.24
72 0.24
73 0.26
74 0.29
75 0.35
76 0.38
77 0.4
78 0.41
79 0.41
80 0.45
81 0.5
82 0.54
83 0.58
84 0.61
85 0.68
86 0.73
87 0.75
88 0.71
89 0.69
90 0.69
91 0.63
92 0.59
93 0.5
94 0.42
95 0.38
96 0.35
97 0.28
98 0.2
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.19
104 0.19
105 0.23
106 0.26
107 0.26
108 0.25
109 0.3
110 0.39
111 0.42
112 0.51
113 0.57
114 0.65
115 0.73
116 0.82
117 0.86
118 0.85
119 0.86
120 0.87
121 0.87
122 0.85
123 0.79
124 0.77
125 0.76
126 0.7
127 0.68
128 0.59
129 0.51
130 0.45
131 0.43
132 0.35
133 0.26
134 0.24
135 0.21
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.21
146 0.24
147 0.3
148 0.36
149 0.42
150 0.49
151 0.54
152 0.58
153 0.65
154 0.71
155 0.75
156 0.81
157 0.84
158 0.82
159 0.77
160 0.69
161 0.6
162 0.51
163 0.42
164 0.35
165 0.28
166 0.22
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.16
172 0.14
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.14
186 0.21
187 0.27
188 0.33
189 0.42
190 0.51
191 0.59
192 0.69
193 0.76
194 0.79
195 0.79
196 0.81
197 0.75
198 0.69
199 0.62
200 0.52
201 0.42
202 0.32
203 0.25
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.2
211 0.25
212 0.31
213 0.4
214 0.46
215 0.55
216 0.64
217 0.71
218 0.72
219 0.75
220 0.75
221 0.75
222 0.7
223 0.64
224 0.57
225 0.5
226 0.42
227 0.36
228 0.28
229 0.19
230 0.17
231 0.13
232 0.12
233 0.15
234 0.21
235 0.28
236 0.36
237 0.45
238 0.52
239 0.55
240 0.64
241 0.7
242 0.74
243 0.75
244 0.77
245 0.76
246 0.76
247 0.74
248 0.67
249 0.58
250 0.51
251 0.45
252 0.35
253 0.27
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.25
261 0.32
262 0.35
263 0.41
264 0.46
265 0.52
266 0.53
267 0.56
268 0.53
269 0.49
270 0.47
271 0.42
272 0.37
273 0.3
274 0.27
275 0.28
276 0.29
277 0.32
278 0.38
279 0.42
280 0.51
281 0.58
282 0.65
283 0.69
284 0.71
285 0.71
286 0.68
287 0.64
288 0.59
289 0.51
290 0.42
291 0.35
292 0.28
293 0.24
294 0.24
295 0.22
296 0.24
297 0.31
298 0.41
299 0.48
300 0.57
301 0.64
302 0.71
303 0.8
304 0.8
305 0.81
306 0.77
307 0.72
308 0.64
309 0.58
310 0.49
311 0.43
312 0.43
313 0.4
314 0.36
315 0.35
316 0.38
317 0.38
318 0.39
319 0.41
320 0.37
321 0.34
322 0.35
323 0.32
324 0.33
325 0.35
326 0.39
327 0.34
328 0.32
329 0.31
330 0.29
331 0.29
332 0.25
333 0.2
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.19
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.1
363 0.1
364 0.12
365 0.16
366 0.2
367 0.22
368 0.27
369 0.32
370 0.32
371 0.34
372 0.43
373 0.44
374 0.47
375 0.48
376 0.46
377 0.4
378 0.39
379 0.37
380 0.31
381 0.27
382 0.21
383 0.24
384 0.24
385 0.26
386 0.25
387 0.25
388 0.23
389 0.28
390 0.3
391 0.23
392 0.26
393 0.26
394 0.29
395 0.32
396 0.31
397 0.26
398 0.23
399 0.24
400 0.19
401 0.19
402 0.15
403 0.13
404 0.12
405 0.14
406 0.15
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.15
420 0.13
421 0.16
422 0.15
423 0.18
424 0.25
425 0.28
426 0.28
427 0.26
428 0.27
429 0.28
430 0.3
431 0.27
432 0.2
433 0.18
434 0.17
435 0.21
436 0.2
437 0.15
438 0.12
439 0.11
440 0.16
441 0.19
442 0.22
443 0.25
444 0.32
445 0.33
446 0.34
447 0.37
448 0.36
449 0.36
450 0.42
451 0.44
452 0.43
453 0.44
454 0.47
455 0.45
456 0.42
457 0.37
458 0.3
459 0.25
460 0.23
461 0.24
462 0.2
463 0.2
464 0.23
465 0.28
466 0.27
467 0.25
468 0.23
469 0.2
470 0.26
471 0.31
472 0.32
473 0.31
474 0.34
475 0.4
476 0.48
477 0.53
478 0.5
479 0.44
480 0.43
481 0.43
482 0.48
483 0.46
484 0.47
485 0.5
486 0.55
487 0.6
488 0.65
489 0.72
490 0.7
491 0.74
492 0.73
493 0.72
494 0.68
495 0.66
496 0.66
497 0.57
498 0.51
499 0.45
500 0.36
501 0.35
502 0.36
503 0.39
504 0.35
505 0.41
506 0.45
507 0.43
508 0.44
509 0.4
510 0.38
511 0.33
512 0.31
513 0.26
514 0.21
515 0.22
516 0.2
517 0.18
518 0.17
519 0.17
520 0.16
521 0.15
522 0.12
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.12
527 0.13
528 0.15
529 0.16
530 0.18
531 0.2
532 0.23
533 0.25
534 0.27
535 0.38
536 0.44
537 0.52
538 0.58
539 0.64
540 0.7
541 0.78