Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JMX1

Protein Details
Accession A0A397JMX1    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-52EKASSAPAPKQKQKSQRDLSVSPHydrophilic
65-102DDLYTPQPTKRIKRKLEKRPRKAPIRKKKYRDDDGDIDBasic
366-386PYKHLKQTMARMRRGEKKRKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-93KRIKRKLEKRPRKAPIRKKK
133-141KKKGKSKAK
369-386HLKQTMARMRRGEKKRKI
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDYEEIFGDGAEELSDVVDDFSDFDYDHEKASSAPAPKQKQKSQRDLSVSPPRRTISEGDRDEDDLYTPQPTKRIKRKLEKRPRKAPIRKKKYRDDDGDIDEDEVIAPTAEMAPLMESRQRIERDFDEIMPKKKGKSKAKGIDLDKYYDQAAEKLYQQMVEYADYDYNTCQDQKPTTKKLDNLQYVVDELSKPFMLEALMESNILDAIRYWLEPLPDRSLPNITIVEQLMGVLNKFPIITDHLLSSKVGRIVYFYDQSPRISDNIKQLASNIVAKWSRAIFGISVDYKDKNFKRVEFDPELMAEVQSKTNYSEPNNIDERTPPKRVLMTSSAVHAQIPQPAAFDYDIMPEVRLSSPHRGKRADDPYKHLKQTMARMRRGEKKRKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.17
20 0.22
21 0.22
22 0.28
23 0.37
24 0.45
25 0.54
26 0.63
27 0.68
28 0.72
29 0.78
30 0.82
31 0.82
32 0.82
33 0.81
34 0.74
35 0.75
36 0.75
37 0.74
38 0.66
39 0.63
40 0.55
41 0.49
42 0.49
43 0.45
44 0.42
45 0.44
46 0.44
47 0.41
48 0.42
49 0.42
50 0.39
51 0.34
52 0.27
53 0.18
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.17
58 0.23
59 0.31
60 0.39
61 0.48
62 0.58
63 0.65
64 0.74
65 0.83
66 0.87
67 0.91
68 0.93
69 0.93
70 0.93
71 0.93
72 0.93
73 0.93
74 0.93
75 0.93
76 0.92
77 0.92
78 0.9
79 0.91
80 0.9
81 0.89
82 0.86
83 0.82
84 0.77
85 0.72
86 0.66
87 0.55
88 0.45
89 0.35
90 0.27
91 0.19
92 0.13
93 0.08
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.18
108 0.2
109 0.21
110 0.24
111 0.25
112 0.28
113 0.29
114 0.29
115 0.32
116 0.35
117 0.37
118 0.39
119 0.39
120 0.37
121 0.42
122 0.51
123 0.51
124 0.56
125 0.63
126 0.66
127 0.73
128 0.77
129 0.73
130 0.71
131 0.62
132 0.56
133 0.46
134 0.38
135 0.3
136 0.23
137 0.2
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.11
160 0.16
161 0.24
162 0.31
163 0.35
164 0.41
165 0.43
166 0.46
167 0.5
168 0.55
169 0.49
170 0.43
171 0.39
172 0.32
173 0.29
174 0.26
175 0.2
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.03
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.11
202 0.14
203 0.17
204 0.19
205 0.19
206 0.2
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.18
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.18
241 0.19
242 0.17
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.19
250 0.22
251 0.25
252 0.3
253 0.3
254 0.28
255 0.27
256 0.28
257 0.28
258 0.28
259 0.19
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.16
268 0.1
269 0.11
270 0.16
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.27
277 0.28
278 0.3
279 0.34
280 0.35
281 0.4
282 0.44
283 0.51
284 0.47
285 0.47
286 0.41
287 0.37
288 0.36
289 0.29
290 0.25
291 0.18
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.17
298 0.21
299 0.23
300 0.3
301 0.3
302 0.36
303 0.4
304 0.38
305 0.35
306 0.37
307 0.41
308 0.38
309 0.41
310 0.36
311 0.35
312 0.39
313 0.4
314 0.41
315 0.38
316 0.36
317 0.33
318 0.35
319 0.33
320 0.29
321 0.28
322 0.23
323 0.2
324 0.2
325 0.21
326 0.18
327 0.17
328 0.17
329 0.19
330 0.17
331 0.16
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.17
341 0.19
342 0.28
343 0.37
344 0.44
345 0.51
346 0.53
347 0.56
348 0.63
349 0.69
350 0.69
351 0.65
352 0.66
353 0.69
354 0.75
355 0.74
356 0.66
357 0.6
358 0.57
359 0.62
360 0.64
361 0.64
362 0.62
363 0.66
364 0.72
365 0.76
366 0.8