FuNGI

A0A397IUE2

Protein Details

Accession

A0A397IUE2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-28	KPFIDRKTAKHYKLVHRSQRDPLIN	Hydrophilic
65-86	ITSDKENHLKNKKKEEENIESR	Hydrophilic
167-188	KQAKESKKINLIKNKKDRKVKI	Basic
391-413	NNNKLTKQSPQSLKKNKRDKFIE	Hydrophilic
440-462	NHPKLICEKKKPIKKIEINSKTG	Hydrophilic
519-566	GAARSKNETKEEKKKRKEDIKKERKNRRMEKKSLKQAFTKERTKQTRI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-185	AKESKKINLIKNKKDRK
522-554	RSKNETKEEKKKRKEDIKKERKNRRMEKKSLKQ

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKPFIDRKTAKHYKLVHRSQRDPLINDEEASSRVFVEVIPTNLRDKINYSLEGGEEEEEDTIITSDKENHLKNKKKEEENIESRIGQAALYGIYYDDTEYNYLQHLKPIGRNNGGIFIEAPTKNNNNNGKDFLKDIIKERDDDDNNDDDNNDDDDDDDKSVSKTKQAKESKKINLIKNKKDRKVKIVLPEEVLPSKDEIPFDQLDFSSIPEGFQPDMDPRLREALEALEDDEYIENDIDDYFEKLNVDELSNDDDDDDDDNYDDDDDDDGDDDENWEIGFRKYLKNKSKENNGKDDGDENDKRSRTTGYSLTSSIMFRNEKLRLLDDQFEKIEKEYMLDDDDDDDDDDDDDNPPQIRQDFTQILDEFIDKYDDNNNNNNDDDDDSNNNNNNKLTKQSPQSLKKNKRDKFIEIESEQSIKSRQPWDCESILSTYSNLENHPKLICEKKKPIKKIEINSKTGLPININNDEDKNNDDDITINVDDDITIDDDGDDITIDDDDDDDDNDDENEQIKPNLGAARSKNETKEEKKKRKEDIKKERKNRRMEKKSLKQAFTKERTKQTRISENFQKNFVGAIHLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.75
3	0.79
4	0.81
5	0.8
6	0.8
7	0.82
8	0.82
9	0.82
10	0.78
11	0.7
12	0.66
13	0.63
14	0.55
15	0.5
16	0.43
17	0.34
18	0.29
19	0.27
20	0.21
21	0.13
22	0.12
23	0.12
24	0.1
25	0.13
26	0.16
27	0.18
28	0.21
29	0.22
30	0.24
31	0.29
32	0.3
33	0.26
34	0.26
35	0.3
36	0.32
37	0.32
38	0.31
39	0.28
40	0.28
41	0.28
42	0.25
43	0.19
44	0.14
45	0.13
46	0.11
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.08
54	0.12
55	0.17
56	0.24
57	0.28
58	0.38
59	0.48
60	0.57
61	0.65
62	0.72
63	0.76
64	0.77
65	0.81
66	0.81
67	0.81
68	0.78
69	0.75
70	0.67
71	0.58
72	0.5
73	0.44
74	0.34
75	0.23
76	0.16
77	0.12
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.08
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.13
91	0.17
92	0.16
93	0.19
94	0.22
95	0.23
96	0.29
97	0.37
98	0.42
99	0.41
100	0.43
101	0.41
102	0.43
103	0.4
104	0.34
105	0.26
106	0.21
107	0.24
108	0.22
109	0.23
110	0.21
111	0.25
112	0.27
113	0.34
114	0.41
115	0.39
116	0.42
117	0.46
118	0.43
119	0.4
120	0.39
121	0.34
122	0.32
123	0.29
124	0.31
125	0.34
126	0.34
127	0.34
128	0.34
129	0.4
130	0.37
131	0.39
132	0.38
133	0.32
134	0.31
135	0.3
136	0.28
137	0.2
138	0.19
139	0.17
140	0.13
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.15
150	0.15
151	0.21
152	0.28
153	0.32
154	0.42
155	0.51
156	0.59
157	0.63
158	0.72
159	0.73
160	0.75
161	0.78
162	0.76
163	0.77
164	0.77
165	0.78
166	0.8
167	0.82
168	0.8
169	0.83
170	0.8
171	0.77
172	0.76
173	0.72
174	0.71
175	0.68
176	0.62
177	0.55
178	0.52
179	0.46
180	0.38
181	0.33
182	0.24
183	0.18
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.13
188	0.16
189	0.16
190	0.16
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.14
209	0.18
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.11
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.09
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.08
269	0.09
270	0.15
271	0.21
272	0.31
273	0.39
274	0.45
275	0.53
276	0.56
277	0.65
278	0.69
279	0.67
280	0.66
281	0.61
282	0.55
283	0.49
284	0.45
285	0.36
286	0.34
287	0.3
288	0.25
289	0.27
290	0.26
291	0.26
292	0.24
293	0.24
294	0.19
295	0.21
296	0.22
297	0.2
298	0.21
299	0.22
300	0.21
301	0.2
302	0.19
303	0.16
304	0.16
305	0.14
306	0.13
307	0.18
308	0.18
309	0.2
310	0.2
311	0.22
312	0.21
313	0.23
314	0.28
315	0.24
316	0.25
317	0.23
318	0.23
319	0.21
320	0.18
321	0.18
322	0.12
323	0.12
324	0.1
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.1
346	0.1
347	0.16
348	0.17
349	0.18
350	0.24
351	0.22
352	0.22
353	0.21
354	0.21
355	0.15
356	0.14
357	0.14
358	0.08
359	0.09
360	0.16
361	0.2
362	0.23
363	0.29
364	0.3
365	0.3
366	0.31
367	0.3
368	0.24
369	0.21
370	0.2
371	0.17
372	0.18
373	0.19
374	0.21
375	0.26
376	0.25
377	0.25
378	0.25
379	0.24
380	0.22
381	0.24
382	0.24
383	0.26
384	0.31
385	0.38
386	0.46
387	0.53
388	0.63
389	0.69
390	0.77
391	0.8
392	0.85
393	0.81
394	0.81
395	0.77
396	0.73
397	0.7
398	0.66
399	0.64
400	0.55
401	0.53
402	0.45
403	0.41
404	0.35
405	0.28
406	0.23
407	0.16
408	0.21
409	0.25
410	0.26
411	0.3
412	0.35
413	0.39
414	0.38
415	0.37
416	0.34
417	0.28
418	0.27
419	0.22
420	0.18
421	0.14
422	0.15
423	0.15
424	0.14
425	0.18
426	0.17
427	0.19
428	0.19
429	0.2
430	0.23
431	0.32
432	0.38
433	0.42
434	0.51
435	0.59
436	0.68
437	0.75
438	0.79
439	0.8
440	0.81
441	0.82
442	0.83
443	0.82
444	0.77
445	0.72
446	0.64
447	0.55
448	0.49
449	0.4
450	0.32
451	0.28
452	0.29
453	0.31
454	0.31
455	0.3
456	0.29
457	0.29
458	0.28
459	0.26
460	0.23
461	0.19
462	0.18
463	0.16
464	0.15
465	0.15
466	0.19
467	0.16
468	0.13
469	0.12
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.18
505	0.19
506	0.24
507	0.26
508	0.34
509	0.38
510	0.42
511	0.43
512	0.47
513	0.54
514	0.57
515	0.65
516	0.68
517	0.74
518	0.8
519	0.85
520	0.88
521	0.9
522	0.92
523	0.92
524	0.92
525	0.93
526	0.93
527	0.95
528	0.95
529	0.93
530	0.93
531	0.92
532	0.92
533	0.91
534	0.91
535	0.92
536	0.92
537	0.94
538	0.92
539	0.87
540	0.83
541	0.82
542	0.82
543	0.8
544	0.79
545	0.76
546	0.77
547	0.81
548	0.8
549	0.77
550	0.76
551	0.77
552	0.74
553	0.74
554	0.74
555	0.75
556	0.73
557	0.68
558	0.6
559	0.49
560	0.45
561	0.37

A0A397IUE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer