Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397ISX0

Protein Details
Accession A0A397ISX0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-174RGANKVRKRMWWKDMKMKIVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9, nucl 5.5, pero 3, mito 2, plas 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001388  Synaptobrevin-like  
IPR016444  Synaptobrevin/VAMP  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00417  SYNAPTOBREVIN  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd15843  R-SNARE  
cd15874  R-SNARE_Snc1  
Amino Acid Sequences MIYIIECHCWTTTTNPPQNDKYDPFVPKSEAAGGGQKTVQIQKQIDDTVGIMRENINRVAERGERLDALQDKTVIKFVKMTTTTNPPQNDKYDPFVPKSEAAGGGQKTVQIQKQIDDTVGIMRENINRVAERGERLDALQDKTENLTVSAQGFRRGANKVRKRMWWKDMKMKIVLIVVVILLLLAVILPLALKKKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.54
4 0.57
5 0.6
6 0.61
7 0.55
8 0.51
9 0.51
10 0.49
11 0.47
12 0.45
13 0.44
14 0.38
15 0.37
16 0.33
17 0.27
18 0.24
19 0.27
20 0.24
21 0.22
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.23
29 0.24
30 0.27
31 0.27
32 0.25
33 0.21
34 0.19
35 0.15
36 0.16
37 0.14
38 0.1
39 0.12
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.16
52 0.16
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.22
61 0.18
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.21
69 0.28
70 0.31
71 0.35
72 0.36
73 0.32
74 0.36
75 0.39
76 0.43
77 0.39
78 0.42
79 0.44
80 0.46
81 0.47
82 0.45
83 0.44
84 0.38
85 0.37
86 0.33
87 0.27
88 0.24
89 0.27
90 0.24
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.23
99 0.24
100 0.27
101 0.27
102 0.25
103 0.21
104 0.19
105 0.15
106 0.16
107 0.14
108 0.1
109 0.12
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.15
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.16
122 0.16
123 0.2
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.21
131 0.16
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.13
136 0.17
137 0.16
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.25
143 0.32
144 0.39
145 0.47
146 0.53
147 0.59
148 0.67
149 0.72
150 0.77
151 0.79
152 0.78
153 0.77
154 0.79
155 0.8
156 0.76
157 0.7
158 0.62
159 0.54
160 0.45
161 0.37
162 0.26
163 0.19
164 0.13
165 0.09
166 0.08
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.05