Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H1L0

Protein Details
Accession A0A397H1L0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MNYLDRHPKRRRSITSDSRRAPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039727  SE/Ars2  
IPR021933  SERRATE/Ars2_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF00076  RRM_1  
PF12066  SERRATE_Ars2_N  
Amino Acid Sequences MNYLDRHPKRRRSITSDSRRAPPPDGGDHYIPNYEKEGYTPGPRYNGRPGGPTDMRFTPHGFPVGLPIGFSVPAPPIMAPGGLMPMDWTTPQGRQEPLKDPEQLDFLVTFKYFAEFLQSSQPKVRFTDDDLHKRYNDYKEVFAIKQLKSFFEVHKKEEWFLEKYHPKFMEPRVIATKELKKKNYQQFVADMKKGLFDNIVNDVVEESIVKDEIKIEVIKTEETTTAEKNDVDEDANRLFIKSVSPSIARQKIEDMCKEIPGFKYLALSEPNPQKKFHRLGWIVFEEGTDMDDAYEKLNEQKIDEFVFYLARHKNQTGPVRNRTTPDIANSSDRLKKDLASAIKLVEKLDKDVDESFNGVQAIKQRLAIILDKVIKVEDKDKDKDKDNKDNNDDKDKDNKDNKDNKDKEDDDDISYVKKSLDFHLEYLRRAHLFCYYCGSESDSVEELNRKCPGRHLRSVAGSNDTKSTGKSQKEKQINVYDECSKKIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.89
4 0.84
5 0.8
6 0.78
7 0.73
8 0.66
9 0.62
10 0.56
11 0.54
12 0.55
13 0.53
14 0.49
15 0.48
16 0.46
17 0.45
18 0.4
19 0.34
20 0.3
21 0.26
22 0.23
23 0.22
24 0.26
25 0.24
26 0.31
27 0.33
28 0.34
29 0.39
30 0.42
31 0.45
32 0.49
33 0.53
34 0.48
35 0.48
36 0.48
37 0.5
38 0.52
39 0.49
40 0.45
41 0.4
42 0.41
43 0.38
44 0.38
45 0.32
46 0.31
47 0.31
48 0.26
49 0.23
50 0.26
51 0.28
52 0.24
53 0.2
54 0.18
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.12
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.1
76 0.11
77 0.14
78 0.18
79 0.21
80 0.24
81 0.28
82 0.34
83 0.4
84 0.42
85 0.44
86 0.44
87 0.42
88 0.4
89 0.37
90 0.32
91 0.25
92 0.21
93 0.17
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.25
105 0.26
106 0.27
107 0.33
108 0.36
109 0.31
110 0.33
111 0.36
112 0.28
113 0.31
114 0.39
115 0.42
116 0.49
117 0.51
118 0.53
119 0.49
120 0.49
121 0.51
122 0.47
123 0.46
124 0.38
125 0.36
126 0.37
127 0.41
128 0.38
129 0.38
130 0.39
131 0.32
132 0.34
133 0.33
134 0.3
135 0.29
136 0.31
137 0.3
138 0.34
139 0.36
140 0.36
141 0.41
142 0.42
143 0.39
144 0.41
145 0.4
146 0.32
147 0.31
148 0.37
149 0.38
150 0.38
151 0.44
152 0.41
153 0.38
154 0.41
155 0.43
156 0.43
157 0.36
158 0.39
159 0.38
160 0.38
161 0.38
162 0.39
163 0.44
164 0.43
165 0.5
166 0.49
167 0.49
168 0.58
169 0.65
170 0.68
171 0.61
172 0.55
173 0.54
174 0.59
175 0.57
176 0.48
177 0.4
178 0.31
179 0.31
180 0.28
181 0.22
182 0.15
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.2
234 0.25
235 0.25
236 0.24
237 0.27
238 0.29
239 0.32
240 0.31
241 0.29
242 0.24
243 0.26
244 0.26
245 0.24
246 0.2
247 0.18
248 0.17
249 0.12
250 0.13
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.17
256 0.25
257 0.32
258 0.32
259 0.34
260 0.35
261 0.41
262 0.45
263 0.43
264 0.45
265 0.4
266 0.41
267 0.45
268 0.43
269 0.36
270 0.31
271 0.27
272 0.17
273 0.14
274 0.13
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.13
294 0.12
295 0.16
296 0.17
297 0.18
298 0.2
299 0.21
300 0.25
301 0.3
302 0.4
303 0.44
304 0.5
305 0.56
306 0.6
307 0.61
308 0.59
309 0.56
310 0.51
311 0.43
312 0.38
313 0.34
314 0.29
315 0.3
316 0.3
317 0.3
318 0.3
319 0.29
320 0.28
321 0.24
322 0.23
323 0.24
324 0.28
325 0.27
326 0.25
327 0.26
328 0.25
329 0.27
330 0.26
331 0.24
332 0.22
333 0.19
334 0.18
335 0.2
336 0.19
337 0.18
338 0.2
339 0.21
340 0.18
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.13
346 0.12
347 0.16
348 0.2
349 0.19
350 0.2
351 0.18
352 0.19
353 0.22
354 0.22
355 0.18
356 0.19
357 0.22
358 0.21
359 0.2
360 0.2
361 0.19
362 0.19
363 0.24
364 0.25
365 0.29
366 0.35
367 0.42
368 0.46
369 0.54
370 0.62
371 0.64
372 0.68
373 0.7
374 0.74
375 0.75
376 0.79
377 0.75
378 0.76
379 0.7
380 0.63
381 0.64
382 0.59
383 0.61
384 0.61
385 0.63
386 0.63
387 0.7
388 0.74
389 0.75
390 0.75
391 0.7
392 0.71
393 0.65
394 0.59
395 0.57
396 0.52
397 0.43
398 0.41
399 0.36
400 0.29
401 0.28
402 0.25
403 0.17
404 0.17
405 0.16
406 0.18
407 0.26
408 0.26
409 0.28
410 0.38
411 0.4
412 0.39
413 0.41
414 0.41
415 0.34
416 0.32
417 0.31
418 0.29
419 0.28
420 0.28
421 0.32
422 0.29
423 0.29
424 0.29
425 0.32
426 0.27
427 0.25
428 0.28
429 0.21
430 0.2
431 0.22
432 0.27
433 0.24
434 0.27
435 0.33
436 0.31
437 0.31
438 0.4
439 0.49
440 0.51
441 0.59
442 0.6
443 0.62
444 0.67
445 0.72
446 0.65
447 0.62
448 0.56
449 0.48
450 0.43
451 0.39
452 0.32
453 0.29
454 0.34
455 0.35
456 0.41
457 0.48
458 0.55
459 0.62
460 0.71
461 0.75
462 0.75
463 0.77
464 0.74
465 0.7
466 0.67
467 0.65
468 0.58