Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HGM9

Protein Details
Accession A0A397HGM9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-35IVIFEKLERKRSRQFYRKQRPRLNLNQALEKIHydrophilic
99-119IEEARRSRRSGRNSNNNQPLEHydrophilic
341-387SEDEIKPKPKIKRRIKKKKYENESSDEETPVKKEKVKKKEVKVDPIEBasic
529-554IYNYRTDPNNKKKKVQISFSKPKPMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-359KPKPKIKRRIKKKK
372-379KKEKVKKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MLSIVIFEKLERKRSRQFYRKQRPRLNLNQALEKINWNIRTKENSLTRSPVSFSVQTSVKTTRENSPEQSNDEELGSELNEKEFEKRVREFERYKTRTIEEARRSRRSGRNSNNNQPLEIVEEENIEEPELVGLREYLQEFEIEQEENNEEPIIENNNVMDILALRLRKFRGNGTQNPVEWLKNYEKTARMNGWTDDQRKKRIYTVLNDAVDEWYNEIYTATYRNQDDNRLPNWTEVKELFIMQFCNRKWMNKWIRELEKLKQQPGESVDQYITRFKKIIRKGAPVMQDENKFYHFKKGLRKGMLPIISMHNPENIATVIELAQYYKEAEDLEEGLEPEESEDEIKPKPKIKRRIKKKKYENESSDEETPVKKEKVKKKEVKVDPIEELIKKMNELTIKLAKTEKPQYNNNIRSRNYDIECYNCGKKGHISKDCKGFNRNNNYRNNYRDQNNSFRNNNYQNNYRNNNNKNNIPERNTSGNNSGNSQRGNENEYKTDEEDREIIALWNEQLDSFENSKETKKRPIEPELIYNYRTDPNNKKKKVQISFSKPKPMEWTPTKNNVRKPIIKTSGKVKNEEYTPKLLQGPELDIVKKLREQKIEYTCRQNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.75
3 0.77
4 0.82
5 0.84
6 0.89
7 0.92
8 0.93
9 0.92
10 0.91
11 0.91
12 0.91
13 0.91
14 0.88
15 0.83
16 0.81
17 0.74
18 0.68
19 0.59
20 0.51
21 0.46
22 0.43
23 0.45
24 0.4
25 0.41
26 0.43
27 0.49
28 0.49
29 0.53
30 0.54
31 0.53
32 0.53
33 0.55
34 0.52
35 0.47
36 0.46
37 0.4
38 0.38
39 0.35
40 0.32
41 0.31
42 0.31
43 0.3
44 0.33
45 0.34
46 0.31
47 0.33
48 0.34
49 0.37
50 0.41
51 0.45
52 0.45
53 0.49
54 0.51
55 0.5
56 0.51
57 0.44
58 0.39
59 0.34
60 0.29
61 0.2
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.22
71 0.26
72 0.3
73 0.33
74 0.4
75 0.45
76 0.53
77 0.54
78 0.57
79 0.65
80 0.63
81 0.63
82 0.6
83 0.56
84 0.56
85 0.58
86 0.58
87 0.57
88 0.63
89 0.67
90 0.7
91 0.71
92 0.72
93 0.73
94 0.73
95 0.74
96 0.74
97 0.77
98 0.79
99 0.86
100 0.86
101 0.79
102 0.69
103 0.59
104 0.49
105 0.42
106 0.34
107 0.25
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.1
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.05
149 0.06
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.14
154 0.16
155 0.2
156 0.21
157 0.26
158 0.33
159 0.4
160 0.47
161 0.51
162 0.55
163 0.51
164 0.53
165 0.49
166 0.4
167 0.32
168 0.3
169 0.27
170 0.27
171 0.29
172 0.29
173 0.32
174 0.34
175 0.39
176 0.37
177 0.35
178 0.33
179 0.32
180 0.34
181 0.37
182 0.4
183 0.44
184 0.46
185 0.51
186 0.52
187 0.52
188 0.51
189 0.52
190 0.5
191 0.47
192 0.51
193 0.51
194 0.48
195 0.46
196 0.41
197 0.35
198 0.3
199 0.24
200 0.16
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.09
208 0.09
209 0.13
210 0.15
211 0.19
212 0.2
213 0.25
214 0.29
215 0.32
216 0.32
217 0.33
218 0.32
219 0.31
220 0.33
221 0.29
222 0.27
223 0.22
224 0.22
225 0.18
226 0.18
227 0.15
228 0.13
229 0.15
230 0.14
231 0.2
232 0.17
233 0.24
234 0.24
235 0.26
236 0.29
237 0.38
238 0.45
239 0.46
240 0.52
241 0.53
242 0.57
243 0.61
244 0.61
245 0.55
246 0.55
247 0.51
248 0.48
249 0.43
250 0.39
251 0.35
252 0.35
253 0.35
254 0.26
255 0.24
256 0.22
257 0.2
258 0.21
259 0.23
260 0.21
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.27
265 0.31
266 0.4
267 0.39
268 0.44
269 0.46
270 0.5
271 0.53
272 0.47
273 0.45
274 0.4
275 0.37
276 0.32
277 0.3
278 0.28
279 0.24
280 0.23
281 0.27
282 0.26
283 0.28
284 0.37
285 0.45
286 0.49
287 0.51
288 0.52
289 0.47
290 0.49
291 0.46
292 0.37
293 0.29
294 0.25
295 0.23
296 0.23
297 0.2
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.07
331 0.09
332 0.13
333 0.15
334 0.22
335 0.3
336 0.38
337 0.49
338 0.58
339 0.68
340 0.76
341 0.85
342 0.89
343 0.91
344 0.93
345 0.93
346 0.91
347 0.9
348 0.84
349 0.78
350 0.73
351 0.66
352 0.57
353 0.48
354 0.4
355 0.3
356 0.26
357 0.25
358 0.22
359 0.23
360 0.3
361 0.38
362 0.47
363 0.58
364 0.65
365 0.69
366 0.78
367 0.8
368 0.82
369 0.78
370 0.71
371 0.62
372 0.56
373 0.49
374 0.39
375 0.33
376 0.26
377 0.2
378 0.17
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.14
383 0.18
384 0.21
385 0.21
386 0.23
387 0.26
388 0.26
389 0.31
390 0.39
391 0.4
392 0.39
393 0.45
394 0.52
395 0.6
396 0.66
397 0.68
398 0.66
399 0.62
400 0.62
401 0.62
402 0.6
403 0.51
404 0.47
405 0.4
406 0.36
407 0.38
408 0.36
409 0.32
410 0.29
411 0.28
412 0.25
413 0.3
414 0.35
415 0.42
416 0.47
417 0.53
418 0.55
419 0.64
420 0.68
421 0.66
422 0.65
423 0.64
424 0.63
425 0.67
426 0.7
427 0.68
428 0.72
429 0.74
430 0.73
431 0.71
432 0.68
433 0.64
434 0.6
435 0.61
436 0.58
437 0.61
438 0.63
439 0.64
440 0.6
441 0.57
442 0.6
443 0.59
444 0.6
445 0.56
446 0.56
447 0.57
448 0.62
449 0.63
450 0.63
451 0.64
452 0.65
453 0.69
454 0.67
455 0.65
456 0.65
457 0.69
458 0.68
459 0.64
460 0.6
461 0.56
462 0.57
463 0.54
464 0.5
465 0.46
466 0.45
467 0.4
468 0.39
469 0.37
470 0.34
471 0.32
472 0.31
473 0.29
474 0.26
475 0.31
476 0.33
477 0.33
478 0.33
479 0.35
480 0.36
481 0.35
482 0.38
483 0.33
484 0.3
485 0.28
486 0.25
487 0.22
488 0.19
489 0.17
490 0.13
491 0.13
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.15
499 0.16
500 0.16
501 0.18
502 0.19
503 0.27
504 0.33
505 0.35
506 0.41
507 0.47
508 0.55
509 0.61
510 0.67
511 0.68
512 0.65
513 0.69
514 0.67
515 0.63
516 0.55
517 0.48
518 0.43
519 0.4
520 0.39
521 0.39
522 0.41
523 0.49
524 0.59
525 0.64
526 0.69
527 0.72
528 0.79
529 0.8
530 0.8
531 0.79
532 0.79
533 0.84
534 0.84
535 0.86
536 0.76
537 0.7
538 0.68
539 0.62
540 0.61
541 0.59
542 0.62
543 0.59
544 0.7
545 0.77
546 0.76
547 0.78
548 0.79
549 0.79
550 0.77
551 0.76
552 0.76
553 0.76
554 0.75
555 0.7
556 0.7
557 0.71
558 0.67
559 0.65
560 0.58
561 0.55
562 0.56
563 0.61
564 0.56
565 0.53
566 0.51
567 0.5
568 0.5
569 0.44
570 0.4
571 0.34
572 0.34
573 0.31
574 0.32
575 0.29
576 0.29
577 0.31
578 0.31
579 0.33
580 0.38
581 0.41
582 0.45
583 0.5
584 0.56
585 0.64
586 0.7
587 0.72