Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JE72

Protein Details
Accession A0A397JE72    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-83VNEIEPRKQKGKKKVVESSEEEERKSKKIVLKKKKKETKVTFDPAHNHydrophilic
205-228KTEITPKKKSKKKEVIKMVKGNKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-73RKQKGKKKVVESSEEEERKSKKIVLKKKKKE
210-242PKKKSKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_mito 6, mito 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08284  RVP_2  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MADWAAWRARFVEKYSPGTLAAALELAQAYEERLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSEEEERKSKKIVLKKKKKETKVTFDPAHNLNDLAKKFEKMQLNLIQKIEKLTTQEGHISWDCPDRKDNLDNSAHAKLVKVEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRPRETNISEPKPSLNTFRLSRTTNVLVPKVVKTEITPKKKSKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVEQLQNQPVGLSWADALEVPSIRKSFFEALRKPKEKEIKLADQEYSLKTTALKCNVAVGVYTVPTIVDNGAAISIVTRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKTQPLGVIRDLPITIQGQTIPIDVEVIDAATYSLLLGNNWLMKANASYNWSDQELTLRWRGKTLTVFANCSKETKEEFSELIENTDEESVNESDTETEESEDDEKIIFKNTTIEDDDEKMMRIPYLYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.46
4 0.41
5 0.38
6 0.34
7 0.25
8 0.18
9 0.13
10 0.1
11 0.09
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.14
25 0.18
26 0.2
27 0.25
28 0.29
29 0.34
30 0.43
31 0.5
32 0.55
33 0.61
34 0.7
35 0.73
36 0.79
37 0.82
38 0.8
39 0.8
40 0.77
41 0.72
42 0.72
43 0.65
44 0.57
45 0.53
46 0.49
47 0.44
48 0.4
49 0.41
50 0.37
51 0.45
52 0.54
53 0.6
54 0.69
55 0.76
56 0.85
57 0.89
58 0.91
59 0.92
60 0.91
61 0.9
62 0.9
63 0.88
64 0.82
65 0.76
66 0.72
67 0.64
68 0.56
69 0.46
70 0.37
71 0.31
72 0.32
73 0.29
74 0.29
75 0.28
76 0.26
77 0.28
78 0.34
79 0.38
80 0.34
81 0.41
82 0.44
83 0.49
84 0.51
85 0.51
86 0.45
87 0.39
88 0.39
89 0.32
90 0.25
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.22
95 0.26
96 0.23
97 0.27
98 0.26
99 0.23
100 0.21
101 0.28
102 0.28
103 0.26
104 0.29
105 0.27
106 0.31
107 0.36
108 0.37
109 0.37
110 0.38
111 0.38
112 0.4
113 0.38
114 0.34
115 0.28
116 0.26
117 0.21
118 0.19
119 0.19
120 0.16
121 0.16
122 0.19
123 0.22
124 0.25
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.22
129 0.21
130 0.18
131 0.17
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.23
151 0.23
152 0.29
153 0.3
154 0.3
155 0.3
156 0.29
157 0.31
158 0.34
159 0.33
160 0.29
161 0.27
162 0.31
163 0.37
164 0.4
165 0.45
166 0.49
167 0.51
168 0.5
169 0.5
170 0.47
171 0.41
172 0.38
173 0.34
174 0.26
175 0.25
176 0.25
177 0.29
178 0.31
179 0.31
180 0.31
181 0.31
182 0.3
183 0.29
184 0.3
185 0.27
186 0.24
187 0.23
188 0.23
189 0.2
190 0.18
191 0.14
192 0.13
193 0.23
194 0.3
195 0.37
196 0.43
197 0.49
198 0.59
199 0.65
200 0.72
201 0.72
202 0.74
203 0.75
204 0.78
205 0.81
206 0.82
207 0.84
208 0.85
209 0.81
210 0.78
211 0.76
212 0.75
213 0.71
214 0.69
215 0.65
216 0.64
217 0.67
218 0.69
219 0.71
220 0.73
221 0.74
222 0.73
223 0.74
224 0.76
225 0.74
226 0.69
227 0.62
228 0.58
229 0.53
230 0.54
231 0.51
232 0.43
233 0.41
234 0.4
235 0.41
236 0.36
237 0.33
238 0.25
239 0.23
240 0.21
241 0.14
242 0.11
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.15
260 0.2
261 0.28
262 0.33
263 0.42
264 0.52
265 0.56
266 0.55
267 0.58
268 0.62
269 0.56
270 0.57
271 0.54
272 0.53
273 0.53
274 0.54
275 0.47
276 0.4
277 0.4
278 0.33
279 0.28
280 0.2
281 0.15
282 0.15
283 0.18
284 0.21
285 0.23
286 0.23
287 0.2
288 0.22
289 0.22
290 0.2
291 0.16
292 0.13
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.09
332 0.13
333 0.19
334 0.22
335 0.22
336 0.24
337 0.26
338 0.28
339 0.32
340 0.33
341 0.31
342 0.33
343 0.36
344 0.35
345 0.34
346 0.31
347 0.25
348 0.23
349 0.19
350 0.15
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.1
378 0.1
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.17
383 0.19
384 0.2
385 0.22
386 0.23
387 0.22
388 0.19
389 0.22
390 0.22
391 0.24
392 0.3
393 0.32
394 0.31
395 0.33
396 0.34
397 0.34
398 0.36
399 0.36
400 0.38
401 0.37
402 0.42
403 0.43
404 0.47
405 0.43
406 0.4
407 0.37
408 0.32
409 0.33
410 0.34
411 0.34
412 0.31
413 0.31
414 0.33
415 0.35
416 0.31
417 0.28
418 0.24
419 0.2
420 0.18
421 0.19
422 0.16
423 0.12
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.15
432 0.12
433 0.13
434 0.12
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.12
440 0.13
441 0.12
442 0.17
443 0.15
444 0.14
445 0.2
446 0.21
447 0.25
448 0.28
449 0.3
450 0.29
451 0.32
452 0.35
453 0.3
454 0.29
455 0.26
456 0.23
457 0.21