Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JQU4

Protein Details
Accession A0A397JQU4    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-72EEDEKLPKPKKNKSSKIPAGKTQRIRBasic
153-176NFAAKQKKFKMKFRSKKDQQQSIAHydrophilic
283-316IQSTHDSIHRKVHKRKRYKLRRVMLRIHKKIRCLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-70PKPKKNKSSKIPAGKTQR
292-312RKVHKRKRYKLRRVMLRIHKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 13.5, nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021027  Transposase_put_HTH  
Pfam View protein in Pfam  
PF12323  HTH_OrfB_IS605  
Amino Acid Sequences MGLGSWYSVRMSVLKVVKSENLRKTYSQSSRYLWQDIMECVPPPIVEEDEKLPKPKKNKSSKIPAGKTQRIRLFPTQEEKSKLKRWMGTARWTYNRCLVAVEKEGIERTKKALRAQCLNAANFNNTELQWVLETPYDIRDEAMNNLLKSYSSNFAAKQKKFKMKFRSKKDQQQSIAILSKHWDKSKGVYTFLCKMKSAKNLLAELHYDSRLVMNQLGEFYLCIPQPLEIWAKNQGPTQSDAVIALDPGVRTFITGYDPSGQAVEWGKNDISRIYRLSHIYDKIQSTHDSIHRKVHKRKRYKLRRVMLRIHKKIRCLINDCHHKLAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.3
4 0.35
5 0.42
6 0.49
7 0.5
8 0.5
9 0.51
10 0.52
11 0.55
12 0.59
13 0.59
14 0.56
15 0.53
16 0.52
17 0.56
18 0.58
19 0.55
20 0.45
21 0.39
22 0.36
23 0.32
24 0.32
25 0.26
26 0.22
27 0.19
28 0.19
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.16
35 0.21
36 0.28
37 0.31
38 0.36
39 0.39
40 0.42
41 0.5
42 0.57
43 0.62
44 0.65
45 0.73
46 0.76
47 0.82
48 0.87
49 0.89
50 0.85
51 0.84
52 0.82
53 0.81
54 0.79
55 0.76
56 0.73
57 0.66
58 0.67
59 0.65
60 0.61
61 0.58
62 0.59
63 0.56
64 0.54
65 0.56
66 0.54
67 0.54
68 0.55
69 0.56
70 0.54
71 0.52
72 0.53
73 0.57
74 0.58
75 0.6
76 0.61
77 0.61
78 0.63
79 0.6
80 0.57
81 0.53
82 0.48
83 0.39
84 0.33
85 0.28
86 0.25
87 0.26
88 0.24
89 0.18
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.16
95 0.17
96 0.21
97 0.24
98 0.3
99 0.34
100 0.38
101 0.43
102 0.45
103 0.48
104 0.48
105 0.45
106 0.42
107 0.37
108 0.33
109 0.26
110 0.24
111 0.18
112 0.14
113 0.14
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.22
142 0.31
143 0.32
144 0.38
145 0.44
146 0.52
147 0.56
148 0.63
149 0.66
150 0.68
151 0.76
152 0.77
153 0.81
154 0.79
155 0.84
156 0.84
157 0.82
158 0.72
159 0.68
160 0.6
161 0.53
162 0.49
163 0.39
164 0.3
165 0.23
166 0.26
167 0.24
168 0.23
169 0.22
170 0.19
171 0.23
172 0.31
173 0.31
174 0.28
175 0.27
176 0.3
177 0.35
178 0.38
179 0.35
180 0.28
181 0.28
182 0.31
183 0.36
184 0.37
185 0.33
186 0.33
187 0.33
188 0.33
189 0.32
190 0.28
191 0.24
192 0.22
193 0.18
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.15
215 0.13
216 0.15
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.27
221 0.27
222 0.25
223 0.27
224 0.27
225 0.21
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.13
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.15
248 0.13
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.26
262 0.28
263 0.32
264 0.35
265 0.36
266 0.37
267 0.4
268 0.4
269 0.38
270 0.38
271 0.35
272 0.31
273 0.35
274 0.37
275 0.39
276 0.39
277 0.47
278 0.53
279 0.61
280 0.69
281 0.73
282 0.76
283 0.81
284 0.89
285 0.9
286 0.92
287 0.93
288 0.93
289 0.93
290 0.94
291 0.92
292 0.92
293 0.91
294 0.91
295 0.9
296 0.9
297 0.83
298 0.78
299 0.77
300 0.75
301 0.73
302 0.68
303 0.67
304 0.68
305 0.75
306 0.74