Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HHC9

Protein Details
Accession A0A397HHC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-172SSPDLSLNNNRKNRKNRNSHNNCNNNNNSNHydrophilic
196-222NSTGRKFKYFFKKSKKNNQDYTRAKESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF07719  TPR_2  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTSLETSQHNKHNTYQGHGFYPKESGEKFYDIPYPSFHRRRYSDISDPPSSPSSHLSSQIGLLSMNSASSSSSLPGSPLSLPPINNSDGSNNSRRLSKISDVHPLNSNTARSFDYQFRSKSEVTSSSPTSSFNFKNRRHENFSSPDLSLNNNRKNRKNRNSHNNCNNNNNSNINSNIDSNFNSHINSNIDSNIDSNSTGRKFKYFFKKSKKNNQDYTRAKESLLSQQYLESISFFTKVLDKYPYSYSVRCDRAYAYYQTEKWNFALQDLKVAITRRPSKPVAYALRGEICRLIKMYDSSMSDLSKSIKLQPSAFALRARAEVHCTLSRYSDAIDDLNFALRIEPKNSFTLIRRAKVYVNLRLYSDAISDLDTVCKNDPENVSSTLANRGEIYRIIGKFDMALADLNEALEKEENNTLALERRATLFRQLNQIQDAIKDFDKILEINPKNLFALRNRGEVCQQLGNFKESLSNYNTAIELEPDNLILLRHRGEVHRLLGKPNLALKDLDLALEISPDDPCLLRGRGEVFRLLKYFKEALDDFNKALKLEPGNEFALTSRGEIYRVLKEGQKSLTDLNEAIRINPDNVFARESRGALNRSFRRYEESLRDLDKVLQLKPNSVFALSNRGSVYHMLKRYSEALIDLNLALEIEPKNVSALSTRGAIYHILSKQGKALKDLNSALELEPENNWALCYRGEVFYELNRLDSALADLNRVLAVQPNWCYPLSLRGSVFRTMGCWSDALTDLDLALENVRDKAYYIGYETQALINRGSVYRVMNRHEEALTDLNKGLLREPGNLLALCERSAVYFAMKNYEAAIRDLDDVLKIQPKYATAIKQKENYITAMQESGQLTGILMRQSIIRKVLENPEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.5
4 0.52
5 0.53
6 0.48
7 0.4
8 0.42
9 0.36
10 0.35
11 0.32
12 0.3
13 0.31
14 0.34
15 0.34
16 0.33
17 0.37
18 0.35
19 0.35
20 0.35
21 0.38
22 0.44
23 0.51
24 0.53
25 0.56
26 0.58
27 0.64
28 0.68
29 0.68
30 0.68
31 0.69
32 0.71
33 0.66
34 0.63
35 0.59
36 0.53
37 0.46
38 0.39
39 0.34
40 0.32
41 0.3
42 0.33
43 0.31
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.24
48 0.18
49 0.15
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.2
67 0.22
68 0.22
69 0.25
70 0.28
71 0.28
72 0.28
73 0.27
74 0.25
75 0.28
76 0.34
77 0.37
78 0.37
79 0.36
80 0.39
81 0.39
82 0.4
83 0.4
84 0.41
85 0.42
86 0.42
87 0.5
88 0.49
89 0.51
90 0.53
91 0.49
92 0.46
93 0.42
94 0.4
95 0.32
96 0.31
97 0.31
98 0.27
99 0.29
100 0.31
101 0.33
102 0.38
103 0.39
104 0.41
105 0.44
106 0.42
107 0.41
108 0.39
109 0.38
110 0.36
111 0.4
112 0.38
113 0.36
114 0.36
115 0.35
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.37
120 0.44
121 0.47
122 0.58
123 0.65
124 0.71
125 0.73
126 0.74
127 0.72
128 0.69
129 0.68
130 0.6
131 0.52
132 0.46
133 0.38
134 0.37
135 0.39
136 0.42
137 0.45
138 0.5
139 0.56
140 0.63
141 0.73
142 0.8
143 0.81
144 0.83
145 0.85
146 0.88
147 0.91
148 0.93
149 0.93
150 0.92
151 0.86
152 0.84
153 0.8
154 0.73
155 0.67
156 0.59
157 0.51
158 0.44
159 0.41
160 0.34
161 0.29
162 0.27
163 0.23
164 0.22
165 0.21
166 0.2
167 0.21
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.16
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.25
188 0.27
189 0.35
190 0.46
191 0.49
192 0.57
193 0.64
194 0.74
195 0.79
196 0.88
197 0.9
198 0.89
199 0.89
200 0.87
201 0.87
202 0.84
203 0.82
204 0.78
205 0.68
206 0.58
207 0.51
208 0.46
209 0.45
210 0.42
211 0.35
212 0.27
213 0.27
214 0.28
215 0.25
216 0.22
217 0.13
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.24
230 0.29
231 0.29
232 0.3
233 0.32
234 0.35
235 0.39
236 0.36
237 0.35
238 0.31
239 0.32
240 0.35
241 0.33
242 0.31
243 0.32
244 0.33
245 0.38
246 0.39
247 0.36
248 0.33
249 0.35
250 0.29
251 0.25
252 0.29
253 0.22
254 0.25
255 0.24
256 0.23
257 0.2
258 0.22
259 0.22
260 0.25
261 0.32
262 0.3
263 0.35
264 0.37
265 0.37
266 0.4
267 0.46
268 0.44
269 0.41
270 0.4
271 0.36
272 0.39
273 0.37
274 0.33
275 0.29
276 0.23
277 0.2
278 0.19
279 0.17
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.19
294 0.23
295 0.25
296 0.25
297 0.26
298 0.29
299 0.29
300 0.3
301 0.25
302 0.22
303 0.21
304 0.22
305 0.21
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.17
316 0.16
317 0.13
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.12
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.28
337 0.3
338 0.31
339 0.3
340 0.3
341 0.31
342 0.36
343 0.39
344 0.37
345 0.37
346 0.35
347 0.34
348 0.33
349 0.33
350 0.25
351 0.21
352 0.13
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.17
368 0.19
369 0.18
370 0.19
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.15
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.18
412 0.19
413 0.2
414 0.27
415 0.29
416 0.28
417 0.28
418 0.29
419 0.22
420 0.19
421 0.19
422 0.13
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.17
431 0.17
432 0.21
433 0.21
434 0.21
435 0.21
436 0.22
437 0.22
438 0.14
439 0.23
440 0.21
441 0.25
442 0.26
443 0.27
444 0.27
445 0.27
446 0.27
447 0.21
448 0.19
449 0.17
450 0.17
451 0.18
452 0.17
453 0.15
454 0.17
455 0.14
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.16
460 0.16
461 0.16
462 0.14
463 0.13
464 0.11
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.14
479 0.17
480 0.2
481 0.24
482 0.24
483 0.25
484 0.26
485 0.26
486 0.23
487 0.24
488 0.22
489 0.17
490 0.16
491 0.15
492 0.16
493 0.15
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.06
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.11
510 0.15
511 0.17
512 0.18
513 0.22
514 0.2
515 0.22
516 0.23
517 0.23
518 0.19
519 0.21
520 0.21
521 0.16
522 0.2
523 0.18
524 0.21
525 0.24
526 0.26
527 0.22
528 0.24
529 0.24
530 0.19
531 0.19
532 0.18
533 0.15
534 0.17
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.19
540 0.16
541 0.17
542 0.14
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.12
548 0.14
549 0.15
550 0.17
551 0.18
552 0.19
553 0.2
554 0.23
555 0.24
556 0.22
557 0.2
558 0.2
559 0.2
560 0.19
561 0.17
562 0.15
563 0.18
564 0.17
565 0.15
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.17
571 0.15
572 0.16
573 0.18
574 0.16
575 0.19
576 0.19
577 0.2
578 0.2
579 0.23
580 0.24
581 0.25
582 0.34
583 0.35
584 0.39
585 0.4
586 0.38
587 0.4
588 0.41
589 0.45
590 0.43
591 0.41
592 0.4
593 0.4
594 0.4
595 0.34
596 0.33
597 0.31
598 0.25
599 0.23
600 0.26
601 0.24
602 0.27
603 0.27
604 0.28
605 0.25
606 0.23
607 0.22
608 0.17
609 0.26
610 0.22
611 0.23
612 0.2
613 0.2
614 0.2
615 0.22
616 0.27
617 0.24
618 0.27
619 0.26
620 0.27
621 0.28
622 0.3
623 0.28
624 0.23
625 0.18
626 0.15
627 0.14
628 0.14
629 0.12
630 0.1
631 0.08
632 0.08
633 0.06
634 0.08
635 0.07
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.09
641 0.1
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.18
652 0.17
653 0.23
654 0.23
655 0.23
656 0.28
657 0.32
658 0.31
659 0.29
660 0.34
661 0.31
662 0.36
663 0.37
664 0.33
665 0.3
666 0.3
667 0.26
668 0.24
669 0.2
670 0.15
671 0.14
672 0.14
673 0.14
674 0.12
675 0.12
676 0.09
677 0.1
678 0.1
679 0.12
680 0.13
681 0.13
682 0.15
683 0.16
684 0.17
685 0.18
686 0.24
687 0.21
688 0.19
689 0.18
690 0.17
691 0.15
692 0.14
693 0.14
694 0.13
695 0.13
696 0.13
697 0.13
698 0.13
699 0.13
700 0.13
701 0.11
702 0.11
703 0.12
704 0.15
705 0.18
706 0.19
707 0.22
708 0.22
709 0.23
710 0.19
711 0.27
712 0.27
713 0.3
714 0.29
715 0.32
716 0.35
717 0.36
718 0.36
719 0.27
720 0.24
721 0.22
722 0.22
723 0.17
724 0.14
725 0.12
726 0.14
727 0.16
728 0.16
729 0.15
730 0.13
731 0.12
732 0.12
733 0.12
734 0.09
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.09
739 0.09
740 0.09
741 0.1
742 0.12
743 0.13
744 0.13
745 0.16
746 0.2
747 0.21
748 0.23
749 0.23
750 0.23
751 0.25
752 0.26
753 0.22
754 0.19
755 0.2
756 0.19
757 0.19
758 0.19
759 0.19
760 0.25
761 0.29
762 0.32
763 0.35
764 0.37
765 0.38
766 0.36
767 0.33
768 0.3
769 0.32
770 0.29
771 0.25
772 0.24
773 0.23
774 0.24
775 0.24
776 0.21
777 0.21
778 0.21
779 0.22
780 0.25
781 0.26
782 0.28
783 0.27
784 0.27
785 0.24
786 0.24
787 0.21
788 0.19
789 0.16
790 0.13
791 0.15
792 0.14
793 0.13
794 0.16
795 0.16
796 0.22
797 0.22
798 0.22
799 0.22
800 0.25
801 0.24
802 0.22
803 0.23
804 0.18
805 0.19
806 0.2
807 0.19
808 0.15
809 0.15
810 0.17
811 0.22
812 0.2
813 0.21
814 0.22
815 0.22
816 0.27
817 0.32
818 0.38
819 0.41
820 0.5
821 0.55
822 0.59
823 0.62
824 0.62
825 0.58
826 0.53
827 0.47
828 0.4
829 0.35
830 0.3
831 0.26
832 0.26
833 0.24
834 0.21
835 0.18
836 0.16
837 0.14
838 0.15
839 0.18
840 0.13
841 0.13
842 0.12
843 0.16
844 0.2
845 0.24
846 0.26
847 0.25
848 0.27
849 0.33