Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GB48

Protein Details
Accession A0A397GB48    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-54SIGTHKKTPFQKHKEELELKKKQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-152KSKRK
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR035009  SR140_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12223  RRM_SR140  
Amino Acid Sequences MPDEKKLPWGINSTKPGSAKTLTKTKLQAFSIGTHKKTPFQKHKEELELKKKQESEEAAKVYAEFVASFEKEDGAGKTFVKGETIVPKLLFDHEAINTKKEVQPSTPPKIYKPQLFVPASKPIQQEVEADNIDQIDENDEEEEKREEKSKRKRNLDAFLEEIKREQEEREDRLRQKHAKLAGAGVSSETGVSDEFVPTSLTVKAAFEDRPGSHDTGDPNTTNLYVGNISPEVNEEMLCKEFAKYGPIASVKIMWPRTQEEKDRNRNCGFVSFMDRECAALALKNMDGKELLGYVMRVGWGKAVPIPPQPIYVLNESGRPPPSGLPFNAQMVHSSTYINVPSPWFFLLQMDPKVLALKFKLCVPKINK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.48
4 0.45
5 0.44
6 0.41
7 0.41
8 0.47
9 0.44
10 0.49
11 0.54
12 0.56
13 0.59
14 0.54
15 0.53
16 0.45
17 0.48
18 0.51
19 0.52
20 0.47
21 0.47
22 0.47
23 0.49
24 0.55
25 0.61
26 0.62
27 0.64
28 0.72
29 0.73
30 0.79
31 0.82
32 0.83
33 0.82
34 0.81
35 0.81
36 0.74
37 0.73
38 0.68
39 0.59
40 0.56
41 0.53
42 0.5
43 0.5
44 0.49
45 0.43
46 0.41
47 0.39
48 0.32
49 0.25
50 0.18
51 0.09
52 0.08
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.16
70 0.21
71 0.23
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.23
77 0.21
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.22
82 0.23
83 0.24
84 0.23
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.27
89 0.24
90 0.33
91 0.39
92 0.47
93 0.49
94 0.48
95 0.47
96 0.55
97 0.57
98 0.53
99 0.5
100 0.47
101 0.5
102 0.51
103 0.5
104 0.45
105 0.47
106 0.43
107 0.43
108 0.39
109 0.31
110 0.3
111 0.29
112 0.28
113 0.21
114 0.23
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.17
133 0.22
134 0.31
135 0.42
136 0.51
137 0.58
138 0.66
139 0.74
140 0.75
141 0.78
142 0.74
143 0.66
144 0.6
145 0.55
146 0.48
147 0.4
148 0.33
149 0.24
150 0.2
151 0.17
152 0.14
153 0.16
154 0.19
155 0.24
156 0.3
157 0.37
158 0.39
159 0.45
160 0.52
161 0.5
162 0.48
163 0.48
164 0.45
165 0.4
166 0.37
167 0.32
168 0.27
169 0.22
170 0.19
171 0.14
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.12
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.15
236 0.17
237 0.16
238 0.22
239 0.23
240 0.2
241 0.22
242 0.26
243 0.33
244 0.36
245 0.42
246 0.46
247 0.55
248 0.64
249 0.66
250 0.69
251 0.63
252 0.6
253 0.54
254 0.47
255 0.39
256 0.31
257 0.32
258 0.28
259 0.27
260 0.27
261 0.26
262 0.22
263 0.2
264 0.18
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.14
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.14
289 0.17
290 0.19
291 0.23
292 0.28
293 0.27
294 0.28
295 0.29
296 0.28
297 0.29
298 0.29
299 0.29
300 0.25
301 0.28
302 0.28
303 0.32
304 0.3
305 0.28
306 0.26
307 0.26
308 0.31
309 0.32
310 0.33
311 0.33
312 0.34
313 0.35
314 0.36
315 0.32
316 0.28
317 0.26
318 0.26
319 0.22
320 0.19
321 0.17
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.2
329 0.2
330 0.18
331 0.17
332 0.18
333 0.23
334 0.27
335 0.28
336 0.27
337 0.27
338 0.26
339 0.3
340 0.28
341 0.26
342 0.23
343 0.25
344 0.25
345 0.31
346 0.4
347 0.37